ChiCMaxima: a robust and simple pipeline for detection and visualization of chromatin looping in Capture Hi-C.

Ben Zouari, Yousra; Molitor, Anne M; Sikorska, Natalia; Pancaldi, Vera; Sexton, Tom

Ben Zouari, Yousra; Molitor, Anne M; Sikorska, Natalia; Pancaldi, Vera; Sexton, Tom.

Afiliação

Ben Zouari Y; Institute of Genetics and Molecular and Cellular Biology (IGBMC), Illkirch, France.
Molitor AM; CNRS UMR7104, Illkirch, France.
Sikorska N; INSERM U1258, Illkirch, France.
Pancaldi V; University of Strasbourg, Illkirch, France.
Sexton T; Institute of Genetics and Molecular and Cellular Biology (IGBMC), Illkirch, France.

Genome Biol ; 20(1): 102, 2019 05 22.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-31118054

Assuntos

Cromatina; Técnicas Genéticas; Genômica/métodos; Software

Palavras-chave

Biological replicates; Capture Hi-C; Chromatin assortativity; Chromatin loops; Gene regulation; Promoter-enhancer interactions

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Software / Cromatina / Técnicas Genéticas / Genômica Tipo de estudo: Diagnostic_studies / Evaluation_studies Idioma: En Revista: Genome Biol Assunto da revista: BIOLOGIA MOLECULAR / GENETICA Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article País de afiliação: França País de publicação: Reino Unido

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