A multivariate Poisson-log normal mixture model for clustering transcriptome sequencing data.

Silva, Anjali; Rothstein, Steven J; McNicholas, Paul D; Subedi, Sanjeena

Silva, Anjali; Rothstein, Steven J; McNicholas, Paul D; Subedi, Sanjeena.

Afiliação

Silva A; Department of Mathematics and Statistics, University of Guelph, Guelph, N1G 2W1, Canada.
Rothstein SJ; Department of Molecular and Cellular Biology, University of Guelph, Guelph, N1G 2W1, Ontario, Canada.
McNicholas PD; Department of Molecular and Cellular Biology, University of Guelph, Guelph, N1G 2W1, Ontario, Canada.
Subedi S; Department of Mathematics and Statistics, McMaster University, Hamilton, L8S 4K1, Ontario, Canada.

BMC Bioinformatics ; 20(1): 394, 2019 Jul 16.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-31311497

Assuntos

Algoritmos; RNA/química; Análise por Conglomerados; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala; Cadeias de Markov; Modelos Teóricos; Método de Monte Carlo; RNA/genética; RNA/metabolismo; Análise de Sequência de RNA; Interface Usuário-Computador

Palavras-chave

Clustering; Co-expression networks; Discrete data; Markov chain Monte Carlo; Multivariate Poisson-log normal distribution; RNA sequencing

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Algoritmos / RNA Tipo de estudo: Health_economic_evaluation / Prognostic_studies Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Assunto da revista: INFORMATICA MEDICA Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article País de afiliação: Canadá País de publicação: Reino Unido

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