Metagenomics for broad and improved parasite detection: a proof-of-concept study using swine faecal samples.

Wylezich, Claudia; Belka, Ariane; Hanke, Dennis; Beer, Martin; Blome, Sandra; Höper, Dirk

Wylezich, Claudia; Belka, Ariane; Hanke, Dennis; Beer, Martin; Blome, Sandra; Höper, Dirk.

Afiliação

Wylezich C; Institute of Diagnostic Virology, Friedrich-Loeffler-Institut (FLI), Südufer 10, 17493 Greifswald-Insel Riems, Germany. Electronic address: Claudia.Wylezich@fli.de.
Belka A; Institute of Diagnostic Virology, Friedrich-Loeffler-Institut (FLI), Südufer 10, 17493 Greifswald-Insel Riems, Germany.
Hanke D; Institute of Diagnostic Virology, Friedrich-Loeffler-Institut (FLI), Südufer 10, 17493 Greifswald-Insel Riems, Germany.
Beer M; Institute of Diagnostic Virology, Friedrich-Loeffler-Institut (FLI), Südufer 10, 17493 Greifswald-Insel Riems, Germany.
Blome S; Institute of Diagnostic Virology, Friedrich-Loeffler-Institut (FLI), Südufer 10, 17493 Greifswald-Insel Riems, Germany.
Höper D; Institute of Diagnostic Virology, Friedrich-Loeffler-Institut (FLI), Südufer 10, 17493 Greifswald-Insel Riems, Germany. Electronic address: Dirk.Hoeper@fli.de.

Int J Parasitol ; 49(10): 769-777, 2019 09.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-31361998

Assuntos

Fezes/parasitologia; Enteropatias Parasitárias/parasitologia; Metagenômica; RNA Ribossômico 18S/genética; Doenças dos Suínos/parasitologia; Animais; Blastocystis hominis/genética; Blastocystis hominis/isolamento & purificação; Biologia Computacional; Infecções por Coronavirus/veterinária; Infecções por Coronavirus/virologia; DNA Ribossômico/química; Conjuntos de Dados como Assunto; Entamoeba/classificação; Entamoeba/genética; Entamoeba/isolamento & purificação; Entamoeba histolytica/genética; Entamoeba histolytica/isolamento & purificação; Enteropatias Parasitárias/diagnóstico; Filogenia; Vírus da Diarreia Epidêmica Suína/genética; RNA Ribossômico 18S/química; Valores de Referência; Suínos; Doenças dos Suínos/diagnóstico; Doenças dos Suínos/virologia; Trichomonadida/classificação; Trichomonadida/genética; Trichomonadida/isolamento & purificação

Palavras-chave

False-positives; Intestinal protists; Parasite detection; Pig faeces; RIEMS; Shotgun metagenomics; Subtyping; Taxonomic assignment

Texto completo

Adicionar na Minha BVS

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar no Google

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Doenças dos Suínos / RNA Ribossômico 18S / Fezes / Metagenômica / Enteropatias Parasitárias Tipo de estudo: Diagnostic_studies / Prognostic_studies Limite: Animals Idioma: En Revista: Int J Parasitol Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article País de publicação: Reino Unido

Texto completo

Adicionar na Minha BVS

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar no Google