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Application of the 3D-RISM-KH molecular solvation theory for DMSO as solvent.
Roy, Dipankar; Kovalenko, Andriy.
Afiliação
  • Roy D; Department of Mechanical Engineering, 10-203 Donadeo Innovation Centre for Engineering, University of Alberta, 9211-116 Street NW, Edmonton, AB, T6G 1H9, Canada.
  • Kovalenko A; Department of Mechanical Engineering, 10-203 Donadeo Innovation Centre for Engineering, University of Alberta, 9211-116 Street NW, Edmonton, AB, T6G 1H9, Canada. andriy.kovalenko@ualberta.ca.
J Comput Aided Mol Des ; 33(10): 905-912, 2019 10.
Article em En | MEDLINE | ID: mdl-31637566
ABSTRACT
The molecular solvation theory in the form of the Three-Dimensional Reference Interaction Site Model (3D-RISM) with Kovalenko-Hirata (KH) closure relation is benchmarked for use with dimethyl sulfoxide (DMSO) as solvent for (bio)-chemical simulation within the framework of integral equation formalism. Several force field parameters have been tested to correctly reproduce solvation free energy in DMSO, ion solvation in DMSO, and DMSO coordination prediction. Our findings establish a united atom (UA) type parameterization as the best model of DMSO for use in 3D-RISM-KH theory based calculations.
Assuntos
Palavras-chave

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Solventes / Algoritmos / Computação Matemática / Dimetil Sulfóxido / Simulação de Dinâmica Molecular / Modelos Teóricos Tipo de estudo: Prognostic_studies Idioma: En Revista: J Comput Aided Mol Des Assunto da revista: BIOLOGIA MOLECULAR / ENGENHARIA BIOMEDICA Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article País de afiliação: Canadá

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Solventes / Algoritmos / Computação Matemática / Dimetil Sulfóxido / Simulação de Dinâmica Molecular / Modelos Teóricos Tipo de estudo: Prognostic_studies Idioma: En Revista: J Comput Aided Mol Des Assunto da revista: BIOLOGIA MOLECULAR / ENGENHARIA BIOMEDICA Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article País de afiliação: Canadá