A deep learning ensemble for function prediction of hypothetical proteins from pathogenic bacterial species.

Mishra, Sarthak; Rastogi, Yash Pratap; Jabin, Suraiya; Kaur, Punit; Amir, Mohammad; Khatun, Shabnam

Mishra, Sarthak; Rastogi, Yash Pratap; Jabin, Suraiya; Kaur, Punit; Amir, Mohammad; Khatun, Shabnam.

Afiliação

Mishra S; Department of Computer Science, Jamia Millia Islamia, Jamia Nagar, New Delhi, 110025, Delhi, India.
Rastogi YP; Department of Computer Science, Jamia Millia Islamia, Jamia Nagar, New Delhi, 110025, Delhi, India.
Jabin S; Department of Computer Science, Jamia Millia Islamia, Jamia Nagar, New Delhi, 110025, Delhi, India. Electronic address: sjabin@jmi.ac.in.
Kaur P; Department of Biophysics, All India Institute of Medical Sciences (AIIMS), New Delhi, 110 029, Delhi, India.
Amir M; Department of Computer Science, Jamia Millia Islamia, Jamia Nagar, New Delhi, 110025, Delhi, India.
Khatun S; Department of Computer Science, Jamia Millia Islamia, Jamia Nagar, New Delhi, 110025, Delhi, India.

Comput Biol Chem ; 83: 107147, 2019 Dec.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-31698160

Assuntos

Bactérias/química; Proteínas de Bactérias/metabolismo; Aprendizado Profundo; Redes Neurais de Computação; Bactérias/metabolismo; Proteínas de Bactérias/química

Palavras-chave

Annotation based feature; Deep learning; Deep neural network; Function prediction; Hypothetical proteins; LeakyRelu; Molecular function; Motif; Nadam; Physicochemical feature; Reviewed protein; Sequence based feature

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Bactérias / Proteínas de Bactérias / Redes Neurais de Computação / Aprendizado Profundo Tipo de estudo: Prognostic_studies / Risk_factors_studies Idioma: En Revista: Comput Biol Chem Assunto da revista: BIOLOGIA / INFORMATICA MEDICA / QUIMICA Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article País de afiliação: Índia País de publicação: Reino Unido

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