Impact of mouse contamination in genomic profiling of patient-derived models and best practice for robust analysis.

Jo, Se-Young; Kim, Eunyoung; Kim, Sangwoo

Jo, Se-Young; Kim, Eunyoung; Kim, Sangwoo.

Afiliação

Jo SY; Department of Biomedical Systems Informatics and Brain Korea 21 PLUS Project for Medical Science, Yonsei University College of Medicine, Seoul, 03722, South Korea.
Kim E; Department of Biomedical Systems Informatics and Brain Korea 21 PLUS Project for Medical Science, Yonsei University College of Medicine, Seoul, 03722, South Korea.
Kim S; Department of Biomedical Systems Informatics and Brain Korea 21 PLUS Project for Medical Science, Yonsei University College of Medicine, Seoul, 03722, South Korea. swkim@yuhs.ac.

Genome Biol ; 20(1): 231, 2019 11 11.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-31707992

Assuntos

Contaminação por DNA; Genoma Humano; Genômica/normas; Alelos; Animais; Humanos; Camundongos; Guias de Prática Clínica como Assunto

Palavras-chave

Benchmark; Best practice; Genomic analysis; Mouse contamination; Patient-derived model; Read filtering

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Genoma Humano / Genômica / Contaminação por DNA Tipo de estudo: Evaluation_studies / Guideline / Prognostic_studies Limite: Animals / Humans Idioma: En Revista: Genome Biol Assunto da revista: BIOLOGIA MOLECULAR / GENETICA Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article País de afiliação: Coréia do Sul País de publicação: Reino Unido

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