DL-CNV: A deep learning method for identifying copy number variations based on next generation target sequencing.

Zhang, Yun Xiang; Jin, Lv Cheng; Wang, Bo; Hu, De Hong; Wang, Le Qiang; Li, Pan; Zhang, Jun Ling; Han, Kai; Tian, Geng; Yuan, Da Wei; Yang, Jia Liang; Tan, Wei; Xing, Xiao Ming; Lang, Ji Dong

Zhang, Yun Xiang; Jin, Lv Cheng; Wang, Bo; Hu, De Hong; Wang, Le Qiang; Li, Pan; Zhang, Jun Ling; Han, Kai; Tian, Geng; Yuan, Da Wei; Yang, Jia Liang; Tan, Wei; Xing, Xiao Ming; Lang, Ji Dong.

Afiliação

Zhang YX; Weifang People's Hospital, Guang Wen Road, Weifang 261000, China.
Jin LC; Weifang Medical University, Bao Tong West Street, Weifang 261053, China.
Wang B; Geneis Beijing Limited Company, Beijing 100102, China.
Hu H; Weifang People's Hospital, Guang Wen Road, Weifang 261000, China.
Wang LQ; Weifang People's Hospital, Guang Wen Road, Weifang 261000, China.
Li P; Geneis Beijing Limited Company, Beijing 100102, China.
Zhang JL; Geneis Beijing Limited Company, Beijing 100102, China.
Han K; Geneis Beijing Limited Company, Beijing 100102, China.
Tian G; Geneis Beijing Limited Company, Beijing 100102, China.
Yuan DW; Geneis Beijing Limited Company, Beijing 100102, China.
Yang JL; Geneis Beijing Limited Company, Beijing 100102, China.
Tan W; Weifang People's Hospital, Guang Wen Road, Weifang 261000, China.
Xing XM; The Affiliated Hospital of Qingdao University, Jiang Su Road, Qingdao 266071, China.
Lang JD; The Affiliated Hospital of Qingdao University, Jiang Su Road, Qingdao 266071, China.

Math Biosci Eng ; 17(1): 202-215, 2019 09 30.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-31731347

Assuntos

Carcinoma Pulmonar de Células não Pequenas/genética; Variações do Número de Cópias de DNA; Aprendizado Profundo; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos; Neoplasias Pulmonares/genética; Algoritmos; Área Sob a Curva; Bases de Dados Factuais; Éxons; Reações Falso-Positivas; Genoma Humano; Estudo de Associação Genômica Ampla; Humanos; Hibridização in Situ Fluorescente; Proteínas Proto-Oncogênicas c-met/genética; Curva ROC; Receptor ErbB-2/genética; Reprodutibilidade dos Testes; Sensibilidade e Especificidade

Palavras-chave

convolutional neural network; copy number variation; deep learning; next generation sequencing; target sequencing

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Carcinoma Pulmonar de Células não Pequenas / Variações do Número de Cópias de DNA / Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala / Aprendizado Profundo / Neoplasias Pulmonares Tipo de estudo: Diagnostic_studies / Prognostic_studies / Risk_factors_studies Limite: Humans Idioma: En Revista: Math Biosci Eng Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article País de afiliação: China País de publicação: Estados Unidos

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