Better quality score compression through sequence-based quality smoothing.

Shibuya, Yoshihiro; Comin, Matteo

Shibuya, Yoshihiro; Comin, Matteo.

Afiliação

Shibuya Y; Department of Information Engineering, University of Padova, via Gradenigo 6/A, Padova, Italy.
Comin M; Laboratoire d'Informatique Gaspard-Monge (LIGM), University Paris-Est Marne-la-Vallée, Bâtiment Copernic - 5, bd Descartes, Champs sur Marne, France.

BMC Bioinformatics ; 20(Suppl 9): 302, 2019 Nov 22.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-31757199

Assuntos

Compressão de Dados/normas; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos; Algoritmos; Sequência de Bases; Humanos; Polimorfismo de Nucleotídeo Único/genética; Controle de Qualidade; Curva ROC; Software

Palavras-chave

BWT; FASTQ compression; FM-Index

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Compressão de Dados / Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala Tipo de estudo: Prognostic_studies Limite: Humans Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Assunto da revista: INFORMATICA MEDICA Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article País de afiliação: Itália País de publicação: Reino Unido

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