Machine learning workflows to estimate class probabilities for precision cancer diagnostics on DNA methylation microarray data.

Maros, Máté E; Capper, David; Jones, David T W; Hovestadt, Volker; von Deimling, Andreas; Pfister, Stefan M; Benner, Axel; Zucknick, Manuela; Sill, Martin

Maros, Máté E; Capper, David; Jones, David T W; Hovestadt, Volker; von Deimling, Andreas; Pfister, Stefan M; Benner, Axel; Zucknick, Manuela; Sill, Martin.

Afiliação

Maros ME; Institute of Medical Biometry and Informatics (IMBI), University of Heidelberg, Heidelberg, Germany.
Capper D; Department of Neuroradiology, University Medical Center, Medical Faculty Mannheim of Heidelberg University, Mannheim, Germany.
Jones DTW; German Cancer Consortium (DKTK), German Cancer Research Center (DKFZ), partner site Berlin, Berlin, Germany.
Hovestadt V; Charité-Universitätsmedizin Berlin, corporate member of Freie Universität Berlin, Humboldt-Universität zu Berlin, and Berlin Institute of Health, Department of Neuropathology, Berlin, Germany.
von Deimling A; Hopp Children's Cancer Center Heidelberg (KiTZ), Heidelberg, Germany.
Pfister SM; Pediatric Glioma Research Group, German Cancer Consortium (DKTK) and German Cancer Research Center (DKFZ), Heidelberg, Germany.
Benner A; Division of Molecular Genetics, German Cancer Research Center (DKFZ), Heidelberg, Germany.
Zucknick M; Department of Pathology and Center for Cancer Research, Massachusetts General Hospital and Harvard Medical School, Boston, MA, USA.
Sill M; Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, MA, USA.

Nat Protoc ; 15(2): 479-512, 2020 02.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-31932775

Assuntos

Neoplasias Encefálicas/diagnóstico; Neoplasias Encefálicas/genética; Metilação de DNA; Aprendizado de Máquina; Análise de Sequência com Séries de Oligonucleotídeos/métodos; Medicina de Precisão; Fluxo de Trabalho; Humanos; Probabilidade

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Neoplasias Encefálicas / Metilação de DNA / Análise de Sequência com Séries de Oligonucleotídeos / Medicina de Precisão / Fluxo de Trabalho / Aprendizado de Máquina Tipo de estudo: Diagnostic_studies / Guideline / Prognostic_studies Limite: Humans Idioma: En Revista: Nat Protoc Ano de publicação: 2020 Tipo de documento: Article País de afiliação: Alemanha País de publicação: Reino Unido

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