HIFI: estimating DNA-DNA interaction frequency from Hi-C data at restriction-fragment resolution.

Cameron, Christopher Jf; Dostie, Josée; Blanchette, Mathieu

Cameron, Christopher Jf; Dostie, Josée; Blanchette, Mathieu.

Afiliação

Cameron CJ; School of Computer Science, McGill University, Montreal, Canada.
Dostie J; Department of Biochemistry and Goodman Cancer Research Center, McGill University, Montreal, Canada.
Blanchette M; Department of Biochemistry and Goodman Cancer Research Center, McGill University, Montreal, Canada. josee.dostie@mcgill.ca.

Genome Biol ; 21(1): 11, 2020 01 14.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-31937349

Assuntos

Algoritmos; Cromossomos; DNA/metabolismo; Genoma; Mapeamento por Restrição; Animais; Humanos; Camundongos

Palavras-chave

5C; ChIA-PET; Chromosome conformation capture; Density estimation; Hi-C; Markov random field; Topologically associating domains; subTADs

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Algoritmos / DNA / Mapeamento por Restrição / Cromossomos / Genoma Limite: Animals / Humans Idioma: En Revista: Genome Biol Assunto da revista: BIOLOGIA MOLECULAR / GENETICA Ano de publicação: 2020 Tipo de documento: Article País de afiliação: Canadá País de publicação: Reino Unido

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