Integrated Metabolomic and Transcriptomic Analysis to Characterize Cutin Biosynthesis between Low- and High-Cutin Genotypes of <i>Capsicum chinense</i> Jacq.

Natarajan, Purushothaman; Akinmoju, Tolulope Abodunrin; Nimmakayala, Padma; Lopez-Ortiz, Carlos; Garcia-Lozano, Marleny; Thompson, Benjamin J; Stommel, John; Reddy, Umesh K

Integrated Metabolomic and Transcriptomic Analysis to Characterize Cutin Biosynthesis between Low- and High-Cutin Genotypes of Capsicum chinense Jacq.

Natarajan, Purushothaman; Akinmoju, Tolulope Abodunrin; Nimmakayala, Padma; Lopez-Ortiz, Carlos; Garcia-Lozano, Marleny; Thompson, Benjamin J; Stommel, John; Reddy, Umesh K.

Afiliação

Natarajan P; Department of Biology and Gus R. Douglass Institute, West Virginia State University, Institute, WV 25112, USA.
Akinmoju TA; Department of Genetic Engineering, SRM Institute of Science and Technology, Chennai 603203, TN, India.
Nimmakayala P; Department of Biology and Gus R. Douglass Institute, West Virginia State University, Institute, WV 25112, USA.
Lopez-Ortiz C; Department of Biology and Gus R. Douglass Institute, West Virginia State University, Institute, WV 25112, USA.
Garcia-Lozano M; Department of Biology and Gus R. Douglass Institute, West Virginia State University, Institute, WV 25112, USA.
Thompson BJ; Department of Biology and Gus R. Douglass Institute, West Virginia State University, Institute, WV 25112, USA.
Stommel J; Department of Biology and Gus R. Douglass Institute, West Virginia State University, Institute, WV 25112, USA.
Reddy UK; Genetic Improvement of Fruits and Vegetables Laboratory, U.S. Department of Agriculture, Agricultural Research Service, Beltsville Agricultural Research Center, Beltsville, MD 20705-2325, USA.

Int J Mol Sci ; 21(4)2020 Feb 19.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-32092953

Assuntos

Capsicum/genética; Frutas/metabolismo; Lipídeos de Membrana/biossíntese; Metabolômica/métodos; Transcriptoma/genética; Vias Biossintéticas/genética; Vias Biossintéticas/fisiologia; Capsicum/química; Capsicum/metabolismo; Hidrolases de Éster Carboxílico/metabolismo; Sistema Enzimático do Citocromo P-450/metabolismo; Regulação para Baixo; Frutas/genética; Cromatografia Gasosa-Espectrometria de Massas; Regulação da Expressão Gênica de Plantas/genética; Regulação da Expressão Gênica de Plantas/fisiologia; Ontologia Genética; Genótipo; Glicerol-3-Fosfato O-Aciltransferase/metabolismo; Proteínas de Homeodomínio/metabolismo; Lipídeos de Membrana/análise; Lipídeos de Membrana/química; Ácidos Palmíticos/metabolismo; Fenótipo; RNA-Seq; Fatores de Transcrição/metabolismo; Transcriptoma/fisiologia; Regulação para Cima

Palavras-chave

Capsicum chinense; GDSL lipase; GPAT6; RNA-Seq; cutin; fruit; habaneros

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Capsicum / Metabolômica / Transcriptoma / Frutas / Lipídeos de Membrana Tipo de estudo: Prognostic_studies Idioma: En Revista: Int J Mol Sci Ano de publicação: 2020 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos País de publicação: Suíça

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