CRISPRpred(SEQ): a sequence-based method for sgRNA on target activity prediction using traditional machine learning.

Muhammad Rafid, Ali Haisam; Toufikuzzaman, Md; Rahman, Mohammad Saifur; Rahman, M Sohel

Muhammad Rafid, Ali Haisam; Toufikuzzaman, Md; Rahman, Mohammad Saifur; Rahman, M Sohel.

Afiliação

Muhammad Rafid AH; Department of Computer Science and Engineering, Bangladesh University of Engineering and Technology, Dhaka, Bangladesh.
Toufikuzzaman M; Department of Computer Science and Engineering, United International University, Dhaka, Bangladesh.
Rahman MS; Department of Computer Science and Engineering, Bangladesh University of Engineering and Technology, Dhaka, Bangladesh.
Rahman MS; Department of Computer Science and Engineering, Bangladesh University of Engineering and Technology, Dhaka, Bangladesh.

BMC Bioinformatics ; 21(1): 223, 2020 Jun 01.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-32487025

Assuntos

Sistemas CRISPR-Cas/genética; Edição de Genes/métodos; Aprendizado de Máquina; RNA Guia de Cinetoplastídeos/genética; Algoritmos; Área Sob a Curva; Sequência de Bases; Bases de Dados Genéticas; Aprendizado Profundo; Células HEK293; Humanos; Curva ROC; Reprodutibilidade dos Testes

Palavras-chave

CRISPR; Cas9; Deep learning; Machine learning; sgRNA

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: RNA Guia de Cinetoplastídeos / Sistemas CRISPR-Cas / Aprendizado de Máquina / Edição de Genes Tipo de estudo: Prognostic_studies / Risk_factors_studies Limite: Humans Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Assunto da revista: INFORMATICA MEDICA Ano de publicação: 2020 Tipo de documento: Article País de afiliação: Bangladesh País de publicação: Reino Unido

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