Nuclease-mediated depletion biases in ribosome footprint profiling libraries.

Zinshteyn, Boris; Wangen, Jamie R; Hua, Boyang; Green, Rachel

Zinshteyn, Boris; Wangen, Jamie R; Hua, Boyang; Green, Rachel.

Afiliação

Zinshteyn B; Howard Hughes Medical Institute (HHMI).
Wangen JR; Department of Molecular Biology and Genetics, Johns Hopkins University School of Medicine, Baltimore, Maryland 21205, USA.
Hua B; Howard Hughes Medical Institute (HHMI).
Green R; Department of Molecular Biology and Genetics, Johns Hopkins University School of Medicine, Baltimore, Maryland 21205, USA.

RNA ; 26(10): 1481-1488, 2020 10.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-32503920

Assuntos

Biossíntese de Proteínas/genética; Ribonucleases/genética; Ribossomos/genética; Animais; Viés; Linhagem Celular; Células HEK293; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos; Humanos; Células K562; Mamíferos; Camundongos; RNA/genética; RNA Ribossômico/genética; Ratos; Análise de Sequência de RNA/métodos

Palavras-chave

RNA-seq; Ribo-Zero; rRNA depletion; ribo-seq; ribosome profiling

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Ribonucleases / Ribossomos / Biossíntese de Proteínas Limite: Animals / Humans Idioma: En Revista: RNA Assunto da revista: BIOLOGIA MOLECULAR Ano de publicação: 2020 Tipo de documento: Article País de publicação: Estados Unidos

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