RaptRanker: in silico RNA aptamer selection from HT-SELEX experiment based on local sequence and structure information.

Ishida, Ryoga; Adachi, Tatsuo; Yokota, Aya; Yoshihara, Hidehito; Aoki, Kazuteru; Nakamura, Yoshikazu; Hamada, Michiaki

Ishida, Ryoga; Adachi, Tatsuo; Yokota, Aya; Yoshihara, Hidehito; Aoki, Kazuteru; Nakamura, Yoshikazu; Hamada, Michiaki.

Afiliação

Ishida R; Graduate School of Advanced Science and Engineering, Waseda University, Tokyo, Japan.
Adachi T; RIBOMIC, inc., Tokyo, Japan.
Yokota A; Graduate School of Advanced Science and Engineering, Waseda University, Tokyo, Japan.
Yoshihara H; RIBOMIC, inc., Tokyo, Japan.
Aoki K; RIBOMIC, inc., Tokyo, Japan.
Nakamura Y; RIBOMIC, inc., Tokyo, Japan.
Hamada M; Graduate School of Advanced Science and Engineering, Waseda University, Tokyo, Japan.

Nucleic Acids Res ; 48(14): e82, 2020 08 20.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-32537639

Assuntos

Aptâmeros de Nucleotídeos/química; Técnica de Seleção de Aptâmeros/métodos; Aptâmeros de Nucleotídeos/isolamento & purificação; Aptâmeros de Nucleotídeos/metabolismo; Sequência de Bases; Simulação por Computador; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala; Conformação de Ácido Nucleico; Motivos de Nucleotídeos; Curva ROC

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Aptâmeros de Nucleotídeos / Técnica de Seleção de Aptâmeros Tipo de estudo: Prognostic_studies Idioma: En Revista: Nucleic Acids Res Ano de publicação: 2020 Tipo de documento: Article País de afiliação: Japão País de publicação: Reino Unido

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