DUGMO: tool for the detection of unknown genetically modified organisms with high-throughput sequencing data for pure bacterial samples.

Hurel, Julie; Schbath, Sophie; Bougeard, Stéphanie; Rolland, Mathieu; Petrillo, Mauro; Touzain, Fabrice

Hurel, Julie; Schbath, Sophie; Bougeard, Stéphanie; Rolland, Mathieu; Petrillo, Mauro; Touzain, Fabrice.

Afiliação

Hurel J; ANSES, Laboratoire de Ploufragan, GVB unit, 22440, Ploufragan, France.
Schbath S; Université Paris-Saclay, INRAE, MaIAGE, 78350, Jouy-en-Josas, France.
Bougeard S; ANSES, Laboratoire de Ploufragan, EPISABE unit, 22440, Ploufragan, France.
Rolland M; ANSES, Laboratoire de la santé des végétaux, 49000, Angers, France.
Petrillo M; European Commission, Joint Research Centre (JRC), Ispra, Italy.
Touzain F; ANSES, Laboratoire de Ploufragan, GVB unit, 22440, Ploufragan, France. fabrice.touzain@anses.fr.

BMC Bioinformatics ; 21(1): 284, 2020 Jul 06.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-32631215

Assuntos

Bactérias/química; Biologia Computacional/métodos; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos; Organismos Geneticamente Modificados/genética; Reação em Cadeia da Polimerase/métodos; Humanos

Palavras-chave

Bacteria; Detection; Illumina sequencing data; Machine learning; Unknown GMO

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Bactérias / Reação em Cadeia da Polimerase / Biologia Computacional / Organismos Geneticamente Modificados / Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala Tipo de estudo: Diagnostic_studies / Prognostic_studies Limite: Humans Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Assunto da revista: INFORMATICA MEDICA Ano de publicação: 2020 Tipo de documento: Article País de afiliação: França País de publicação: Reino Unido

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