Sequence-based prediction of SARS-CoV-2 vaccine targets using a mass spectrometry-based bioinformatics predictor identifies immunogenic T cell epitopes.

Poran, Asaf; Harjanto, Dewi; Malloy, Matthew; Arieta, Christina M; Rothenberg, Daniel A; Lenkala, Divya; van Buuren, Marit M; Addona, Terri A; Rooney, Michael S; Srinivasan, Lakshmi; Gaynor, Richard B

Poran, Asaf; Harjanto, Dewi; Malloy, Matthew; Arieta, Christina M; Rothenberg, Daniel A; Lenkala, Divya; van Buuren, Marit M; Addona, Terri A; Rooney, Michael S; Srinivasan, Lakshmi; Gaynor, Richard B.

Afiliação

Poran A; BioNTech US, Inc., 40 Erie Street, Suite 110, Cambridge, MA, 02139, USA. asaf.poran@biontech.us.
Harjanto D; BioNTech US, Inc., 40 Erie Street, Suite 110, Cambridge, MA, 02139, USA. dewi.harjanto@biontech.us.
Malloy M; BioNTech US, Inc., 40 Erie Street, Suite 110, Cambridge, MA, 02139, USA.
Arieta CM; BioNTech US, Inc., 40 Erie Street, Suite 110, Cambridge, MA, 02139, USA.
Rothenberg DA; BioNTech US, Inc., 40 Erie Street, Suite 110, Cambridge, MA, 02139, USA.
Lenkala D; BioNTech US, Inc., 40 Erie Street, Suite 110, Cambridge, MA, 02139, USA.
van Buuren MM; BioNTech US, Inc., 40 Erie Street, Suite 110, Cambridge, MA, 02139, USA.
Addona TA; BioNTech US, Inc., 40 Erie Street, Suite 110, Cambridge, MA, 02139, USA.
Rooney MS; BioNTech US, Inc., 40 Erie Street, Suite 110, Cambridge, MA, 02139, USA.
Srinivasan L; BioNTech US, Inc., 40 Erie Street, Suite 110, Cambridge, MA, 02139, USA.
Gaynor RB; BioNTech US, Inc., 40 Erie Street, Suite 110, Cambridge, MA, 02139, USA.

Genome Med ; 12(1): 70, 2020 08 13.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-32791978

Assuntos

Infecções por Coronavirus/imunologia; Epitopos/imunologia; Antígenos HLA/imunologia; Pneumonia Viral/imunologia; Linfócitos T/imunologia; Vacinas Virais/imunologia; Alelos; Afinidade de Anticorpos; COVID-19; Vacinas contra COVID-19; Biologia Computacional; Infecções por Coronavirus/genética; Infecções por Coronavirus/prevenção & controle; Epitopos/química; Epitopos/genética; Genoma Viral; Antígenos HLA/química; Antígenos HLA/genética; Humanos; Imunogenicidade da Vacina; Espectrometria de Massas; Pandemias; Vacinas Virais/química; Vacinas Virais/genética

Palavras-chave

COVID-19; Computational biology; HLA-I binding prediction; HLA-II binding prediction; SARS-CoV-2 T cell epitopes; T cell assay; Vaccine design

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Pneumonia Viral / Vacinas Virais / Linfócitos T / Infecções por Coronavirus / Antígenos HLA / Epitopos Tipo de estudo: Prognostic_studies / Risk_factors_studies Limite: Humans Idioma: En Revista: Genome Med Ano de publicação: 2020 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos País de publicação: Reino Unido

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