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Intragenic variants in the SMN1 gene determine the clinical phenotype in 5q spinal muscular atrophy.
Mendonça, Rodrigo de Holanda; Matsui, Ciro; Polido, Graziela Jorge; Silva, André Macedo Serafim; Kulikowski, Leslie; Torchio Dias, Alexandre; Zanardo, Evelin Aline; Solla, Davi Jorge Fontoura; Gurgel-Giannetti, Juliana; de Moura, Ana Carolina Monteiro Lessa; Sampaio, Gabriela Palhares Campolina; Oliveira, Acary Souza Bulle; de Souza, Paulo Victor Sgobbi; Pinto, Wladimir Bocca Vieira de Rezende; Gonçalves, Eduardo Augusto; Farias, Igor Braga; Nardes, Flávia; Araújo, Alexandra Prufer de Queiroz Campos; Marques, Wilson; Tomaselli, Pedro José; Ribeiro, Mara Dell Ospedale; Kitajima, João Paulo; Paoli Monteiro, Fabíola; Saute, Jonas Alex Morales; Becker, Michele Michelin; Saraiva-Pereira, Maria Luiza; Brusius-Facchin, Ana Carolina; van der Linden, Vanessa; Florêncio, Rodrigo Neves; Barbosa, André Vinícius Soares; Machado-Costa, Marcela Camara; Pessoa, André Luiz Santos; Souza, Leticia Silva; Franca, Marcondes Cavalcante; Kok, Fernando; Reed, Umbertina Conti; Zanoteli, Edmar.
Afiliação
  • Mendonça RH; Department of Neurology (R.H.M., C.M., G.J.P., A.M.S.S., D.J.F.S., F.K., U.C.R., E.Z.); Department of Pathology (L.K., A.T.D., E.A.Z.), Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (FMUSP); Departamento de Pediatria e Neuropediatria (J.G.-G., A.C.M.L.M., G.P.C.S.), Hospital das Clínicas da Uni
  • Matsui C; Department of Neurology (R.H.M., C.M., G.J.P., A.M.S.S., D.J.F.S., F.K., U.C.R., E.Z.); Department of Pathology (L.K., A.T.D., E.A.Z.), Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (FMUSP); Departamento de Pediatria e Neuropediatria (J.G.-G., A.C.M.L.M., G.P.C.S.), Hospital das Clínicas da Uni
  • Polido GJ; Department of Neurology (R.H.M., C.M., G.J.P., A.M.S.S., D.J.F.S., F.K., U.C.R., E.Z.); Department of Pathology (L.K., A.T.D., E.A.Z.), Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (FMUSP); Departamento de Pediatria e Neuropediatria (J.G.-G., A.C.M.L.M., G.P.C.S.), Hospital das Clínicas da Uni
  • Silva AMS; Department of Neurology (R.H.M., C.M., G.J.P., A.M.S.S., D.J.F.S., F.K., U.C.R., E.Z.); Department of Pathology (L.K., A.T.D., E.A.Z.), Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (FMUSP); Departamento de Pediatria e Neuropediatria (J.G.-G., A.C.M.L.M., G.P.C.S.), Hospital das Clínicas da Uni
  • Kulikowski L; Department of Neurology (R.H.M., C.M., G.J.P., A.M.S.S., D.J.F.S., F.K., U.C.R., E.Z.); Department of Pathology (L.K., A.T.D., E.A.Z.), Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (FMUSP); Departamento de Pediatria e Neuropediatria (J.G.-G., A.C.M.L.M., G.P.C.S.), Hospital das Clínicas da Uni
  • Torchio Dias A; Department of Neurology (R.H.M., C.M., G.J.P., A.M.S.S., D.J.F.S., F.K., U.C.R., E.Z.); Department of Pathology (L.K., A.T.D., E.A.Z.), Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (FMUSP); Departamento de Pediatria e Neuropediatria (J.G.-G., A.C.M.L.M., G.P.C.S.), Hospital das Clínicas da Uni
  • Zanardo EA; Department of Neurology (R.H.M., C.M., G.J.P., A.M.S.S., D.J.F.S., F.K., U.C.R., E.Z.); Department of Pathology (L.K., A.T.D., E.A.Z.), Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (FMUSP); Departamento de Pediatria e Neuropediatria (J.G.-G., A.C.M.L.M., G.P.C.S.), Hospital das Clínicas da Uni
  • Solla DJF; Department of Neurology (R.H.M., C.M., G.J.P., A.M.S.S., D.J.F.S., F.K., U.C.R., E.Z.); Department of Pathology (L.K., A.T.D., E.A.Z.), Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (FMUSP); Departamento de Pediatria e Neuropediatria (J.G.-G., A.C.M.L.M., G.P.C.S.), Hospital das Clínicas da Uni
  • Gurgel-Giannetti J; Department of Neurology (R.H.M., C.M., G.J.P., A.M.S.S., D.J.F.S., F.K., U.C.R., E.Z.); Department of Pathology (L.K., A.T.D., E.A.Z.), Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (FMUSP); Departamento de Pediatria e Neuropediatria (J.G.-G., A.C.M.L.M., G.P.C.S.), Hospital das Clínicas da Uni
  • de Moura ACML; Department of Neurology (R.H.M., C.M., G.J.P., A.M.S.S., D.J.F.S., F.K., U.C.R., E.Z.); Department of Pathology (L.K., A.T.D., E.A.Z.), Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (FMUSP); Departamento de Pediatria e Neuropediatria (J.G.-G., A.C.M.L.M., G.P.C.S.), Hospital das Clínicas da Uni
  • Sampaio GPC; Department of Neurology (R.H.M., C.M., G.J.P., A.M.S.S., D.J.F.S., F.K., U.C.R., E.Z.); Department of Pathology (L.K., A.T.D., E.A.Z.), Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (FMUSP); Departamento de Pediatria e Neuropediatria (J.G.-G., A.C.M.L.M., G.P.C.S.), Hospital das Clínicas da Uni
  • Oliveira ASB; Department of Neurology (R.H.M., C.M., G.J.P., A.M.S.S., D.J.F.S., F.K., U.C.R., E.Z.); Department of Pathology (L.K., A.T.D., E.A.Z.), Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (FMUSP); Departamento de Pediatria e Neuropediatria (J.G.-G., A.C.M.L.M., G.P.C.S.), Hospital das Clínicas da Uni
  • de Souza PVS; Department of Neurology (R.H.M., C.M., G.J.P., A.M.S.S., D.J.F.S., F.K., U.C.R., E.Z.); Department of Pathology (L.K., A.T.D., E.A.Z.), Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (FMUSP); Departamento de Pediatria e Neuropediatria (J.G.-G., A.C.M.L.M., G.P.C.S.), Hospital das Clínicas da Uni
  • Pinto WBVR; Department of Neurology (R.H.M., C.M., G.J.P., A.M.S.S., D.J.F.S., F.K., U.C.R., E.Z.); Department of Pathology (L.K., A.T.D., E.A.Z.), Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (FMUSP); Departamento de Pediatria e Neuropediatria (J.G.-G., A.C.M.L.M., G.P.C.S.), Hospital das Clínicas da Uni
  • Gonçalves EA; Department of Neurology (R.H.M., C.M., G.J.P., A.M.S.S., D.J.F.S., F.K., U.C.R., E.Z.); Department of Pathology (L.K., A.T.D., E.A.Z.), Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (FMUSP); Departamento de Pediatria e Neuropediatria (J.G.-G., A.C.M.L.M., G.P.C.S.), Hospital das Clínicas da Uni
  • Farias IB; Department of Neurology (R.H.M., C.M., G.J.P., A.M.S.S., D.J.F.S., F.K., U.C.R., E.Z.); Department of Pathology (L.K., A.T.D., E.A.Z.), Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (FMUSP); Departamento de Pediatria e Neuropediatria (J.G.-G., A.C.M.L.M., G.P.C.S.), Hospital das Clínicas da Uni
  • Nardes F; Department of Neurology (R.H.M., C.M., G.J.P., A.M.S.S., D.J.F.S., F.K., U.C.R., E.Z.); Department of Pathology (L.K., A.T.D., E.A.Z.), Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (FMUSP); Departamento de Pediatria e Neuropediatria (J.G.-G., A.C.M.L.M., G.P.C.S.), Hospital das Clínicas da Uni
  • Araújo APQC; Department of Neurology (R.H.M., C.M., G.J.P., A.M.S.S., D.J.F.S., F.K., U.C.R., E.Z.); Department of Pathology (L.K., A.T.D., E.A.Z.), Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (FMUSP); Departamento de Pediatria e Neuropediatria (J.G.-G., A.C.M.L.M., G.P.C.S.), Hospital das Clínicas da Uni
  • Marques W; Department of Neurology (R.H.M., C.M., G.J.P., A.M.S.S., D.J.F.S., F.K., U.C.R., E.Z.); Department of Pathology (L.K., A.T.D., E.A.Z.), Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (FMUSP); Departamento de Pediatria e Neuropediatria (J.G.-G., A.C.M.L.M., G.P.C.S.), Hospital das Clínicas da Uni
  • Tomaselli PJ; Department of Neurology (R.H.M., C.M., G.J.P., A.M.S.S., D.J.F.S., F.K., U.C.R., E.Z.); Department of Pathology (L.K., A.T.D., E.A.Z.), Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (FMUSP); Departamento de Pediatria e Neuropediatria (J.G.-G., A.C.M.L.M., G.P.C.S.), Hospital das Clínicas da Uni
  • Ribeiro MDO; Department of Neurology (R.H.M., C.M., G.J.P., A.M.S.S., D.J.F.S., F.K., U.C.R., E.Z.); Department of Pathology (L.K., A.T.D., E.A.Z.), Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (FMUSP); Departamento de Pediatria e Neuropediatria (J.G.-G., A.C.M.L.M., G.P.C.S.), Hospital das Clínicas da Uni
  • Kitajima JP; Department of Neurology (R.H.M., C.M., G.J.P., A.M.S.S., D.J.F.S., F.K., U.C.R., E.Z.); Department of Pathology (L.K., A.T.D., E.A.Z.), Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (FMUSP); Departamento de Pediatria e Neuropediatria (J.G.-G., A.C.M.L.M., G.P.C.S.), Hospital das Clínicas da Uni
  • Paoli Monteiro F; Department of Neurology (R.H.M., C.M., G.J.P., A.M.S.S., D.J.F.S., F.K., U.C.R., E.Z.); Department of Pathology (L.K., A.T.D., E.A.Z.), Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (FMUSP); Departamento de Pediatria e Neuropediatria (J.G.-G., A.C.M.L.M., G.P.C.S.), Hospital das Clínicas da Uni
  • Saute JAM; Department of Neurology (R.H.M., C.M., G.J.P., A.M.S.S., D.J.F.S., F.K., U.C.R., E.Z.); Department of Pathology (L.K., A.T.D., E.A.Z.), Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (FMUSP); Departamento de Pediatria e Neuropediatria (J.G.-G., A.C.M.L.M., G.P.C.S.), Hospital das Clínicas da Uni
  • Becker MM; Department of Neurology (R.H.M., C.M., G.J.P., A.M.S.S., D.J.F.S., F.K., U.C.R., E.Z.); Department of Pathology (L.K., A.T.D., E.A.Z.), Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (FMUSP); Departamento de Pediatria e Neuropediatria (J.G.-G., A.C.M.L.M., G.P.C.S.), Hospital das Clínicas da Uni
  • Saraiva-Pereira ML; Department of Neurology (R.H.M., C.M., G.J.P., A.M.S.S., D.J.F.S., F.K., U.C.R., E.Z.); Department of Pathology (L.K., A.T.D., E.A.Z.), Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (FMUSP); Departamento de Pediatria e Neuropediatria (J.G.-G., A.C.M.L.M., G.P.C.S.), Hospital das Clínicas da Uni
  • Brusius-Facchin AC; Department of Neurology (R.H.M., C.M., G.J.P., A.M.S.S., D.J.F.S., F.K., U.C.R., E.Z.); Department of Pathology (L.K., A.T.D., E.A.Z.), Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (FMUSP); Departamento de Pediatria e Neuropediatria (J.G.-G., A.C.M.L.M., G.P.C.S.), Hospital das Clínicas da Uni
  • van der Linden V; Department of Neurology (R.H.M., C.M., G.J.P., A.M.S.S., D.J.F.S., F.K., U.C.R., E.Z.); Department of Pathology (L.K., A.T.D., E.A.Z.), Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (FMUSP); Departamento de Pediatria e Neuropediatria (J.G.-G., A.C.M.L.M., G.P.C.S.), Hospital das Clínicas da Uni
  • Florêncio RN; Department of Neurology (R.H.M., C.M., G.J.P., A.M.S.S., D.J.F.S., F.K., U.C.R., E.Z.); Department of Pathology (L.K., A.T.D., E.A.Z.), Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (FMUSP); Departamento de Pediatria e Neuropediatria (J.G.-G., A.C.M.L.M., G.P.C.S.), Hospital das Clínicas da Uni
  • Barbosa AVS; Department of Neurology (R.H.M., C.M., G.J.P., A.M.S.S., D.J.F.S., F.K., U.C.R., E.Z.); Department of Pathology (L.K., A.T.D., E.A.Z.), Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (FMUSP); Departamento de Pediatria e Neuropediatria (J.G.-G., A.C.M.L.M., G.P.C.S.), Hospital das Clínicas da Uni
  • Machado-Costa MC; Department of Neurology (R.H.M., C.M., G.J.P., A.M.S.S., D.J.F.S., F.K., U.C.R., E.Z.); Department of Pathology (L.K., A.T.D., E.A.Z.), Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (FMUSP); Departamento de Pediatria e Neuropediatria (J.G.-G., A.C.M.L.M., G.P.C.S.), Hospital das Clínicas da Uni
  • Pessoa ALS; Department of Neurology (R.H.M., C.M., G.J.P., A.M.S.S., D.J.F.S., F.K., U.C.R., E.Z.); Department of Pathology (L.K., A.T.D., E.A.Z.), Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (FMUSP); Departamento de Pediatria e Neuropediatria (J.G.-G., A.C.M.L.M., G.P.C.S.), Hospital das Clínicas da Uni
  • Souza LS; Department of Neurology (R.H.M., C.M., G.J.P., A.M.S.S., D.J.F.S., F.K., U.C.R., E.Z.); Department of Pathology (L.K., A.T.D., E.A.Z.), Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (FMUSP); Departamento de Pediatria e Neuropediatria (J.G.-G., A.C.M.L.M., G.P.C.S.), Hospital das Clínicas da Uni
  • Franca MC; Department of Neurology (R.H.M., C.M., G.J.P., A.M.S.S., D.J.F.S., F.K., U.C.R., E.Z.); Department of Pathology (L.K., A.T.D., E.A.Z.), Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (FMUSP); Departamento de Pediatria e Neuropediatria (J.G.-G., A.C.M.L.M., G.P.C.S.), Hospital das Clínicas da Uni
  • Kok F; Department of Neurology (R.H.M., C.M., G.J.P., A.M.S.S., D.J.F.S., F.K., U.C.R., E.Z.); Department of Pathology (L.K., A.T.D., E.A.Z.), Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (FMUSP); Departamento de Pediatria e Neuropediatria (J.G.-G., A.C.M.L.M., G.P.C.S.), Hospital das Clínicas da Uni
  • Reed UC; Department of Neurology (R.H.M., C.M., G.J.P., A.M.S.S., D.J.F.S., F.K., U.C.R., E.Z.); Department of Pathology (L.K., A.T.D., E.A.Z.), Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (FMUSP); Departamento de Pediatria e Neuropediatria (J.G.-G., A.C.M.L.M., G.P.C.S.), Hospital das Clínicas da Uni
  • Zanoteli E; Department of Neurology (R.H.M., C.M., G.J.P., A.M.S.S., D.J.F.S., F.K., U.C.R., E.Z.); Department of Pathology (L.K., A.T.D., E.A.Z.), Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (FMUSP); Departamento de Pediatria e Neuropediatria (J.G.-G., A.C.M.L.M., G.P.C.S.), Hospital das Clínicas da Uni
Neurol Genet ; 6(5): e505, 2020 Oct.
Article em En | MEDLINE | ID: mdl-33062891
ABSTRACT

OBJECTIVE:

The aim of the study was to report the proportion of homozygous and compound heterozygous variants in the survival motor neuron 1 (SMN1) gene in a large population of patients with spinal muscular atrophy (SMA) and to correlate the severity of the disease with the presence of specific intragenic variants in SMN1 and with the SMN2 copy number.

METHODS:

Four hundred fifty Brazilian patients with SMA were included in a retrospective study, and clinical data were analyzed compared with genetic data; the SMN2 copy number was obtained by multiplex ligation-dependent probe amplification and pathogenic variants in SMN1 by next-generation sequencing.

RESULTS:

Four hundred two patients (89.3%) presented homozygous exon 7-SMN1 deletion, and 48 (10.7%) were compound heterozygous for the common deletion in one allele and a point mutation in the other allele. Recurrent variants in exons 3 and 6 (c.460C>T, c.770_780dup and c.734_735insC) accounted for almost 80% of compound heterozygous patients. Another recurrent pathogenic variant was c.5C>G at exon 1. Patients with c.770_780dup and c.734_735insC had a clinical phenotype correlated with SMN2 copy number, whereas the variants c.460C>T and c.5C>G determined a milder phenotype independently of the SMN2 copies.

CONCLUSIONS:

Patients with specific pathogenic variants (c.460C>T and c.5C>G) presented a milder phenotype, and the SMN2 copy number did not correlate with disease severity in this group.
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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Tipo de estudo: Observational_studies Idioma: En Revista: Neurol Genet Ano de publicação: 2020 Tipo de documento: Article
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