MirLocPredictor: A ConvNet-Based Multi-Label MicroRNA Subcellular Localization Predictor by Incorporating k-Mer Positional Information.

Asim, Muhammad Nabeel; Malik, Muhammad Imran; Zehe, Christoph; Trygg, Johan; Dengel, Andreas; Ahmed, Sheraz

Asim, Muhammad Nabeel; Malik, Muhammad Imran; Zehe, Christoph; Trygg, Johan; Dengel, Andreas; Ahmed, Sheraz.

Afiliação

Asim MN; German Research Center for Artificial Intelligence (DFKI), 67663 Kaiserslautern, Germany.
Malik MI; TU Kaiserslautern, 67663 Kaiserslautern, Germany.
Zehe C; National Center for Artificial Intelligence (NCAI), National University of Sciences and Technology, 44000 Islamabad, Pakistan.
Trygg J; Sartorius Corporate Research, Sartorius Stedim Cellca GmbH, 89081 Ulm, Germany.
Dengel A; Computational Life Science Cluster (CLiC), Umeå University, 90187 Umeå, Sweden.
Ahmed S; Sartorius Corporate Research, Sartorius Stedim Data Analytics, 90333 Umeå, Sweden.

Genes (Basel) ; 11(12)2020 12 09.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-33316943

Assuntos

MicroRNAs/análise; MicroRNAs/genética; Mapeamento de Nucleotídeos/métodos; Algoritmos; Animais; Biologia Computacional/métodos; Aprendizado Profundo; Previsões/métodos; Humanos; Espaço Intracelular/genética; Redes Neurais de Computação; Análise de Sequência de RNA/métodos

Palavras-chave

convolutional neural network; k-mer positional encoding; microRNA location predictor; microRNA multi-label classification; microRNA subcellular localization

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Mapeamento de Nucleotídeos / MicroRNAs Tipo de estudo: Prognostic_studies / Risk_factors_studies Limite: Animals / Humans Idioma: En Revista: Genes (Basel) Ano de publicação: 2020 Tipo de documento: Article País de afiliação: Alemanha País de publicação: Suíça

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