Lower Density Selection Schemes via Small Universal Hitting Sets with Short Remaining Path Length.

Zheng, Hongyu; Kingsford, Carl; Marçais, Guillaume

Zheng, Hongyu; Kingsford, Carl; Marçais, Guillaume.

Afiliação

Zheng H; Computational Biology Department, Carnegie Mellon University, Pittsburgh Pennsylvania, USA.
Kingsford C; Computational Biology Department, Carnegie Mellon University, Pittsburgh Pennsylvania, USA.
Marçais G; Computational Biology Department, Carnegie Mellon University, Pittsburgh Pennsylvania, USA.

J Comput Biol ; 28(4): 395-409, 2021 04.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-33325773

Assuntos

Genoma Humano/genética; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala; Análise de Sequência de DNA; Software; Algoritmos; Biologia Computacional/tendências; Humanos

Palavras-chave

de Bruijn graph; depathing set; minimizers; sequence sketch; universal hitting set

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Software / Genoma Humano / Análise de Sequência de DNA / Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala Limite: Humans Idioma: En Revista: J Comput Biol Assunto da revista: BIOLOGIA MOLECULAR / INFORMATICA MEDICA Ano de publicação: 2021 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos País de publicação: Estados Unidos

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