High-Throughput Targeted Transcriptional Profiling of Defense Genes Using RNA-Mediated Oligonucleotide Annealing, Selection, and Ligation with Next-Generation Sequencing in Arabidopsis.

Kim, Sung-Il; Bordiya, Yogendra; Nam, Ji-Chul; Mayorga, José; Kang, Hong-Gu

Kim, Sung-Il; Bordiya, Yogendra; Nam, Ji-Chul; Mayorga, José; Kang, Hong-Gu.

Afiliação

Kim SI; Department of Biology, Texas State University, San Marcos, TX, USA.
Bordiya Y; Department of Biology, Texas State University, San Marcos, TX, USA.
Nam JC; Department of Molecular Biosciences, Institute for Cellular & Molecular Biology, The University of Texas at Austin, Austin, TX, USA.
Mayorga J; Department of Biology, Texas State University, San Marcos, TX, USA.
Kang HG; Department of Biology, Texas State University, San Marcos, TX, USA.

Methods Mol Biol ; 2328: 227-252, 2021.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-34251630

Assuntos

Arabidopsis/metabolismo; Perfilação da Expressão Gênica/métodos; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos; Arabidopsis/genética; Proteínas de Arabidopsis/genética; Proteínas de Arabidopsis/metabolismo; Interações Hospedeiro-Patógeno/genética; Oligonucleotídeos/genética; Doenças das Plantas/genética; Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real

Palavras-chave

Arabidopsis; Defense genes; High-throughput targeted transcriptional analysis; RASL-seq; Transcript profiling

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Arabidopsis / Perfilação da Expressão Gênica / Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala Idioma: En Revista: Methods Mol Biol Assunto da revista: BIOLOGIA MOLECULAR Ano de publicação: 2021 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos País de publicação: Estados Unidos

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