SPLICE-q: a Python tool for genome-wide quantification of splicing efficiency.

de Melo Costa, Verônica R; Pfeuffer, Julianus; Louloupi, Annita; Ørom, Ulf A V; Piro, Rosario M

de Melo Costa, Verônica R; Pfeuffer, Julianus; Louloupi, Annita; Ørom, Ulf A V; Piro, Rosario M.

Afiliação

de Melo Costa VR; Institute of Computer Science and Institute of Bioinformatics, Freie Universität Berlin, Berlin, Germany. veronica.melocosta@gmail.com.
Pfeuffer J; Department of Computational Molecular Biology, Max Planck Institute for Molecular Genetics, Berlin, Germany. veronica.melocosta@gmail.com.
Louloupi A; Institute of Computer Science and Institute of Bioinformatics, Freie Universität Berlin, Berlin, Germany.
Ørom UAV; Department of Computer Science, Eberhard Karls Universität Tübingen, Tübingen, Germany.
Piro RM; Institute for Bioinformatics and Medical Informatics Tübingen, Eberhard Karls Universität Tübingen, Tübingen, Germany.

BMC Bioinformatics ; 22(1): 368, 2021 Jul 15.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-34266387

Assuntos

Processamento Alternativo; Sítios de Splice de RNA; Genoma; Humanos; Íntrons; Sítios de Splice de RNA/genética; Splicing de RNA/genética

Palavras-chave

Co-transcriptional splicing; RNA-seq; Splicing dynamics; Splicing efficiency

Texto completo

Adicionar na Minha BVS

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar no Google

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Processamento Alternativo / Sítios de Splice de RNA Limite: Humans Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Assunto da revista: INFORMATICA MEDICA Ano de publicação: 2021 Tipo de documento: Article País de afiliação: Alemanha País de publicação: Reino Unido

Texto completo

Adicionar na Minha BVS

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar no Google