Structural Insight into the Binding of Cyanovirin-N with the Spike Glycoprotein, M<sup>pro</sup> and PL<sup>pro</sup> of SARS-CoV-2: Protein-Protein Interactions, Dynamics Simulations and Free Energy Calculations.

Naidoo, Devashan; Kar, Pallab; Roy, Ayan; Mutanda, Taurai; Bwapwa, Joseph; Sen, Arnab; Anandraj, Akash

Structural Insight into the Binding of Cyanovirin-N with the Spike Glycoprotein, M^pro and PL^pro of SARS-CoV-2: Protein-Protein Interactions, Dynamics Simulations and Free Energy Calculations.

Naidoo, Devashan; Kar, Pallab; Roy, Ayan; Mutanda, Taurai; Bwapwa, Joseph; Sen, Arnab; Anandraj, Akash.

Afiliação

Naidoo D; Centre for Algal Biotechnology, Mangosuthu University of Technology, P.O. Box 12363, Durban 4026, South Africa.
Kar P; Bioinformatics Facility, Department of Botany, University of North Bengal, Siliguri 734013, India.
Roy A; Department of Biotechnology, Lovely Professional University, Phagwara 144411, India.
Mutanda T; Centre for Algal Biotechnology, Mangosuthu University of Technology, P.O. Box 12363, Durban 4026, South Africa.
Bwapwa J; Centre for Algal Biotechnology, Mangosuthu University of Technology, P.O. Box 12363, Durban 4026, South Africa.
Sen A; Bioinformatics Facility, Department of Botany, University of North Bengal, Siliguri 734013, India.
Anandraj A; Centre for Algal Biotechnology, Mangosuthu University of Technology, P.O. Box 12363, Durban 4026, South Africa.

Molecules ; 26(17)2021 Aug 24.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-34500548

Assuntos

Antivirais/farmacologia; Proteínas de Bactérias/farmacologia; Tratamento Farmacológico da COVID-19; Inibidores de Protease de Coronavírus/farmacologia; Antivirais/uso terapêutico; Proteínas de Bactérias/uso terapêutico; Proteínas de Bactérias/ultraestrutura; COVID-19/virologia; Proteases 3C de Coronavírus/antagonistas & inibidores; Proteases 3C de Coronavírus/metabolismo; Proteases 3C de Coronavírus/ultraestrutura; Proteases Semelhantes à Papaína de Coronavírus/antagonistas & inibidores; Proteases Semelhantes à Papaína de Coronavírus/metabolismo; Proteases Semelhantes à Papaína de Coronavírus/ultraestrutura; Inibidores de Protease de Coronavírus/uso terapêutico; Inibidores de Protease de Coronavírus/ultraestrutura; Humanos; Simulação de Acoplamento Molecular; Simulação de Dinâmica Molecular; Ligação Proteica; Mapeamento de Interação de Proteínas; Glicoproteína da Espícula de Coronavírus/antagonistas & inibidores; Glicoproteína da Espícula de Coronavírus/metabolismo; Glicoproteína da Espícula de Coronavírus/ultraestrutura; Difração de Raios X

Palavras-chave

Mpro; PLpro; SARS-CoV-2; cyanobacteria; cyanovirin-N; molecular docking; molecular dynamics simulations; phycocyanin; scytovirin; spike protein

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Antivirais / Proteínas de Bactérias / Inibidores de Protease de Coronavírus / Tratamento Farmacológico da COVID-19 Limite: Humans Idioma: En Revista: Molecules Assunto da revista: BIOLOGIA Ano de publicação: 2021 Tipo de documento: Article País de afiliação: África do Sul País de publicação: Suíça

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