Decoding the link of microbiome niches with homologous sequences enables accurately targeted protein structure prediction.

Yang, Pengshuo; Zheng, Wei; Ning, Kang; Zhang, Yang

Yang, Pengshuo; Zheng, Wei; Ning, Kang; Zhang, Yang.

Afiliação

Yang P; Key Laboratory of Molecular Biophysics of the Ministry of Education, Hubei Key Laboratory of Bioinformatics and Molecular-imaging, Center of Artificial Intelligence Biology, Department of Bioinformatics and Systems Biology, College of Life Science and Technology, Huazhong University of Science and T
Zheng W; Department of Computational Medicine and Bioinformatics, University of Michigan, Ann Arbor, MI 48109.
Ning K; Key Laboratory of Molecular Biophysics of the Ministry of Education, Hubei Key Laboratory of Bioinformatics and Molecular-imaging, Center of Artificial Intelligence Biology, Department of Bioinformatics and Systems Biology, College of Life Science and Technology, Huazhong University of Science and T
Zhang Y; Department of Computational Medicine and Bioinformatics, University of Michigan, Ann Arbor, MI 48109; ningkang@hust.edu.cn zhng@umich.edu.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 118(49)2021 12 07.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-34873061

Assuntos

Microbiota/genética; Alinhamento de Sequência/métodos; Análise de Sequência de Proteína/métodos; Algoritmos; Biologia Computacional/métodos; Bases de Dados de Proteínas; Aprendizado Profundo; Ecossistema; Evolução Molecular; Humanos; Metagenoma/genética; Redes Neurais de Computação; Conformação Proteica; Dobramento de Proteína; Proteínas/química; Homologia de Sequência

Palavras-chave

deep learning; microbiome; multiple sequence alignments; protein homologous families; protein structure prediction

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Alinhamento de Sequência / Análise de Sequência de Proteína / Microbiota Tipo de estudo: Prognostic_studies / Risk_factors_studies Limite: Humans Idioma: En Revista: Proc Natl Acad Sci U S A Ano de publicação: 2021 Tipo de documento: Article País de publicação: Estados Unidos

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