Protein dynamics developments for the large scale and cryoEM: case study of ProDy 2.0.

Krieger, James Michael; Sorzano, Carlos Oscar S; Carazo, Jose Maria; Bahar, Ivet

Krieger, James Michael; Sorzano, Carlos Oscar S; Carazo, Jose Maria; Bahar, Ivet.

Afiliação

Krieger JM; Biocomputing Unit, Centro Nacional de Biotecnología (CSIC), Calle Darwin 3, 28049 Madrid, Spain.
Sorzano COS; Biocomputing Unit, Centro Nacional de Biotecnología (CSIC), Calle Darwin 3, 28049 Madrid, Spain.
Carazo JM; Biocomputing Unit, Centro Nacional de Biotecnología (CSIC), Calle Darwin 3, 28049 Madrid, Spain.
Bahar I; Department of Computational and Systems Biology, School of Medicine, University of Pittsburgh, 800 Murdoch Building, 3420 Forbes Avenue, Pittsburgh, PA 15213, USA.

Acta Crystallogr D Struct Biol ; 78(Pt 4): 399-409, 2022 Apr 01.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-35362464

Assuntos

Simulação de Dinâmica Molecular; Microscopia Crioeletrônica/métodos; Análise de Componente Principal

Palavras-chave

computational biophysics; cryo-electron microscopy; elastic network model; ensemble essential dynamics; normal mode analysis; principal component analysis; pseudoatoms; signature protein dynamics

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Simulação de Dinâmica Molecular Idioma: En Revista: Acta Crystallogr D Struct Biol Ano de publicação: 2022 Tipo de documento: Article País de afiliação: Espanha País de publicação: Estados Unidos

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