DNA barcoding of fungal specimens using PacBio long-read high-throughput sequencing.

Runnel, Kadri; Abarenkov, Kessy; CopoÈ, Ovidiu; Mikryukov, Vladimir; Kõljalg, Urmas; Saar, Irja; Tedersoo, Leho

Runnel, Kadri; Abarenkov, Kessy; CopoÈ, Ovidiu; Mikryukov, Vladimir; Kõljalg, Urmas; Saar, Irja; Tedersoo, Leho.

Afiliação

Runnel K; Institute of Ecology and Earth Sciences, University of Tartu, Tartu, Estonia.
Abarenkov K; Mycology and Microbiology Center, University of Tartu, Tartu, Estonia.
CopoÈ O; Mycology and Microbiology Center, University of Tartu, Tartu, Estonia.
Mikryukov V; Natural History Museum, University of Tartu, Tartu, Estonia.
Kõljalg U; Institute of Ecology and Earth Sciences, University of Tartu, Tartu, Estonia.
Saar I; Institute of Ecology and Earth Sciences, University of Tartu, Tartu, Estonia.
Tedersoo L; Institute of Ecology and Earth Sciences, University of Tartu, Tartu, Estonia.

Mol Ecol Resour ; 22(8): 2871-2879, 2022 Nov.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-35666173

Assuntos

Código de Barras de DNA Taxonômico; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala; Código de Barras de DNA Taxonômico/métodos; DNA Fúngico/genética; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos; Filogenia; RNA Ribossômico 28S; Análise de Sequência de DNA

Palavras-chave

PacBio sequencing; allele polymorphism; intragenomic diversity; long-read high-throughput sequencing; paralogues; species identification

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Código de Barras de DNA Taxonômico / Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala Idioma: En Revista: Mol Ecol Resour Ano de publicação: 2022 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estônia País de publicação: Reino Unido

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