Model selection and robust inference of mutational signatures using Negative Binomial non-negative matrix factorization.

Pelizzola, Marta; Laursen, Ragnhild; Hobolth, Asger

Pelizzola, Marta; Laursen, Ragnhild; Hobolth, Asger.

Afiliação

Pelizzola M; Department of Mathematics, Aarhus University, Aarhus, Denmark. marta@math.au.dk.
Laursen R; Department of Mathematics, Aarhus University, Aarhus, Denmark.
Hobolth A; Department of Mathematics, Aarhus University, Aarhus, Denmark.

BMC Bioinformatics ; 24(1): 187, 2023 May 08.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-37158829

Assuntos

Algoritmos; Mama; Masculino; Humanos; Mutação; Distribuição Binomial; Simulação por Computador

Palavras-chave

Cancer genomics; Cross-validation; Model checking; Model selection; Mutational signatures; Negative Binomial; Non-negative matrix factorization; Poisson

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Algoritmos / Mama Tipo de estudo: Prognostic_studies Limite: Humans / Male Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Assunto da revista: INFORMATICA MEDICA Ano de publicação: 2023 Tipo de documento: Article País de afiliação: Dinamarca País de publicação: Reino Unido

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