Este artigo é um Preprint
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Genomic epidemiology of SARS-CoV-2 in Colombia
Preprint
em En
| PREPRINT-MEDRXIV
| ID: ppmedrxiv-20135715
ABSTRACT
Coronavirus disease 2019 (COVID-19) was first diagnosed in Colombia from a traveler arriving from Italy on February 26, 2020. To date, available data on the origins and number or introductions of SARS-CoV-2 into the country are limited. Here, we sequenced SARS-CoV-2 from 43 clinical samples and--together with other 73 genomes sequences available from the country--we investigated the emergence and the routes of importation of COVID-19 into Colombia using epidemiological, historical air travel and phylogenetic observations. Our study provided evidence of multiple introductions, mostly from Europe, with at least 12 lineages being documented. Phylogenetic findings validated the lineage diversity, supported multiple importation events and the evolutionary relationship of epidemiologically-linked transmission chains. Our results reconstruct the early evolutionary history of SARS-CoV-2 in Colombia and highlight the advantages of genome sequencing to complement COVID-19 outbreak investigation.
cc_by_nc_nd
Texto completo:
1
Coleções:
09-preprints
Base de dados:
PREPRINT-MEDRXIV
Tipo de estudo:
Observational_studies
/
Prognostic_studies
Idioma:
En
Ano de publicação:
2020
Tipo de documento:
Preprint