RESUMO
An experimental approach is described for late-stage lead diversification of frontrunner drug candidates using nanomole-scale amounts of lead compounds for structure-activity relationship development. The process utilizes C-H bond activation methods to explore chemical space by transforming candidates into newly functionalized leads. A key to success is the utilization of microcryoprobe nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy, which permits the use of low amounts of lead compounds (1-5 µmol). The approach delivers multiple analogues from a single lead at nanomole-scale amounts as DMSO-d6 stock solutions with a known structure and concentration for in vitro pharmacology and absorption, distribution, metabolism, and excretion testing. To demonstrate the feasibility of this approach, we have used the antihistamine agent loratadine (1). Twenty-six analogues of loratadine were isolated and fully characterized by NMR. Informative SAR analogues were identified, which display potent affinity for the human histamine H1 receptor and improved metabolic stability.
Assuntos
Loratadina/análogos & derivados , Loratadina/farmacocinética , Relação Estrutura-Atividade , Animais , Cromatografia Líquida de Alta Pressão , Sistema Enzimático do Citocromo P-450/genética , Sistema Enzimático do Citocromo P-450/metabolismo , Dimetil Sulfóxido/química , Cães , Descoberta de Drogas/métodos , Antagonistas não Sedativos dos Receptores H1 da Histamina/química , Antagonistas não Sedativos dos Receptores H1 da Histamina/farmacologia , Humanos , Ligação de Hidrogênio , Inativação Metabólica , Loratadina/química , Espectroscopia de Ressonância Magnética , Metaloporfirinas/química , Metaloporfirinas/metabolismo , Microssomos Hepáticos/efeitos dos fármacos , Microssomos Hepáticos/metabolismo , Coelhos , Proteínas Recombinantes/genética , Proteínas Recombinantes/metabolismo , Espectrometria de Massas em Tandem , Distribuição TecidualRESUMO
Through high throughput screening, substituted proline sulfonamide 6 was identified as HCV NS5b RNA-dependent RNA polymerase inhibitor. Optimization of various regions of the lead molecule resulted in compounds that displayed good potency and selectivity. The crystal structure of 6 and NS5b polymerase complex confirmed the binding near the active site region. The optimization approach and SAR are discussed in detail.
Assuntos
Antivirais/síntese química , Prolina/análogos & derivados , Prolina/síntese química , Sulfonamidas/síntese química , Proteínas não Estruturais Virais/antagonistas & inibidores , Proteínas não Estruturais Virais/química , Antivirais/química , Sítios de Ligação , Cristalografia por Raios X , Modelos Moleculares , Conformação Molecular , Prolina/química , Relação Estrutura-Atividade , Sulfonamidas/químicaRESUMO
A novel series of HCV NS5B RNA-dependent RNA polymerase inhibitors containing a pyrano[3,4-b]indole scaffold is described leading to the discovery of compound 16, a highly potent and selective inhibitor that is active in the replicon system.
Assuntos
Antivirais/síntese química , RNA Polimerases Dirigidas por DNA/antagonistas & inibidores , Hepacivirus/enzimologia , Indóis/síntese química , Piranos/síntese química , Proteínas não Estruturais Virais/antagonistas & inibidores , Antivirais/química , Cristalografia por Raios X , RNA Polimerases Dirigidas por DNA/química , Indóis/química , Piranos/química , Estereoisomerismo , Relação Estrutura-Atividade , Proteínas não Estruturais Virais/químicaRESUMO
This work describes two distinct routes to prepare pyrazolo[1,5-alpha]pyrimidin-7-ones and two distinct routes to prepare pyrazolo[1,5-alpha]pyrimidin-5-ones. Use of 1,3-dimethyluracil as the electrophile in the preparation of the pyrimidin-5-one regioisomer represents a correction of previously reported results. Also, a novel reaction to prepare this isomer was identified and the reaction mechanism elucidated. This work provides the experimentalist with complimentary synthetic pathways that afford either the pyrimidin-7-one or the pyrimidin-5-one regioisomer.
Assuntos
Anti-Inflamatórios/síntese química , Pirazóis/química , Pirimidinonas/química , Isomerismo , Modelos Químicos , Esquistossomicidas/síntese química , Uracila/análogos & derivados , Uracila/químicaRESUMO
A novel class of HCV NS5B RNA dependent RNA polymerase inhibitors containing 3,4-dihydro-1H-[1]-benzothieno[2,3-c]pyran and 3,4-dihydro-1H-pyrano[3,4-b]benzofuran scaffolds were designed and synthesized. Optimization of the alkyl substituent in the pyran ring showed preference for an n-propyl group, while 5,8-disubstitution pattern is preferred for the aromatic region. Analog 19 displayed potent activity with an IC(50) of 50 nM against HCV NS5B enzyme and was selective over a panel of polymerases.
Assuntos
Benzofuranos , Inibidores Enzimáticos/síntese química , Inibidores Enzimáticos/farmacologia , Piranos , RNA Polimerase Dependente de RNA/antagonistas & inibidores , Proteínas não Estruturais Virais/antagonistas & inibidores , Animais , Benzofuranos/síntese química , Benzofuranos/química , Benzofuranos/farmacologia , Linhagem Celular Tumoral , Chlorocebus aethiops , Desenho de Fármacos , Avaliação Pré-Clínica de Medicamentos , Inibidores Enzimáticos/química , Humanos , Estrutura Molecular , Piranos/síntese química , Piranos/química , Piranos/farmacologia , RNA Polimerase Dependente de RNA/química , Relação Estrutura-Atividade , Células Vero , Proteínas não Estruturais Virais/químicaRESUMO
A novel class of HCV NS5B RNA dependent RNA polymerase inhibitors containing 2,3,4,9-tetrahydro-1H-carbazole and 1,2,3,4-tetrahydro-cyclopenta[b]indole scaffolds were designed and synthesized. Optimization of the aromatic region showed preference for 5,8-disubstitution pattern in both the scaffolds examined while favoring the n-propyl moiety for the C-1 position. 1,2,3,4-tetrahydro-cyclopenta[b]indole scaffold was slightly more potent than the corresponding 2,3,4,9-tetrahydro-1H-carbazole and analogue 36 displayed an IC50 of 550 nM against HCV NS5B enzyme.