Volumetric yield coefficient: the key to regulating virtual credits for Amazon wood / Coeficiente de rendimento volumétrico: uma peça-chave para disciplinar créditos virtuais de madeira amazônica

In Brazil, all transport and storage of native forest products and by-products must be registered within the DOF (Document of Forestry Origin) system. This computerized platform exists to support control agencies in reducing the sale of forest products obtained illegally. However, this tool still shows only modest results in fulfilling its objectives, since gaps in the system allow illegal wood to be acquired and enter the system as legal wood. The objective of this study was to test whether the volumetric yield coefficient (CRV) of a sawmill on an industrial scale corresponds to the 35% established by Brazilian legislation. The focus was directed at a loophole that allows the accumulation of virtual credits in the DOF system by turning logs into lumber. For this purpose, we estimated the sawmill's CRV and mean percentage yield of 19 commercial species used by a timber company in the Brazilian Amazon with a sample size of 90 logs. The estimated CRV was 24.6 ± 2.4, showing 9.9% uncertainty. The mean CRV differed highly significantly (p < 0.001) from that proposed by the DOF, with a 10.35% difference. Based on these results, the difference between the observed yield and that proposed by the legislation can generate the accumulation of virtual log credits. With this accumulation, managers encounter difficulties in acquiring new logging permits and, consequently, do not meet the actual demand for logs to the sawmill's capacity.(AU)

No Brasil, todo transporte e armazenamento de produtos e subprodutos florestais nativos deve ser registrado no sistema DOF (Documento de Origem Florestal). Essa plataforma informatizada existe para apoiar agências de controle na redução da venda de produtos florestais obtidos ilegalmente. No entanto, essa ferramenta ainda apresenta resultados modestos no cumprimento de seus objetivos, uma vez que lacunas no sistema permitem que madeira ilegal adquira caráter legal. O objetivo desse estudo foi testar se o coeficiente de rendimento volumétrico (CRV) de uma serraria em escala empresarial corresponde aos 35% estabelecidos pela legislação brasileira. O foco foi direcionado para uma brecha que permite o acúmulo de créditos virtuais no sistema DOF, por meio da transformação de toras em material serrado. Para tanto, estimamos o CRV da serraria e os rendimentos percentuais médios de 19 espécies comercializadas por uma empresa de base florestal na Amazônia brasileira, com um esforço amostral de 90 toras. O CRV estimado foi de 24,6 ± 2,4, mostrando incerteza de 9,9%. O CRV médio diferiu altamente significativamente (p < 0,001) do proposto pelo DOF, com uma diferença de 10,35%. Com base nesses resultados, a diferença entre o rendimento observado e o proposto pela legislação pode gerar um acúmulo de créditos em toras virtuais. Com esse acúmulo, os gestores enfrentam dificuldades para adquirir novas licenças de exploração e, consequentemente, não atendem à real demanda por toras da capacidade instalada de sua serraria.(AU)

In silico analysis of the Dof transcription factor family in Coffea canephora / Análise in silico de fatores de transcrição da família Dof em Coffea canephora

The Dof family (DNA-binding with One Finger) is a group of transcription factors that are involved in a variety of functions of importance for different biological processes in plants, such as plant growth, development and response to biotic and abiotic stresses. The Dof genes have been identified and characterized in many plant species, but so far there is no information about these genes in coffee species. In the present study, we identified 24 Dof members in Coffea canephora using the Coffee Genome Hub database. Systematic bioinformatics analyses were performed to characterize all CcDof genes, including complete genome sequence, conserved protein domains, subcellular locations, phylogenetic relationships and gene expression profiles in different tissues. The results obtained here provide new insights into the CcDof gene family, allowing the design of future experiments for the molecular characterization of these genes in coffee plants.

A família Dof (DNA-binding with One Finger) é um grupo de fatores de transcrição que desempenham papéis importantes no crescimento, desenvolvimento e na resposta das plantas aos estresses bióticos e abióticos. Os genes Dof foram identificados e caracterizados em várias espécies de plantas; entretanto até o presente momento não há informações sobre esses genes em café. No presente estudo foram identificados 24 membros da família Dof no genoma de C. canephora depositados no banco de dados Coffee Genome Hub. Análises sistemáticas de bioinformática foram realizadas para caracterizar os genes Dof em C. canephora, incluindo a análise de sequências genômicas, domínios proteicos conservados, localizações subcelulares, relações filogenéticas e perfis de expressão gênica em diferentes tecidos. Os resultados obtidos fornecem uma melhor compreensão sobre a família dos genes CcDof permitindo projetar experimentos futuros para caracterização molecular desses genes no cafeeiro.

In silico analysis of the Dof transcription factor family in Coffea canephora / Análise in silico de fatores de transcrição da família Dof em Coffea canephora

The Dof family (DNA-binding with One Finger) is a group of transcription factors that are involved in a variety of functions of importance for different biological processes in plants, such as plant growth, development and response to biotic and abiotic stresses. The Dof genes have been identified and characterized in many plant species, but so far there is no information about these genes in coffee species. In the present study, we identified 24 Dof members in Coffea canephora using the Coffee Genome Hub database. Systematic bioinformatics analyses were performed to characterize all CcDof genes, including complete genome sequence, conserved protein domains, subcellular locations, phylogenetic relationships and gene expression profiles in different tissues. The results obtained here provide new insights into the CcDof gene family, allowing the design of future experiments for the molecular characterization of these genes in coffee plants.(AU)

A família Dof (DNA-binding with One Finger) é um grupo de fatores de transcrição que desempenham papéis importantes no crescimento, desenvolvimento e na resposta das plantas aos estresses bióticos e abióticos. Os genes Dof foram identificados e caracterizados em várias espécies de plantas; entretanto até o presente momento não há informações sobre esses genes em café. No presente estudo foram identificados 24 membros da família Dof no genoma de C. canephora depositados no banco de dados Coffee Genome Hub. Análises sistemáticas de bioinformática foram realizadas para caracterizar os genes Dof em C. canephora, incluindo a análise de sequências genômicas, domínios proteicos conservados, localizações subcelulares, relações filogenéticas e perfis de expressão gênica em diferentes tecidos. Os resultados obtidos fornecem uma melhor compreensão sobre a família dos genes CcDof permitindo projetar experimentos futuros para caracterização molecular desses genes no cafeeiro.(AU)

The optimal number of partial least squares components in genomic selection for pork pH / Número ótimo de componentes nos quadrados mínimos parciais aplicados à seleção genômica para pH da carne suína

The main application of genomic selection (GS) is the early identification of genetically superior animals for traits difficult-to-measure or lately evaluated, such as meat pH (measured after slaughter). Because the number of markers in GS is generally larger than the number of genotyped animals and these markers are highly correlated owing to linkage disequilibrium, statistical methods based on dimensionality reduction have been proposed. Among them, the partial least squares (PLS) technique stands out, because of its simplicity and high predictive accuracy. However, choosing the optimal number of components remains a relevant issue for PLS applications. Thus, we applied PLS (and principal component and traditional multiple regression) techniques to GS for pork pH traits (with pH measured at 45min and 24h after slaughter) and also identified the optimal number of PLS components based on the degree-of-freedom (DoF) and cross-validation (CV) methods. The PLS method out performs the principal component and traditional multiple regression techniques, enabling satisfactory predictions for pork pH traits using only genotypic data (low-density SNP panel). Furthermore, the SNP marker estimates from PLS revealed a relevant region on chromosome 4, which may affect these traits. The DoF and CV methods showed similar results for determining the optimal number of components in PLS analysis; thus, from the statistical viewpoint, the DoF method should be preferred because of its theoretical background (based on the "statistical information theory"), whereas CV is an empirical method based on computational effort.

A principal contribuição da seleção genômica (SG) é a identificação de animais geneticamente superiores para características de difícil mensuração e/ou avaliadas tardiamente nos animais, tal como o pH da carne suína. Na SG, uma vez que o número de marcadores é geralmente maior que o número de animais genotipados, e tais marcadores são altamente correlacionados (devido ao desequilíbrio de ligação), métodos estatísticos baseados na redução de dimensionalidade têm sido propostos. Dentre estes, destaca-se o Quadrados Mínimos Parciais (PLS) pela simplicidade e alta acurácia de predição. Porém, a determinação do número ótimo de componentes a ser utilizado no PLS ainda se caracteriza como um desafio para a aplicação do método. Assim, objetivou-se aplicar o PLS (e também regressões em componentes principais e a múltipla tradicional) na SG para pH da carne suína (medido aos 45min e às 24 horas após o abate), bem como identificar o número ótimo de componentes por meio dos métodos do grau de liberdade (GL) e validação cruzada (VC). O primeiro é baseado na Teoria de Informação Estatística e VC é empírica e fundamentada em amostras independentes do arquivo original. O PLS superou os demais métodos de regressão, fornecendo predições satisfatórias quando utilizadas apenas informações genotípicas (painel de SNP de baixa densidade). Além disso, os efeitos dos SNPs estimados via PLS possibilitaram identificar uma região relevante no cromossomo 4 que pode influenciar as características estudadas. Os métodos GL e VC foram similares quanto à determinação do número ótimo de componentes na análise PLS, porém o método GL pode ser recomendado devido a sua maior fundamentação estatística.

The optimal number of partial least squares components in genomic selection for pork pH / Número ótimo de componentes nos quadrados mínimos parciais aplicados à seleção genômica para pH da carne suína

The main application of genomic selection (GS) is the early identification of genetically superior animals for traits difficult-to-measure or lately evaluated, such as meat pH (measured after slaughter). Because the number of markers in GS is generally larger than the number of genotyped animals and these markers are highly correlated owing to linkage disequilibrium, statistical methods based on dimensionality reduction have been proposed. Among them, the partial least squares (PLS) technique stands out, because of its simplicity and high predictive accuracy. However, choosing the optimal number of components remains a relevant issue for PLS applications. Thus, we applied PLS (and principal component and traditional multiple regression) techniques to GS for pork pH traits (with pH measured at 45min and 24h after slaughter) and also identified the optimal number of PLS components based on the degree-of-freedom (DoF) and cross-validation (CV) methods. The PLS method out performs the principal component and traditional multiple regression techniques, enabling satisfactory predictions for pork pH traits using only genotypic data (low-density SNP panel). Furthermore, the SNP marker estimates from PLS revealed a relevant region on chromosome 4, which may affect these traits. The DoF and CV methods showed similar results for determining the optimal number of components in PLS analysis; thus, from the statistical viewpoint, the DoF method should be preferred because of its theoretical background (based on the "statistical information theory"), whereas CV is an empirical method based on computational effort.(AU)

A principal contribuição da seleção genômica (SG) é a identificação de animais geneticamente superiores para características de difícil mensuração e/ou avaliadas tardiamente nos animais, tal como o pH da carne suína. Na SG, uma vez que o número de marcadores é geralmente maior que o número de animais genotipados, e tais marcadores são altamente correlacionados (devido ao desequilíbrio de ligação), métodos estatísticos baseados na redução de dimensionalidade têm sido propostos. Dentre estes, destaca-se o Quadrados Mínimos Parciais (PLS) pela simplicidade e alta acurácia de predição. Porém, a determinação do número ótimo de componentes a ser utilizado no PLS ainda se caracteriza como um desafio para a aplicação do método. Assim, objetivou-se aplicar o PLS (e também regressões em componentes principais e a múltipla tradicional) na SG para pH da carne suína (medido aos 45min e às 24 horas após o abate), bem como identificar o número ótimo de componentes por meio dos métodos do grau de liberdade (GL) e validação cruzada (VC). O primeiro é baseado na Teoria de Informação Estatística e VC é empírica e fundamentada em amostras independentes do arquivo original. O PLS superou os demais métodos de regressão, fornecendo predições satisfatórias quando utilizadas apenas informações genotípicas (painel de SNP de baixa densidade). Além disso, os efeitos dos SNPs estimados via PLS possibilitaram identificar uma região relevante no cromossomo 4 que pode influenciar as características estudadas. Os métodos GL e VC foram similares quanto à determinação do número ótimo de componentes na análise PLS, porém o método GL pode ser recomendado devido a sua maior fundamentação estatística.(AU)

Constitutive overexpression of GmDof17-1, a putative DOF transcription factor from soybean causing growth inhibition in tobacco

The Dof proteins belong to a large family of plant transcription factors that share a single highly conserved zinc finger and play an important role in many physiological processes. To elucidate the function of Dof in soybean, GmDof17-1 was cloned from soybean (Glycine max (L.) Merr); the open reading frame (ORF) of GmDof17-1 is 846 bp and encodes a putative protein that includes 281 amino acids. Using qRT-PCR, the expression profiles of GmDof17-1 were obtained for various parts of the soybean plant. GmDof17-1 was primarily expressed in the roots and pods at various stages of pod development. The gene was ectopically expressed in tobacco under the control of the 2 × CaMV35S promoter to study the functions of the gene product. The transgenic tobacco plants showed to be dwarf, and the indole-3-acetic acid (IAA) content was decreased, whereas the sulfur-containing amino acid content of the seeds increased. These results provide new insight into the function of GmDof17-1 in seed development.

Constitutive overexpression of GmDof17-1, a putative DOF transcription factor from soybean causing growth inhibition in tobacco

The Dof proteins belong to a large family of plant transcription factors that share a single highly conserved zinc finger and play an important role in many physiological processes. To elucidate the function of Dof in soybean, GmDof17-1 was cloned from soybean (Glycine max (L.) Merr); the open reading frame (ORF) of GmDof17-1 is 846 bp and encodes a putative protein that includes 281 amino acids. Using qRT-PCR, the expression profiles of GmDof17-1 were obtained for various parts of the soybean plant. GmDof17-1 was primarily expressed in the roots and pods at various stages of pod development. The gene was ectopically expressed in tobacco under the control of the 2 × CaMV35S promoter to study the functions of the gene product. The transgenic tobacco plants showed to be dwarf, and the indole-3-acetic acid (IAA) content was decreased, whereas the sulfur-containing amino acid content of the seeds increased. These results provide new insight into the function of GmDof17-1 in seed development.(AU)

Reduction of minerals in feedlot diets of Nellore cattle: impacts on intake, performance and nutrient requirements; and prediction of chemical rib section composition by dual energy X-RAY absorptiometry in zebu cattle

O presente trabalho foi desenvolvido baseado em três estudos. O objetivo do primeiro estudo foi avaliar um novo método para estimar a composição química entre a 9 e 11ª seção das costelas (costela9-11) através de equações usando um aparelho de absorptometria radiológica de dupla energia (DXA). O DXA é um método validado usado para caracterizar a composição de tecidos em seres humanos e outros animais, mas poucos estudos avaliaram esta técnica em bovinos de corte e, especialmente, em animais Zebus. Um total de 116 costela9-11 foram utilizadas para desenvolver novos modelos de regressão usando o procedimento de validação cruzada (cross-validation). Para os modelos propostos, 93 costela9-11 foram selecionadas aleatoriamente para gerar as novas equações de regressão, e 23 costela9-11 diferentes foram selecionados aleatoriamente para validar as equações geradas. As seções da costela9-11 de carcaças foram retiradas de animais Nelore e Nelore × Angus de três diferentes experimentos e escaneadas usando o equipamento DXA (GE Healthcare, Madison, Wisconsin, EUA) na Divisão de Saúde da Universidade Federal de Viçosa. Os outputs do relatório do DXA foram DXA massa magra (g), DXA massa livre de gordura (água, proteína e matéria mineral), DXA massa gorda (g), e DXA BMC (conteúdo mineral ósseo; g). Depois de serem escaneadas, as seções das costela9-11 foram dissecadas, liofilizadas, e analisadas para EE, PB, MS e teor de cinzas. Novas equações foram estabelecidas através do procedimento de validação cruzada usando o procedimento REG do SAS. As equações foram como se segue: magro (g) = 37,082 + 0,907 × DXA magra (R2 = 0,95); massa livre de gordura (g) = 103,224 + 0,869 × DXA massa livre de gordura (R2 = 0,93); EE (g) = 122,404 + 1.119 × DXA massa gorda (R2 = 0,86); cinzas (g) = 18,722 + 1,016 × DXA BMC (R2 = 0,39). As equações foram validadas pelo teste de Mayer (teste conjunto do intercepto e inclinação), o coeficiente de correlação e concordância (CCC), e a decomposição do quadrado médio do erro predição (MSEP). Comparando valores observados e preditos usando as novas equações propostas, o teste de Mayer foi não significativo para a massa magra (P = 0,26), massa livre de gordura (P = 0,67), EE (P = 0,054), e cinzas (P = 0,14). Concluiu-se que a composição da costela9-11 de novilhos Nelore e Nelore × Angus pode ser estimada a partir do DXA usando as equações propostas. O segundo estudo foi desenvolvido utilizando novilhos Nelore desmamados (n = 36; 274 ± 34 kg) em delineamento em blocos casualizados em arranjo fatorial 2 × 2, para avaliar o consumo, a excreção fecal e desempenho com diferentes níveis de minerais na dieta de terminação. O experimento incluiu dois níveis de Ca e P (fator macro mineral; CaP+ ou CaP-) e dois níveis de micro minerais (fator micro mineral; ZnMnCu + ou ZnMnCu-). O fator CaP- foi sem suplementação de calcário e fosfato bicálcico e o fator ZnMnCu- foi sem suplementação inorgânica de micro minerais (premix). As dietas foram isoprotéicas (13,3% PB). A ingestão foi monitorada individualmente todo dia. A fibra em detergente neutro indigestível foi usada como indicador interno para calcular a digestibilidade. Os animais foram abatidos em diferentes períodos (84 e 147 dias de confinamento), características de carcaça foram medidas e amostras de fígado e ossos da costela foram retirados. Amostras de alimentos, fezes, costelas e fígado foram analisadas para MS, cinzas, PB, EE, Ca, P, e micro minerais (Zn, Mn e Cu). Não houve interação significativa (P 0,06) entre a suplementação de macro e micro minerais para todas as variáveis estudadas. Concentração de Ca, P e micro minerais na dieta não afetou (P 0,20) os consumos de MS, MO, FDN, EE, PB e CNF. Ingestão de Ca e P foram influenciados (P <0,01) pelo fator macro mineral. Animais alimentados sem suplementação de Ca e P consumiram menores quantidades destes minerais. A excreção de matéria seca e de nutrientes foram similares (P 0,23) entre os fatores estudados. Desempenho e características de carcaça foram similares (P 0,09) entre as dietas. O teor de cinzas nos ossos das costelas não foi afetado (P 0,06) pelas dietas. O fósforo e a concentração de fosfatase alcalina no plasma foram semelhantes (P 0,52) entre as dietas. A concentração plasmática de cálcio foi afetada (P < 0,01) pelo fator micro mineral; no entanto, todos os metabólitos do sangue analisados estavam dentro dos valores de referência. A excreção fecal de Ca e P foi diferente (P < 0,01) entre o fator macro mineral. Estes resultados indicam que a suplementação de minerais (Ca, P, Zn, Mn e Cu) não é necessária em dietas convencionais de confinamento para animais Nelore em terminação. A redução nas dietas destes minerais representaria uma diminuição nos custos de dietas de confinamento. Reduções nas concentrações de Ca e P na dieta pode diminuir a excreção fecal destes minerais. Diminuir a excreção fecal de P através da diminuição deste mineral na dieta é uma oportunidade para reduzir o impacto ambiental dos confinamentos. O terceiro estudo teve como objetivo avaliar o consumo de água, a composição química corporal, o consumo alimentar residual e ganho residual conjunto, e as exigências nutricionais de energia, proteína para mantença e ganho, e cálcio e fósforo para a mantença de novilhos da raça Nelore, bem como suas eficiências. Foram utilizados animais Nelore desmamados (n = 44; 273 ± 34 kg), os novilhos foram alimentados em um delineamento em blocos casualizados em arranjo fatorial 2 × 2 com ausência ou presença de suplementação mineral (Ca, P, Zn, Mn e Cu). O experimento incluiu dois níveis de Ca e P (fator macro mineral; CaP+ ou CaP-) e dois níveis de micro minerais (fator micro mineral; ZnMnCu+ ou ZnMnCu- ). As dietas foram isoprotéicas (13,3% PB). A ingestão foi monitorada individualmente todo dia. Fibra em detergente neutro indigestível foi usada como indicador interno para mensurar a digestibilidade. Quatro animais foram utilizados no grupo de referência (abatidos no dia 0); quatro novilhos foram alimentados ao nível de mantença (1,3% do peso corporal); e os 36 animais restantes foram alimentados ad libitum. Após o abate, as amostras de todo o corpo foram amostradas. Todas as amostras foram liofilizadas, moídas com nitrogênio líquido e agrupadas como percentagem do peso de corpo vazio (PCVZ) de cada animal. As amostras foram analisadas para MS, cinzas, PB, EE, Ca e P. O consumo de água foi semelhante (P 0,07) entre os tratamentos. A média de ingestão de água livre foi de 17 L/d. O consumo alimentar residual e ganho residual conjunto (GCAR) alto de touros tiveram menor CMS (P < 0,01) do que touros de baixo GCAR, mas com GMD semelhante (P = 0,82). A PB, EE e água presente no PCVZ aumentou à medida que o animal cresceu, o crescimento de cinzas foi menor do que o PCVZ. Equações de regressão não-lineares foram desenvolvidos para predizer a produção de calor, o consumo de energia metabolizável (CEM) e a energia retida (ER). As exigências líquidas de energia para mantença (ELm) e energia metabolizável para mantença (EMm) foram 66,5 e 107 kcal/PCVZ0,75/d, respectivamente. A eficiência (km) foi de 62%. A equação obtida para energia líquida para ganho (ELg) foi: ELg (Mcal/dia) = 0,0388 × PCVZ0,75 × GPCVZ1.095 e a eficiência foi de 25%. Para a proteína líquida para ganho obteve-se: PLg (g/dia) = 179,74 × GPCVZ - 5,43 × ER. A exigência de mantença líquida do Ca foi de 2,33 mg/PCVZ e de P foi de 9,10 mg/PCVZ. O coeficiente de absorção de Ca foi de 54% e do P de 64%. Em conclusão, a exigência de energia líquida para mantença de bovinos Nelore confinados é 66,5 kcal/PCVZ0,75/dia. Exigências de energia líquida para ganho e de proteína líquida para ganho podem ser obtidas através das seguintes equações: ELg (Mcal/dia) = 0,0388 × PCVZ0,75 × GPCVZ1.095 e PLg (g/dia) = 179,74 × GPCVZ - 5,43 × ER. Exigência de mantença líquida do Ca é 2,33 mg/PCVZ e para o P é 9,10 mg/PCVZ. O coeficiente de absorção do Ca é de 54% e do P é de 64%. O consumo de água não é influenciado pela suplementação de Ca, P, Zn, Mn e Cu. Animais que possuem alto consumo alimentar residual e ganho residual conjunto tem menor CMS que animais que apresentam baixo GCAR, e apresentando o mesmo ganho de peso. A PB, EE e água presente no PCVZ aumenta à medida que o animal cresce, o crescimento de cinzas não segue o mesmo padrão que o PCVZ. No geral, o consumo e o desempenho de animais Nelore em terminação confinados não foram afetados pela redução de minerais (Ca, P, Zn, Mn e Cu) na dieta. Concluiu-se que a redução dos teores de minerais em dietas de confinamento para Nelore em terminação não influencia no consumo, desempenho, composição química corporal e exigências nutricionais de bovinos Nelore terminados em confinamento.

The present work was developed based on three studies. The objective of the first study was to evaluate a method to predict the 9th to 11th rib section (rib9-11) composition through empirical equations using Dual Energy X-ray Absorptiometry (DXA). DXA is a validated method used to describe tissue composition in humans and other animals, but few studies have evaluated this technique in beef cattle, and especially in the Zebu genotype. A total of 116 rib9-11 sections were used to evaluate published prediction equations for rib9-11 composition and to develop new regression models using a cross-validation procedure. For the proposed models, 93 ribs were randomly selected to calculate the new regression equations, and 23 different ribs were randomly selected to validate the regressions. The rib9-11 sections from left carcasses were taken from Nellore and Nellore × Angus bulls from three different studies and scanned using DXA equipment (GE Healthcare, Madison, Wisconsin, USA) in the Health Division at Universidade Federal de Viçosa. The outputs of the DXA report were DXA lean (g), DXA fat free mass (g), DXA fat mass (g), and DXA BMC (bone mineral content; g). After being scanned, the rib9-11 sections were dissected, grounded, and chemically analyzed for total EE, CP, water, and ash content. The predictions of rib fat and protein from previous published equations were different (P < 0.01) from the observed composition. New equations were established through leave-one-out cross-validation using REG procedure using SAS. The equations were as follows: Lean (g) = 37.082 + 0.907× DXA lean (R2 = 0.95); Fat free mass (g) = 103.224 + 0.869 × DXA fat free mass (R2 = 0.93); EE mass (g) = 122.404 + 1.119 × DXA fat mass (R2 = 0.86); Ash mass (g) = 18.722 + 1.016 × DXA BMC (R2 = 0.39). The equations were validated using Mayers test, the concordance correlation coefficient (CCC), and the mean square error of prediction (MSEP) for decomposition. Comparing observed and predicted values using the new equations, Mayers test was not significant for lean mass (P = 0.26), fat free mass (P = 0.67), EE mass (P = 0.054), and ash mass (P = 0.14). We concluded that the rib9-11 composition of Nellore and Nellore × Angus bulls can be estimated from DXA using the proposed equations. The second study was developed using weaned Nellore bulls (n = 36; 274 ± 34 kg) in a randomized complete block 2 × 2 factorial design experiment to evaluate intake, fecal excretion and performance with different levels of minerals. The design included two ix levels of Ca and P (macro mineral factor; CaP+ or CaP-) and two levels of micro minerals (micro mineral factor; ZnMnCu+ or ZnMnCu-). The factor CaP- was without supplementation of limestone and dicalcium phosphate and the factor ZnMnCu- was without inorganic supplementation of micro minerals. The diets were isonitrogenous (13.3% CP). Intake was individually monitored every day. Indigestible NDF was used as an internal marker for fecal excretion measurements. The animals were slaughtered (84 and 147 days on feed; DOF), carcass characteristics were measured and liver and rib samples were collected. Feed, feces, rib bones and liver samples were analyzed for DM, ash, CP, EE, Ca, P, and micro minerals (Zn, Mn, and Cu). There were no significant interactions (P 0.06) between macro and micro minerals supplementation for any variables in the study. Calcium, P and micro minerals concentrations did not affect (P 0.20) intakes of DM, OM, NDF, EE, CP, TDN and NFC. Calcium and P intake were affected (P < 0.01) by macro mineral factor. Animals fed without Ca and P supplementation consumed lower levels of these minerals. Dry matter and nutrient fecal excretion were similar (P 0.23) among factors. Performance and carcass characteristics were similar (P 0.09) among diets. The content of ash in rib bones was not affected (P 0.06) by diets. Phosphorus and phosphatase alkaline plasma concentration were similar (P 0.52) among diets. Calcium plasma concentration was affected (P < 0.01) by micro mineral factor; nevertheless, all blood metabolites were within the reference values. Fecal excretion of Ca and P was different (P < 0.01) among macro mineral factor. These results indicate that supplementation of minerals (Ca, P, Zn, Mn, and Cu) is not necessary in conventional feedlot diets for finishing Nellore. Dietary reductions in these minerals would represent a decrease in the costs of feedlot diets. Dietary reductions in Ca and P decrease fecal excretion of these minerals. Decreasing the P fecal excretion through decreasing content minerals is an opportunity to reduce environmental impact of feedlot operations. The third study aimed to evaluate the water intake, the chemical body composition, the residual feed intake and gain, and the nutritional requirements of energy, protein for maintenance and gain, and calcium and phosphorus for maintenance of Nellore bulls, as well as their efficiencies. Weaned Nellore bulls (n = 44; 273 ± 34 kg) were fed in a randomized complete block design 2 × 2 factorial arrangement to evaluate the nutritional requirements with absence or presence of mineral supplementation. The design included two levels of Ca and P (macro mineral factor; CaP+ or CaP-) and two levels of micro minerals (micro mineral factor; ZnMnCu+ or ZnMnCu-). The diets were isonitrogenous (13.3% CP). Intake was individually monitored every day. Indigestible NDF was used as an internal marker for digestibility measurements. Four animals were used in the reference group (harvested d 0); four bulls were fed at the maintenance level x (1.1% of BW); and the remaining 36 bulls were fed ad libitum. Bulls are blocked by days on fed, they were slaughtered on d 84 and 147, after slaughter, samples of the whole body were taken. All samples were lyophilized, ground with liquid nitrogen and grouped as percentage of component in empty BW from each bull. Samples were analyzed for DM, ash, CP, EE, Ca, and P. The water intake was similar (P 0.07) among treatments. The average of free water intake was 17 L/d for each bull. High residual feed intake and gain (RFIG) bulls had lower DMI (P < 0.01) than low RFIG bulls, but similar ADG (P = 0.82). The CP, EE and water present in the EBW increased as the animal grew, the ash growth is lower than the EBW. Non-linear regression equations were developed to predict heat production (HP) from metabolizable energy (ME) intake and retained energy (RE). The net energy requirements for maintenance (NEm) and metabolizable energy for maintenance (MEm) were 66.5 and 107 kcal/EBW0.75/d, respectively. The efficiency (km) was 62%. The equation obtained for net energy for gain (NEg) was: NEg (Mcal/day) = 0.0388 × EBW0.75 × EBWG1.095 and the efficiency was 25%. For net protein for gain was: NPg (g/day) = 179.74 × EBWG 5.43 × RE. The net maintenance requirement for Ca was 2.33 mg/EBW and for P was 9.10 mg/EBW. The coefficient of absorption for Ca was 54% and P was 64%. In conclusion, the requirement of net energy for maintenance for Nellore feedlot cattle is 66.5 kcal/EBW0.75/day. Requirements of net energy for gain and net protein for gain can be obtained by the following equations: NEg (Mcal/day) = 0.0388 × EBW0.75 × EBWG1.095 and NPg (g/day) = 179.74 × EBWG 5.43 × RE. Net maintenance requirement for Ca is 2.33 mg/EBW and for P is 9.10 mg/EBW. The coefficient of absorption for Ca is 54% and P is 64%. The water intake is not influenced by supplementation of Ca, P, Zn, Mn, and Cu. High residual feed intake and gain bulls has lower DMI than low RFIG bulls, with similar ADG. The CP, EE and water present in the EBW increased as the animal grew, the ash growth is lower than the EBW. Overall, intake and performance was not affect by minerals (Ca, P, Zn, Mn, and Cu) diet reduction. It was concluded that the reduction of minerals contents in feedlot diets for Nellore finishing bulls appears not influence in intake, performance, chemical body composition, and nutrient requirements of Nellore finishing bulls in feedlot.

Description of the technique of upper gastrointestinal series radiological examination for the evaluation of the esophagus, stomach and duodenum of Wistar female rats / Descrição de técnica radiológica contrastada de esôfago, estômago e duodeno em ratas Wistar

PURPOSE: To evaluate the anatomy of female Wistar rats and the workability of contrast radiography as a technique to investigate the gastrointestinal series. METHODS: Eight adult female Wistar rats were undergone to the contrast radiography as anteroposterior incidence and as posterior incidence in profile. The radiological examination was conducted at a 45º angle to the radiological table. Film-focus distance (FFD) was 100 cm, film-object distance (FOD) was 0 cm, and object-focus distance (OFD) was 100 cm. An orogastric probe was used to inject barium contrast at 5-min intervals, for a total of four applications. After the radiological examination, animals were necropsy for confirmation of the radiological findings, and the radiographs were the absence of the normal anatomy variations inspected and described by an experienced radiologist. RESULTS: All the radiographs produced achieved satisfactory results in terms of position, exposure, location and quality. The upper esophageal sphincter (UES) was identified in the esophagus at the nerve C2, the lower esophageal sphincter (LES) was identified between spinal cord segments L1 and L2, the thoracic-abdominal junction was observed at T10, the esophageal-gastric junction (EGJ) at T13-L1, with the abdominal portion in the epigastric region. The stomach was observed mostly in the epigastric region, left hypochondrium, left and mesogastric flank. The duodenum findings presented higher variation, with most findings identified in the epigastric region, right hypochondrium, right flank and mesogastric ileal fossa at T13-L5. CONCLUSION: Contrast radiology is useful and may be employed to assess the anatomy of the animal being studied. The experimental model described afforded to fully identify all organs investigated, as well as other occasional relevant findings. No anatomical anomalies in the subsequent necropsy, confirming the radiographic findings.(AU)

OBJETIVO: Avaliar a anatomia normal de ratas Wistar e a viabilidade do exame contrastado nesta população. MÉTODOS: Foram submetidas ao exame oito ratas Wistar adultas, em incidência Ântero-Posterior e Perfil. A técnica consiste no posicionamento à 45º de inclinação em relação à mesa radiológica e colocado à Distância Foco Filme (DFF) de 100 cm, Distância Objeto Filme (DOF) de 0 cm, Distância Foco Objeto (DFO) de 100 cm. O contraste baritado foi injetado via sonda nasoesofágica, em intervalos de 5 minutos para cada fase, em um total de quatro fases. Após a realização do exame foi realizada necropsia dos animais para confirmação dos achados radiológicos e da ausência de variações da anatomia normal As radiografias foram analisadas e descritas por radiologista experiente no exame. RESULTADOS: Todos os exames foram satisfatórios no que se refere ao posicionamento, exposição, localização e qualidade do exame. Foi identificado o esôfago com o Esfíncter Esofágico Superior (EES) ao nível de segunda vértebra cervical (C2) e Esfíncter Esofágico Inferior (EEI) entre as vértebras lombares (L1-2), transição toracoabdominal na vértebra Torácica (T10), Junção Esôfago Gástrica em T13-L1, com a porção abdominal em região epigástrica. O estômago, predominantemente, localizou-se em região epigástrica, hipocôndrio esquerdo, flanco esquerdo e mesogástrico. O duodeno teve a maior variação, com predomínio dos achados na região epigástrica, hipocôndrio direito, flanco direito, fossa ilíaca direita e mesogástrica e ao nível de T13-L5. CONCLUSÃO: O exame contrastado pôde avaliar a anatomia normal do animal em estudo e foi identificada de forma integral em todos os órgãos avaliados com o método descrito, achados confirmados em todos os animais em necropsia subseqüente.(AU)

Determinação da idade fetal por meio da técnica ultra-sonográfica de fetometria e de morfologia fetal em cabras / Determination of fetal age in goats by real-time ultrasound fetometry and fetal morphology

Utilizaram-se 13 cabras gestantes da raça Saanen, para estudo das características da gestação a partir do 60º dia, segundo as técnicas de fetometria e avaliação morfológica fetal, utilizando-se ultra-sonografia em modo-B. Analisaram-se: diâmetro orbital (DO), diâmetro interorbital (DIO), diâmetro biorbital (DBO), diâmetro biparietal (DBP), comprimento do fêmur (CF), comprimento da tíbia (CT), comprimento do rádio (CR), diâmetro do tórax (DT), diâmetro abdominal transversal (DAT), diâmetro abdominal anteroposterior (DAP), diâmetro occípito-frontal (DOF), diâmetro transversal renal (RIMT), diâmetro longitudinal renal (RIML), comprimento da escápula (ESC), comprimento do metacarpo (MEC), medida da pelve (COX) e comprimento do úmero (CU). As médias dos valores achados foram correlacionadas com a idade fetal. As equações de regressão inversa foram criadas para cada parâmetro, sendo que DBP (R²=0,93), CF (R²=0,95), CU (R²=0,96), DO (R²= 0,84) e DAT (R²= 0,91) foram as variáveis de melhor correlação estatística, cuja equação pode ser representada pela fórmula: idade fetal = 34,5 + 4,8DBP + 9,9 CF - 7,5 CU - 2,3 DO + 6,1 DAT(AU)

Fetal morphology analysis and real-time ultrasound techniques were used on 13 pregnant Saanen goats for studying the gestational characteristics. Analysis began on the 60th day of pregnancy and the parameters observed were: orbital diameter (OD), inter-orbiall diameter (IOD), bi-orbital diameter (BOD), bi-parietal diameter (BPD), femoral length (FL), tibial length (LT), radius length (RL), thoracic diameter (TD), transversal abdominal diameter (TAD), anteroposterior abdominal diameter (APAD), occipital-frontal diameter (OFD), transversal renal diameter (TRD), longitudinal renal diameter (LRD), scapular length (SL), metacarpal length (ML), pelvic length (PL) and humeral length (HL). Mean values were correlated to fetal age and inverse regression equations were created for each parameter. Results obtained showed BPD (R²=0.93), FL (R²=0.95), HL (R²=0.96), OD (R²= 0.84) and TAD (R²= 0.91) as the parameters with better statistical correlation to fetal age using the equation: Fetal age = 34.5 + 4.8BPD + 9.9 FL - 7.5 HL - 2.3 OD + 6.1 TAD(AU)

Sincronização da ovulação para a inseminação artificial em tempo fixo (IATF) durante a estação reprodutiva desfavorável em fêmeas bubalinas / Synchronization of ovulation for fixed-time artificial insemination (FTAI) during the off breeding season in buffalo

Foram comparadas diferentes doses de eCG e hCG associadas a dispositivos intravaginais de progesterona (DIV), para avaliar o crescimento folicular e a ovulação, bem como a taxa de prenhez após a IATF e a funcionalidade do CL 12 dias após a sincronização em búfalas, durante a estação reprodutiva desfavorável. Para tanto, foram realizados cinco experimentos. Nos experimentos 1, 2 e 4, os grupos foram estabelecidos em função da ciclicidade dos animais, avaliada pelas concentrações plasmáticas de progesterona mediante colheita de sangue por punção da veia jugular no D-10 e no D0. Nos experimentos 3 e 5, os grupos foram estabelecidos em função da condição corporal e da ordem de parto. Em todos os experimentos as búfalas receberam um DIV associado a 2mg de Benzoato de Estradiol (BE) no D0. No D9 o DIV foi retirado, e procedeu-se à administração de 0,150mg de prostaglandina (PGF). No experimento 1, as búfalas do G1 (Controle, n=9) e do G2 (eCG, n=10) receberam 1500UI de hCG no D11; o G2 recebeu também 500UI de eCG no D-9; a IATF foi realizada no D12. Nesse experimento, o diâmetro máximo do folículo dominante (DMFD) foi de 12,6 ± 3,0 e 13,4 ± 1,7mm para o G1 e o G2, respectivamente (P>0,05); o diâmetro do folículo ovulatório (DFO) foi de 14,9 ± 2,9 (G1) e de 14,0 ± 1,6mm (G2; P>0,05); o intervalo entre a retirada do DIV e a ovulação (IROV) foi de 78,0 ± 12 (G1) e 68,0 ± 9,0h (G2; P>0,05); a taxa de ovulação (TO) foi de 44,4 (G1) e 70,0% (G2; P> 0,05). A área do CL (ACL) foi de 31,6 ± 19,9 (G1) e de 29,9 ± 9,7mm2 (G2; P>0,05); a concentração plasmática de P4 (P4) foi de 1,3 ± 1,4 (G1) e 2,0 ± 1,6ng/ml (G2; P>0,05); a taxa de prenhez (TP) foi de 22,2 (G1) e 60% (G2; P=0,11). No experimento 2, as búfalas do G1 (1500 UI de hCG; n=21) e do G2 (1000UI de hCG; n=21) receberam 500UI de eCG no D9; no D11, o G1 recebeu 1500UI de hCG e o G2 1000UI de hCG. Os resultados desse experimento são relatados a seguir: DMFD de 12,4 ± 2,3 (G1) e 12,2 ± 2,5mm (G2; P>0,05); DFO de 12,6 ± 2,3 (G1) e 12,5 ± 2,7mm (G2; P>0,05); IROV de 67,7 ± 18,1 (G1) e 72,8 ± 16,7h (G2; P>0,05); TO de 67,7 (G1) e 67,7% (G2; P>0,05); ACL de 24,8 ± 9,2 (G1) e 28,3 ± 17,2mm2 (G2; P>0,05); P4 de 2,3 ± 1,4 (G1) e 2,4 ± 1,3ng/ml (G2; P>0,05). No experimento 3, os animais foram tratados de forma idêntica àqueles do experimento 2, porém as búfalas do G1 (n=83) e do G2 (n=91) receberam a IATF no D12. Nesse experimento, foi obtida TP de 53 (G1) e de 53,8% (G2; P>0,05). No Experimento 4, as búfalas do G1 (n=10) receberam 500UI e as do G2 (n=11) 400UI de eCG; os dois grupos receberam 1000UI de hCG no D11. Esse experimento teve como resultados: DMFD de 13,2 ± 1,4 (G1) e 13,8 ± 1,8mm (G2; P>0,05); DFO de 13,7 ± 1,1 (G1) e 14,2 ± 1,5mm (G2; P>0,05); IROV de 71,1 ± 11,7 (G1) e 75,0 ± 5,5h (G2; P>0,05); TO de 70,0 (G1) e 72,7% (G2; P>0,05); ACL de 28,4 ± 8,6 (G1) e 31,6 ± 10,3mm2 (G2; P>0,05); P4 de 2,7 ± 1,2 (G1) e 3,3 ± 2,9ng/ml (G2; P>0,05). No experimento 5 (G1/n=54; G2/n=51) foi adotado o mesmo protocolo do experimento 4, porém as búfalas receberam a IATF no D12. Esse experimento resultou em TP de 42,6 (G1) e 43,1% (G2; P>0,05). Assim, foi possível concluir que as concentrações de 400UI de eCG e de 1000UI de hCG, associadas ao DIV, foram suficientes para induzir o crescimento folicular, a ovulação e a prenhez em búfalas durante o período reprodutivo desfavorável

Different dosage of eCG and hCG were compared in association to progesterone intravaginal device (IVD) in female buffalo during the off breeding season with the purpose of evaluating the follicular growing and ovulation as well as the pregnancy rate after FTAI and functionality of the CL, twelve days after the synchronization. For this, 5 experiments were done. For the establishments of the groups in the experiments 1,2 and 4 blood samples were collected for the analysis of plasmatic concentrations of P4 on D -10 and D0 to verify the cyclicity. In the experiments 3 and 5 the groups were established due body condition score and number of calving. In all the experiments the buffaloes received a IVD associated with 2mg of estradiol benzoate (EB) on D0. On D9 the IVD was extracted and it was followed by the administration of 0,150mg of prostaglandin (PGF). In the exp. 1 the buffaloes of G1 (control, n=9) and G2 (eCG, n=10) received 1500IU of hCG on D11. On G2 was administrated 500IU of eCG on D9. The FTAI was done on D12. The maximun diameter of dominant follicle (MDDF) was 12.6 ± 3.0 and 13.4 ± 1.7mm to the G1 and G2, respectively (P>0,05). The diameter of the ovulatory follicle (DOF) was 14.9 ± 2.9 (G1) and 14.0 ± 1.6mm (G2; P>0,05). The interval between the device withdrawn and ovulation (DWO) was 78.0 ± 12.0 (G1) and 68.0 ± 9.0h (G2; P>0,05). The ovulation rate (OR) was 44.4 (G1) and 70.0% (G2; P>0,05). The CL area (CLA) was 31.6 ± 19.9 (G1) and 29.9 ± 9.7mm2 (G2; P>0,05). The plasmatic concentration of P4 (P4) was 1.3 ± 1.4 (G1) and 2.0 ± 1.6ng/ml (G2; P>0,05). The pregnancy rate (PR) was 22.2 (G1) and 60% (G2; P=0,11). In the exp. 2 the buffalo females of G1 (1500IU of hCG; n=21) and G2 (1000IU of hCG; n=21) received 500IU of eCG on D9. On D11, G1 received 1500IU of hCG and G2 1000IU of hCG. The MDDF was 12.4 ± 2.3 (G1) and 12.2 ± 2.5mm (G2; P>0,05), the DOF was 12.6 ± 2.3 (G1) and 12.5 ± 2.7mm (G2; P>0,05), DWO was 67.7 ± 18.1 (G1) and 72.8 ± 16.7h (G2; P>0,05), the OR was 67.7 (G1) and 67.7% (G2; P>0,05), the CLA was 24.8 ± 9.2 (G1) and 28.3 ± 17.2mm2 (G2; P>0,05) and the P4 was 2.3 ± 1.4 (G1) and 2.4 ± 1.3ng/ml (G2; P>0,05). The exp. 3 was identical to exp.2, although the animals of G1 (n=83) and G2 (n=91) received the FTAI on D12. The PR was 53.0 (G1) and 53,8% (G2; P>0,05). In exp. 4, the animals of G1 (n=10) received 500IU and G2 (n=11) 400IU of eCG. Both groups received 1000IU of hCG on D11. The MDDF was 13.2 ± 1.4 (G1) and 13.8 ± 1.8mm (G2; P>0,05), the DOF was 13.7 ± 1.1 (G1) and 14.2 ± 1.5mm (G2; P>0,05), the DWO was 71.1 ± 11.7 (G1) and 75.0 ± 5.5h (G2; P>0,05), the OR was 70.0 (G1) and 72.7% (G2; P>0,05), the CLA was 28.4 ± 8.6 (G1) and 31.6 ± 10.3mm2 (G2; P>0,05) and the P4 was 2.7 ± 1.2 (G1) and 3.3 ± 2.9ng/ml (G2; P>0,05). In exp. 5 (G1/n=54; G2/n=51) was done the same protocol in the exp. 4, although the animals received the FTAI on D12. The PR was 42.6 (G1) and 43.1% (G2; P>0,05). Dosage of 400IU of eCG and 1000IU of hCG, associated to IVD for FTAI were enough to induce follicular growing, ovulation and pregnancy in buffalo females during the off breeding season