Evaluación de dos técnicas fenotípicas y un panel molecular multiplex comercial para la detección de diferentes carbapenemasas / Evaluation of two phenotypic techniques and a commercial multiplex molecular panel for the detection of different carbapenemases

ras de carbapenemasas ha aumentado en los últimos años, considerándose un importante problema de salud pública. Material y métodos. Se analizaron 106 muestras por distintas técnicas de detección de carbapenemasas: discos de inhibición (DI), test inmunocromatográfico (TIC) y una técnica genotípica, frente a una RT-PCR multiplex como método de referencia. Resultados. Globalmente, las 3 técnicas superaron el 90% de sensibilidad, aunque con diferencias en el rendimiento de algunas de ellas por tipos de carbapenemasa. Los DI presenta ron baja especificidad (62%) para OXA-48, mientras que con el TIC la sensibilidad para metalobetalactamasas tipo NDM (93%) fue ligeramente inferior que para OXA-48 (95%). Los mejores resultados se obtuvieron con la técnica genotípica (rendimien to global del 100%). Conclusiones. A pesar de la menor sensibilidad de los TIC respecto a las técnicas moleculares, especialmente en carba penemasas tipo NDM, con la modificación del protocolo con seguimos aumentar esta sensibilidad, y junto al menor precio, sencillez y rapidez convierte a esta técnica en una buena op ción de screening (AU)

Introduction. The prevalence of carbapenemase-produc ing Enterobacterales has increased in recent years and is con sidered an important public health problem. Material and methods. A total of 106 clinical samples were analyzed by different carbapenemase detection tech niques: inhibition discs (ID), immunochromatographic test (ICT) and a genotypic method, comparing them with a multi plex RT-PCR as a reference method. Results. Overall, all 3 techniques exceeded 90% sensitiv ity, although with differences in the performance of some of them by carbapenemase type. DI had low specificity (62%) for OXA-48, while with TIC the sensitivity for NDM-type metal lo-beta-lactamase (93%) was slightly lower than for OXA-48 (95%). The best results were obtained with the genotypic tech nique (100% overall performance). Conclusions. Despite the lower sensitivity of TICs (espe cially in NDM carbapenemases) compared to molecular tech niques, with the modification of the protocol we managed to increase this sensitivity and, together with the lower price, simplicity and speed, it makes this technique a good screening option (AU)

Evaluation of five immunoassays and one lateral flow immunochromatography for anti-SARS-CoV-2 antibodies detection / Evaluación de cinco inmunoensayos y una inmunocromatografía de flujo lateral para la detección de anticuerpos anti-SARS-CoV-2

Introduction: In order to deal with the current pandemic caused by the novel SARS-CoV-2 coronavirus several serological immunoassays have been recently developed with the objective of being used as a complementary diagnostic tool and to support the RT-PCR technique currently considered the “gold-standard” method. However, these new assays need to be evaluated and validated. The purpose of this study was to assess the performance of five immunoassays (two ELISA and three CLIA assays) and one rapid immunochromatographic test for the detection of anti-SARS-CoV-2 antibodies. Methods: Five semiquantitative immunoassays (MENARINI®, PALEX®, VIRCLIA®, ROCHE® and SIEMENS®) and one lateral flow rapid test (WONDFO®) were performed. A total of 124 samples were studied. Case serum samples (n=78) were obtained from COVID-19 patients confirmed by real-time RT-PCR/epidemiological-clinical-radiological criteria, and control non-SARS-CoV-2 samples (n=46) belonged to healthy healthcare workers involved in a seroprevalence study. Results: Overall, the tests showed sensitivities around 70–90% and specificities greater than 95%, including the immunochromatographic test. In addition, we observed very good agreements among them, being better for the detection of IgG than for IgM antibodies (Cohen's kappa index of 0.95 for VIRCLIA® IgG with ROCHE®), as well as good diagnostic power of the tests as determined by the ROC curves. Conclusions: This study demonstrates the proper performance of the different immunoassays in order to be applied in the clinical practice as support in the diagnostic approach and in the development of vaccines and seroepidemiological studies of COVID-19.(AU)

Introducción: Para hacer frente a la pandemia actual causada por el nuevo coronavirus SARS-CoV-2 se han desarrollado recientemente varios inmunoensayos serológicos con el objetivo de ser utilizados como herramienta diagnóstica complementaria y apoyar la técnica de RT-PCR actualmente considerada como el “estándar de oro”. Sin embargo, estos nuevos ensayos deben evaluarse y validarse. El objetivo de este estudio fue evaluar cinco inmunoensayos (dos ELISA y tres ensayos CLIA) y una prueba inmunocromatográfica rápida para la detección de anticuerpos anti-SARS-CoV-2. Métodos: Se utilizaron cinco inmunoensayos semicuantitativos (MENARINI®, PALEX®, VIRCLIA®, ROCHE® y SIEMENS®) y un test de inmunocromatografía rápida (WONDFO®). Se estudiaron un total de 124 muestras. Las muestras de suero (n=78) se obtuvieron de pacientes COVID-19 confirmados por RT-PCR en tiempo real/criterios epidemiológicos-clínico-radiológicos. Las muestras control negativas (n=46) pertenecieron a personal sanitario involucrado en un estudio de seroprevalencia. Resultados: En general, las pruebas mostraron sensibilidades en torno al 70-90% y especificidades superiores al 95%, incluso la prueba inmunocromatográfica. Además, observamos muy buenas concordancias entre ellas, presentando mayores sensibilidades para la detección de anticuerpos IgG que para IgM (índice kappa de Cohen de 0,95 para VIRCLIA® IgG con ROCHE®), así como un buen poder diagnóstico de las técnicas determinado por las curvas ROC. Conclusiones: Este estudio demuestra el buen rendimiento de los diferentes inmunoensayos para ser empleados en la práctica clínica como apoyo en el proceso de diagnóstico, en el desarrollo de vacunas y estudios seroepidemiológicos de COVID-19.(AU)

Evaluation of a lateral flow immunoassay to detectCTX-M extended-spectrum B-lactamases (ESBL)directly from positive blood cultures for its potentialuse in Antimicrobial Stewardship programs / Evaluación de una inmunocromatografía paradetectar beta-lactamasas de espectro extendidoCTX-M directamente de hemocultivos positivospara su potencial uso en programas deoptimización de antibioterapia

Background. Bloodstream infections (BSI) caused by extended-spectrum beta-lactamases Enterobacteriaceae (ESBL-E) are associated with high rates of treatment failure andincreased mortality, especially when appropriate antimicrobialtherapy is delayed. Our aim was to evaluate the anticipationof ESBLs detection and the potential improvement of the timeresponse of the Vitek 2 System (BioMérieux; France).Methods. We compared this lateral flow immunoassaywhen used directly on fluid from positive blood cultures to theVITEK2 AST system. We evaluated 80 isolates, 61 tested directlyon fluid from positive blood cultures and 19 tested on fluidfrom blood cultures spiked with known ESBL positive and negative organisms.Results. The concordance between the CTX-LFIA and thereference method (Vitek 2) had a Cohen´s Kappa coefficient of0.97, indicating a particularly good correlation between bothcompared methods.Conclusion. This lateral flow immunoassay can be morerapid than the Vitek 2 for earlier presumptive identification ofCTX- M ESBLs and can be useful to anticipate results and theadjustment of antimicrobial therapy. (AU)

Antecedentes. Las bacteriemias causadas por Enterobacteriaceae productoras beta-lactamasas de espectro extendido(BLEE) están asociadas con altas tasas de fallo de tratamientoy mortalidad, especialmente cuando se retrasa el tratamientoapropiado. Nuestro objetivo ha sido evaluar la anticipación dela detección de estas BLEE y la potencial mejora en el tiempode respuesta respecto al VITEK2 System (Biomerieux; Francia).Métodos. Se comparó una inmunocromatografía para sudetección con el VITEK2 AST system directamente del hemocultivo. Se evaluaton 80 aislados, 61 evaluados directamentede hemocultivos positivos y 19 de la misma manera pero inoculados con microorganismos productores y no productores deBLEE.Resultados. La concordancia entre la inmunocromatografía y el VITEK2 AST mostró un coeficiente Kappa de 0,97,indicando una buena correlación entre ambas técnicas.Conclusión. Esta inmunocromatografía puede ser másrápida que el VITEK2 para una identificación de BLEE tipo CTXM y puede ser útil para anticipar resultados y ajustar la terapiaantimicrobiana. (AU)

Tyrophagus putrescentiae group 4 allergen allergenicity and epitope prediction

INTRODUCTION AND OBJECTIVES: Allergen-specific immunotherapy (ASIT) is the only allergic disease-modifying therapy available for children and adults, and recombinant allergens are an interesting approach to improve allergy diagnosis and ASIT. Tyrophagus putrescentiae is a common storage mite that produces potent allergens. The aim of this study was to express and characterize recombinant group 4 allergen protein of T. putrescentiae (Tyr p 4), and to further investigate allergenicity and potential epitopes of Tyr p 4. MATERIALS AND METHODS: The cDNA encoding Tyr p 4 was generated by RT-PCR and subcloned into pET-28a(+) plasmid. The plasmid was then transformed into E. coli cells for expression. After purification by nickel affinity chromatography and identification by SDS-PAGE, recombinant Tyr p 4 protein was used for a skin prick test and an ELISA to determine the allergic response. RESULTS: Study participants' allergic response rate to Tyr p 4 protein was 13.3% (16/120). Eight B-cell epitopes and three T-cell epitopes of Tyr p 4 were predicted. CONCLUSIONS: Similar to group 4 allergens of other species of mite, allergenicity of Tyr p 4 is weak. The expression, characterization and epitope prediction of recombinant Tyr p 4 protein provide a foundation for further study of this allergen in the diagnosis and ASIT of storage mite allergy

No disponible

Detección viral y respuesta serológica en pacientes críticos intubados con SARS-CoV-2. Implicaciones para retirada de aislamiento / Viral detection and serological response in critically ill patients with sars-cov-2. implications for isolation withdrawa

No disponible

Primera encuesta nacional sobre el diagnóstico de la infección por Helicobacter pylori en los laboratorios de microbiología clínica en España / First national survey of the diagnosis of Helicobacter pylori infection in Clinical Microbiology Laboratories in Spain

INTRODUCCIÓN: El objetivo de este trabajo fue conocer, mediante una encuesta nacional, los métodos y técnicas empleados para el diagnóstico de Helicobacter pylori (Hp) en los distintos servicios/laboratorios de microbiología clínica en España, así como datos de resistencia antibiótica. MÉTODOS: En la encuesta se preguntaba sobre los métodos de diagnóstico realizados (serología, detección de antígeno en heces, cultivo de biopsias gástricas y PCR) y por la realización de pruebas de sensibilidad antibiótica. También fueron solicitados el número de muestras procesadas en 2016, la positividad de cada técnica empleada y porcentajes de resistencia antibiótica. La encuesta fue enviada por correo electrónico entre octubre y diciembre de 2017 a los responsables de 198 laboratorios de microbiología clínica. RESULTADOS: En total, 51 centros de 29 provincias respondieron a la encuesta y 48 de ellos realizaban algún tipo de técnica de diagnóstico de Hp en su laboratorio. En cuanto a las técnicas empleadas, el cultivo de biopsia gástrica fue el más utilizado (37/48), seguido de la detección de antígeno en heces (35/48), la serología (19/48) y la PCR (5/48). Respecto a la sensibilidad antibiótica, se observaron altas tasas de resistencia, especialmente a metronidazol y claritromicina (superiores al 33%). CONCLUSIÓN: El cultivo de biopsia gástrica fue la técnica diagnóstica de Hp utilizada por más centros, mientras que la detección de antígeno en heces mediante inmunocromatografía fue con la que se analizaron el mayor número de muestras. En España, en la actualidad, es preocupante el aumento de resistencia de Hp a antibióticos de «primera línea»

INTRODUCTION: The aim of this study was to know, through a national survey, the methods and techniques used for the diagnosis of Helicobacter pylori (Hp) in the different Clinical Microbiology Services/Laboratories in Spain, as well as antibiotic resistance data. METHODS: The survey requested information about the diagnostic methods performed for Hp detection in Clinical Microbiology laboratories, including serology, stool antigen, culture from gastric biopsies, and PCR. In addition, the performance of antibiotic susceptibility was collected. Data on the number of samples processed in 2016, positivity of each technique and resistance data were requested. The survey was sent by email (October-December 2017) to the heads of 198 Clinical Microbiology Laboratories in Spain. RESULTS: Overall, 51 centers from 29 regions answered the survey and 48/51 provided Hp microbiological diagnostic testing. Concerning the microbiological methods used to diagnose Hp infection, the culture of gastric biopsies was the most frequent (37/48), followed by stool antigen detection (35/48), serology (19/48) and biopsy PCR (5/48). Regarding antibiotic resistance, high resistance rates were observed, especially in metronidazole and clarithromycin (over 33%). CONCLUSION: Culture of gastric biopsies was the most frequent method for detection of Hp, but the immunochromatographic stool antigen test was the one with which the largest number of samples were analyzed. Nowadays, in Spain, it concerns the problem of increased antibiotic resistance to 'first-line' antibiotics

Detection of Salmonella enterica in stool of immunosuppressed patients using two point of care techniques / Detección en heces de Salmonella enterica en pacientes inmunodeprimidos usando dos técnicas "point of care"

No disponible

Reflexiones sobre la utilidad de NT-proBNP como biomarcador pronóstico en pacientes con síndrome gripal / On the usefulness of brain natriuretic peptide as a prognostic biomarker in patients with influenza syndrome

No disponible

Recomendaciones del Grupo Español de Trabajo en Enfermedad de Crohn y Colitis Ulcerosa (GETECCU) sobre la utilidad de la determinación de calprotectina fecal en la enfermedad inflamatoria intestinal / Recommendations of the Spanish Working Group on Crohn's Disease and Ulcerative Colitis (GETECCU) on the utility of the determination of faecal calprotectin in inflammatory bowel disease

Actualmente, el manejo de la enfermedad inflamatoria intestinal (EII) se basa en la evaluación objetiva de las lesiones intestinales. Por ello, es de interés disponer de herramientas sencillas y no invasivas con las que monitorizar la actividad de la EII e identificar la presencia de lesiones. La calprotectina fecal (CF) constituye la principal proteína citosólica de los neutrófilos, es resistente a la degradación bacteriana y estable a temperatura ambiente durante días, características que la hacen adecuada para su uso en la práctica clínica. Es útil para diferenciar entre procesos inflamatorios y funcionales, se correlaciona con la actividad endoscópica, se asocia con la respuesta clínica y endoscópica al tratamiento y tiene valor pronóstico a corto plazo. El presente documento pretende ofrecer una visión actualizada sobre la información que la CF puede proporcionar al clínico en el diagnóstico, la monitorización y el manejo de la EII

The management of inflammatory bowel disease (IBD) is currently based on the objective evaluation of intestinal lesions. It would therefore be interesting to have access to simple and non-invasive tools to monitor IBD activity and to identify the presence of lesions. Faecal calprotectin (FC) is the main cytosolic protein of neutrophils, it is resistant to bacterial degradation and it is stable at room temperature for several days, characteristics that make it suitable for use in clinical practice. It can be used to differentiate between inflammatory and functional processes, it correlates with endoscopic activity, it is associated with clinical and endoscopic response to treatment and it has short-term prognostic value. This paper offers an up-to-date perspective on the information that FC can provide clinicians to aid diagnosis, monitoring and management of IBD

Problemas clínicos en micología médica: problema número 51 / Clinical problems in medical mycology: problem number 51

No disponible

A 48 year-old immunocompetent woman, who had a nodular lesion in the neck and a dense infiltrate at the lower lobe of the left lung, presented at the Mycology Unit of Muñiz Hospital of Buenos Aires City. The pulmonary infiltrate disappeared spontaneously 3 months later. The histopathological study of the nodular lesion showed capsulated yeasts (mucicarmin and alcian blue positive stains) compatible with Cryptococcus. The mycological study of a new sample, obtained by a nodular puncture, allowed the isolation of yeasts, identified as Cryptococcus gattii (VGII). Latex test for Cryptococcus capsular antigen in serum was positive (1/100). CSF cultures rendered negative results. Fluconazole at a daily dose of 800mg was given during 45 days with partial improvement; as cultures from a new clinical sample were positive for Cryptococcus, the antimycotic was changed to itraconazole 400mg/day for 5 months, with an excellent clinical response (AU)

Diagnóstico microbiológico de las infecciones causadas por el género Mycobacteriu / Microbiological diagnosis of infections caused by the genus Mycobacterium

El cultivo de micobacterias es la prueba de referencia, y la más sensible, en el diagnóstico microbiológico de la tuberculosis y de las infecciones por micobacterias no tuberculosas. Sin embargo, requiere al menos 2-3 semanas para ser positivo. La tinción, rápida, aunque poco sensible, actúa como un complemento. Las pruebas de amplificación genética tienen una sensibilidad intermedia y obtienen resultados en 1-2 días. Estas últimas están indicadas cuando el grado de sospecha es moderado o alto. En pacientes infectados por el VIH con inmunodepresión severa (<200 CD4) puede ser útil la detección de antígeno lipoarabinomanano en orina. La identificación de los aislamientos de los cultivos positivos es imprescindible para evaluar la significación clínica y la orientación terapéutica. Actualmente se dispone de un abanico de técnicas de identificación que facilitan resultados en periodos de solo 1-4 días. El futuro del diagnóstico pasa por un mayor desarrollo de las técnicas de amplificación genética y por potenciar la búsqueda de biomarcadores que permitan un nuevo enfoque del diagnóstico de estas infecciones (AU)

Mycobacterial culture has a high sensitivity and is the test of choice for the microbiological diagnosis of tuberculosis and nontuberculous mycobacterial infections. However, the results of this culture require at least 2-3 weeks to obtain positivity. Staining is rapid and can be used as a complementary study, although its sensitivity is low. Gene amplification tests have an intermediate sensitivity and obtain results in 1-2 days. These last tests are indicated in cases with moderate or high clinical suspicion. In HIV patients with severe immunodeficiency (<200 CD4), lipoarabinomannan antigen detection in urine may be useful. The identification of isolates from positive cultures is essential to evaluate the clinical significance of the culture results and consider the therapeutic options available. At present, there is a wide range of identification techniques available, which provide results within just 1-4 days. The future of diagnostic techniques in tuberculosis and nontuberculous mycobacterial infections lies in greater development of gene amplification techniques and promoting the search for biomarkers which enable a new approach to the diagnosis of these infections (AU)

Reduced thrombin activatable fibrinolysis inhibitor and enhanced proinflammatory cytokines in acute coronary syndrome / Reducción del inhibidor de la fibrinólisis activado por trombina y aumento de las citocinas proinflamatorias en pacientes son síndrome coronario agudo

Objective: A study was made of the changes in the serum levels of thrombin activatable fibrinolysis inhibitor (TAFI), proinflammatory cytokines and acute phase proteins in the acute stage of acute coronary syndrome (ACS), in order to explore the possibility of using TAFI as a biomarker for ACS risk assessment. Methods: A total of 211 patients with ACS were enrolled, and healthy subjects were used as controls. Blood samples were taken within 24h after admission. Serum TAFI levels were determined by immunoturbidimetry. Serum levels of interleukin-1β (IL-1β), interleukin-6 (IL-6) and tumor necrosis factor-alpha (TNF-α) were determined by enzyme linked immunosorbent assay (ELISA). Procalcitonin (PCT) and C-reactive protein (CRP) levels were measured by gold-immunochromatographic assay. Results: Serum TAFI levels in ACS patients were significantly decreased versus the controls. The IL-1β, IL-6, TNF-α, PCT and CRP levels were markedly higher in the ACS patients than in the controls. Correlation analysis revealed a strong negative correlation between TAFI concentration and the IL-1β, IL-6, TNF-а, PCT and CRP levels in ACS patients and in controls. Multivariate logistic regression analysis suggested decreased serum TAFI to be an independent risk factor for ACS (OR 9.459; 95% CI 2.306-38.793; P=0.002). The area under the receiver operating characteristic (ROC) curve for TAFI was 0.872 (95% CI 0.787-0.909; P<0.001). The optimum TAFI cutoff point for the prediction of ACS was 24μg/ml, with a sensitivity of 75.83% and a specificity of 72.57%. Conclusion: These findings suggest that TAFI can be useful as a potential biomarker for ACS risk assessment (AU)

Objetivo: Esta investigación se ha diseñado para analizar el cambio en las concentraciones séricas del inhibidor de la fibrinólisis activado por trombina (TAFI), las citocinas proinflamatorias y las proteínas de la fase aguda en pacientes con síndrome coronario agudo (SCA) con el fin de explorar la posibilidad de utilizar TAFI como biomarcador para evaluar el riesgo de SCA. Métodos: Se incluyó un total de 211 pacientes diagnosticados de SCA y se seleccionó a voluntarios sanos como controles. Se extrajeron muestras de sangre de 24h después de la admisión. La concentración sérica de TAFI se determinó mediante inmunoturbidimetría. Las concentraciones séricas de interleucina (IL)-1β, IL-6 y factor alfa de necrosis tumoral se determinaron mediante ensayo de inmunoabsorción enzimática. Las concentraciones de procalcitonina y de proteína C reactiva se evaluaron mediante ensayo inmunocromatográfico. Resultados: La concentración sérica de TAFI en los pacientes con SCA fue significativamente menor que en el grupo control. Las concentraciones de IL-1β, IL-6, factor alfa de necrosis tumoral, procalcitonina y proteína C reactiva fueron notablemente mayores en los pacientes con SCA que en el grupo control. Un análisis de correlación mostró que existía una sólida correlación negativa entre la concentración de TAFI y las concentraciones de IL-1β, IL-6, factor alfa de necrosis tumoral, procalcitonina y proteína C reactiva, tanto en los pacientes con SCA como en los del grupo control. El análisis de regresión logística multivariante evidenció que la disminución de la concentración sérica de TAFI constituía un factor de riesgo independiente de SCA (OR 9,459; IC 95% 2,306-38,793; p=0,002). El área bajo la curva de eficacia diagnóstica (curva ROC) del TAFI fue de 0,872 (IC 95% 0,787-0,909; p=0,001). El punto de corte óptimo del TAFI para la predicción del SCA fue de 24μg/ml, con una sensibilidad del 75,83% y una especificidad del 72,57%. Conclusión: Estos hallazgos evidencian que el TAFI constituye un posible biomarcador del riesgo de SCA (AU)

Comparación de las características clínicas y diagnósticas de los subgrupos A y B del virus respiratorio sincitial / Comparison of clinical features and diagnosis between the A and B subgroups of respiratory syncytial virus

Fundamento: La infección del tracto respiratorio inferior por virus respiratorio sincitial (VRS) es la causa más frecuente de ingreso en menores de 2 años. Los subgrupos de VRS A y B pueden circular indistintamente. Nuestro objetivo fue determinar si existían diferencias clínicas entre los VRS subgrupo A y B, y si la sensibilidad del test de detección rápida de antígeno del VRS por inmunocromatografía difiere de la técnica de referencia (RT-PCR). Material y métodos: Estudio retrospectivo, observacional realizado en el hospital terciario desde octubre de 2013 a marzo de 2014. Se consultó la historia clínica y las analíticas de los niños menores de 5 años ingresados en por infección respiratoria de vías bajas con RT-PCR positivo a VRS en una muestra de lavado nasal. De la misma muestra previamente se había realizado el test de detección rápida de antígeno de VRS. Resultados: Se confirmaron 198 niños menores de 5 años para VRS mediante RT-PCR: 55 (28%) fueron VRS-A, 132 (67%) VRS-B y 11 (5%) fueron positivos para ambos subgrupos. No encontramos diferencias entre subgrupos en antecedentes, clínica, radiología, analítica y gravedad. La sensibilidad del test de detección rápida fue 52%, mayor para VRS-A (69%) que para VRS-B (44%, p=0,001). Conclusiones: Los dos subgrupos de VRS fueron indistinguibles por su presentación clínica y pronóstico. La sensibilidad del test rápido en comparación con la RT-PCR fue baja, lo que limita su utilidad en la toma de decisiones clínicas (AU)

Background: Lower respiratory tract infection by respiratory syncytial virus (RSV) is the most frequent cause of admission in children under 2 years old. The RSV subgroups A and B may circulate simultaneously. We aimed to determine whether clinical differences exist between RSV subgroups A and B. Additionally, we tested the sensitivity of the rapid antigen detection test (RADT) based on immunochromatography in diagnosing subgroups A and B, taking the polymerase chain reaction assay (RT-PCR) as reference. Methods: A retrospective observational study was performed in a tertiary hospital from October 2013 to March 2014. Clinical records and analytical variables of all children under 5 admitted with lower respiratory tract infection and RT-PCR positive for RSV in nasal lavage were consulted. Previously, the RADT for RSV had been performed from the same sample. Results: A total of 198 children under 5 were diagnosed with RSV by RT-PCR: 55 (28%) were RSV-A, 132 (67%) RSVB and 11 (5%) were positive for both subgroups. No differences were observed between subgroups in medical history, symptoms, radiological and analytical findings, and severity. The sensitivity of RADT for RSV was 52%, higher for RSV-A (69%) than for RSV-B (44%, p=0.001). Conclusions: The two RSV subgroups were indistinguishable in symptoms and prognosis. The sensitivity of RADT compared to RT-PCR was low and limits its usefulness for clinical decision-making (AU)

Métodos rápidos para la detección de la resistencia bacteriana a antibióticos / Rapid methods for detection of bacterial resistance to antibiotics

Los métodos más frecuentemente utilizados en Microbiología Clínica para la determinación de la sensibilidad de las bacterias a los antibióticos se basan en un estudio fenotípico, observando el crecimiento bacteriano de una cepa incubada en presencia del antibiótico a estudiar. Estos métodos requieren normalmente un tiempo de unas 24h para la obtención de resultados. En esta revisión se exponen el fundamento y los resultados de las principales técnicas instrumentales que proporcionan un antibiograma rápido. De manera pormenorizada se exponen datos relativos a técnicas moleculares, microarrays, métodos comerciales utilizados en el trabajo de rutina, técnicas inmunocromatográficas, métodos colorimétricos, métodos de imagen, nefelometría, espectrometría de masas MALDI-TOF, citometría de flujo, quimioluminiscencia y bioluminiscencia, microfluidos y métodos de lisis bacteriana

The most widely used antibiotic susceptibility testing methods in Clinical Microbiology are based on the phenotypic detection of antibiotic resistance by measuring bacterial growth in the presence of the antibiotic being tested. These conventional methods take typically 24hours to obtain results. Here we review the main techniques for rapid determination of antibiotic susceptibility. Data obtained with different methods such as molecular techniques, microarrays, commercial methods used in work routine, immunochromatographic methods, colorimetric methods, image methods, nephelometry, MALDI-TOF mass spectrometry, flow cytometry, chemiluminescence and bioluminescence, microfluids and methods based on cell disruption are analysed in detail

Métodos de diagnóstico rápido de las infecciones respiratorias / Rapid diagnostic test for respiratory infections

Las infecciones respiratorias agudas son la segunda causa de morbimortalidad tanto en niños como adultos a nivel mundial en cuya etiología se implican virus, bacterias y hongos. Su diagnóstico rápido permite un mejor manejo clínico del paciente, adoptar medidas de salud pública y controlar posibles brotes. Los principales microorganismos responsables pueden diagnosticarse en las primeras horas tras el inicio del cuadro con técnicas de detección de antígeno, fundamentalmente inmunocromatografícas. Se obtienen resultados en 15-30 min, con una sensibilidad del 70-90% y especificidad superior al 95% para el diagnóstico de infecciones por Streptococcus pneumoniae y Legionella pneumophila serogrupo O1 a partir de orina, Streptococcus pyogenes en exudados faríngeos y virus respiratorio sincitial en aspirados nasofaríngeos. En infecciones por los virus de la gripe y por Pneumocystis jirovecii, los resultados con estas técnicas son peores; no obstante, existen técnicas moleculares de fácil ejecución para el diagnóstico rápido de estos microorganismos. En general, estas técnicas no deben utilizarse para control evolutivo ni para valorar respuesta al tratamiento

Acute respiratory infections are the second cause of morbidity and mortality in children and adults worldwide, being viruses, bacteria and fungi involved in their etiology. The rapid diagnosis allows for a better clinical management of the patient, for adopting public health measures and for controlling possible outbreaks. The main etiologic agents can be diagnosed within the first hours after the onset of symptoms with antigen detection techniques, primarily immunochromatography. Results are obtained in 15-30 minutes, with 70-90% sensitivity and > 95% specificity for the diagnosis of Streptococcus pneumoniae and Legionella pneumophila serogroup O1 infections from urine, Streptococcus pyogenes from throat swabs and respiratory syncytial virus from nasopharyngeal aspirates. Worse results are obtained for influenza viruses and Pneumocystis jirovecii with these techniques; however, other easy-to-perform molecular techniques are available for the rapid diagnosis of these microorganisms. In general, these techniques should not be used for monitoring the outcome or response to treatment

Evaluación de un ensayo inmunocromatográfico para la detección de carbapenemasa OXA-48 / Evaluation of an immunochromatographic test for the detection of OXA-48 carbapenemase

Introducción. La detección y diferenciación de los distintos tipos de carbapenemasas es crucial para el control y diseminación de las mismas. OXA-48 es la carbapenemasa más frecuente en España y en nuestro medio. El objetivo del estudio fue evaluar el nuevo test inmunocromatográfico OXA-48 Card letitest (Coris, BioConcept Belgium) para detectar esta carbapenemasa a partir de medios sólidos. Material y Métodos. Durante el último año se han aislado 151 cepas productoras de carbapenemasas, de las cuales 136 presentaban OXA-48 (126 Klebsiella pneumoniae, 1 Klebsiella oxytoca, 5 Escherichia coli, 4 Enterobacter cloacae) y 15 productoras de otras carbapenemasas. Estas 15 cepas junto con otras 73 con distintos mecanismos de resistencia: 54 productoras de β-lactamasas de espectro extendido y 19 con otros mecanismos, fueron utilizadas como controles negativos. Resultados. Las 136 cepas portadoras de OXA-48 resultaron positivas en la prueba OXA-48 Card letitest y las 88 especies utilizadas como controles fueron negativos, por lo que la sensibilidad y especificidad de la prueba OXA-48 Card letitest fue del 100%. Discusión. La OXA-48 Card letitest resulta ser una prueba fácil, rápida, segura y barata (aproximadamente unos 6 Euros por test) que puede utilizarse en los laboratorios de Microbiología para confirmar la producción de carbapenemasa OXA-48 a partir de los aislamientos clínicos (AU)

Introduction. Detection and differentiation of various types of carbapenemases is crucial to their control and dissemination. OXA -48 is the most common carbapenemase in Spain and in our environment. The aim of this study is the evaluation of a new immunochromatographic test OXA-48 Card letitest (Coris, BioConcept Belgium) to detect this carbapenemase from solid media. Material and Methods. During the last year 151 strains of carbapenemase producing bacteria have been isolated, of which 136 were OXA-48 (126 Klebsiella pneumoniae, 1 Klebsiella oxytoca, 5 Escherichia coli, 4 Enterobacter cloacae), and 15 producing other carbapenemases . These 15 strains with other 73 carrying other resistance mechanisms (54 extended-spectrum β-lactamases producers and 19 with other mechanisms) were used as negative controls. Results. One hundred and thirty six strains carrying OXA- 48 were positive with the test OXA-48 Card letitest and the 88 species used as controls were negative, resulting in a sensitivity and specificity of 100%. Discussion. The OXA-48 Card letitest is simple, quick, safe and cheap (approx. 6Euros/test) and can be used in microbiology laboratories to confirm the production of OXA-48 carbapenemase in clinical isolates (AU)

Autochthonous Cryptosporidium cuniculus infection in Spain: first report in a symptomatic paediatric patient from Madrid / Infección autóctona por Cryptosporidium cuniculus en España: primer informe en un paciente pediátrico sintomático del área de Madrid

No disponible

Malaria por Plasmodium falciparum en residente en España sin antecedente de viaje reciente a zonas endémicas / Imported Plasmodium falciparum malaria in a resident in Spain with no recent travel history to endemic countries

No disponible

Antigenuria positiva a neumococo y vacunación / Positive urine pneumococcal antigen test and vaccination

Introducción y objetivo: La detección del antígeno neumocócico en orina es una prueba útil pero puede presentar falsos positivos, entre ellos, la vacunación neumocócica. Material y métodos: Detección de las antigenurias positivas a neumococo en el Hospital de Denia (enero-febrero/2015). Se determinaron variables epidemiológicas, radiológicas, microbiológicas y antecedente de vacunación neumocócica (neumo-23 y/o neumo-13). Resultados: La antigenuria a neumococo mostró un resultado positivo en el 12,4% de 385 determinaciones. Solo en el 33,3% de los casos con antigenuria positiva se documentó infiltrado radiológico en la radiografía de tórax. En el 35,4% de los pacientes existía antecedente de vacunación neumocócica previa. En la mayor parte de los casos (87,5%) un antígeno neumocócico positivo supuso la prescripción de un tratamiento antibiótico. Conclusiones: La vacunación neumocócica puede generar falsos positivos a la antigenuria por neumococo en la práctica clínica, con la consiguiente prescripción innecesaria de antibióticos en gran número de casos (AU)

Introduction and objective: Although urine pneumococcal antigen is an useful test, it has false positives such as pneumococcal vaccination. Material and methods: Positive urine pneumococcal antigen in Hospital de Denia (January-February/2015). We studied epidemiological, radiological and microbiological variables as well as previous pneumococcal vaccination (neumo-23 and/or neumo-13). Results: Urine pneumococcal antigen test was positive in 12.4% of 385 cases. Only 33.3% of positive cases had pneumonia in chest X-ray, and 35.4% of patients had previous pneumococcal vaccination. In most cases (87.5%), an antibiotic was prescribed. Conclusions: Pneumococcal vaccination can produce a false positive result in the urine pneumococcal antigen test in clinical practice, leading to an unnecessary prescription of antibiotics (AU)