Detection of sapovirus in brazilian pig farms / Detecção de sapovírus em criações de suínos brasileiras

Sapoviruses (Caliciviridae) are considered important agents of gastroenteritis worldwide affecting animals and humans. In pig farming, the epidemiology is not completely understood because it can affect all stages of production, with symptomatic (diarrhea) or asymptomatic pigs. The aim of our study was to investigate Sapovirus occurrence in Brazilian pig farms. A total of 166 fecal samples of pigs, with different ages, from Minas Gerais, São Paulo, and Mato Grosso States were submitted to RT-PCR reactions and confirmed with nucleotide sequencing of Sapovirus RdRp gene. Six (3.61%) samples were positive and four had partial RdRp gene sequenced, putatively belonging to GVII.1 genogroup, also reported in swine herds in Brazil.

Sapovírus (Caliciviridae) são considerados importantes agentes causadores de gastroenterites em todo o mundo, afetando animais e humanos. Na suinocultura, sua epidemiologia ainda não foi totalmente esclarecida, pois pode afetar todas as fases da produção, com suínos sintomáticos (diarreia) ou assintomáticos. O objetivo do nosso estudo foi investigar a ocorrência de Sapovírus em granjas de suínos brasileiras. Um total de 166 amostras fecais de suínos, com diferentes idades, dos estados de Minas Gerais, São Paulo e Mato Grosso foram submetidas a reações de RT-PCR e confirmadas com sequenciamento de nucleotídeos do gene RdRp do Sapovírus. Seis (3,61%) amostras foram positivas e quatro delas tinham sequenciamento parcial do gene RdRp, supostamente pertencente ao genogrupo GVII.1, previamente relatado em rebanhos suínos no Brasil.

Detection of sapovirus in brazilian pig farms / Detecção de sapovírus em criações de suínos brasileiras

Sapoviruses (Caliciviridae) are considered important agents of gastroenteritis worldwide affecting animals and humans. In pig farming, the epidemiology is not completely understood because it can affect all stages of production, with symptomatic (diarrhea) or asymptomatic pigs. The aim of our study was to investigate Sapovirus occurrence in Brazilian pig farms. A total of 166 fecal samples of pigs, with different ages, from Minas Gerais, São Paulo, and Mato Grosso States were submitted to RT-PCR reactions and confirmed with nucleotide sequencing of Sapovirus RdRp gene. Six (3.61%) samples were positive and four had partial RdRp gene sequenced, putatively belonging to GVII.1 genogroup, also reported in swine herds in Brazil.(AU)

Sapovírus (Caliciviridae) são considerados importantes agentes causadores de gastroenterites em todo o mundo, afetando animais e humanos. Na suinocultura, sua epidemiologia ainda não foi totalmente esclarecida, pois pode afetar todas as fases da produção, com suínos sintomáticos (diarreia) ou assintomáticos. O objetivo do nosso estudo foi investigar a ocorrência de Sapovírus em granjas de suínos brasileiras. Um total de 166 amostras fecais de suínos, com diferentes idades, dos estados de Minas Gerais, São Paulo e Mato Grosso foram submetidas a reações de RT-PCR e confirmadas com sequenciamento de nucleotídeos do gene RdRp do Sapovírus. Seis (3,61%) amostras foram positivas e quatro delas tinham sequenciamento parcial do gene RdRp, supostamente pertencente ao genogrupo GVII.1, previamente relatado em rebanhos suínos no Brasil.(AU)

Angistrongylus cantonensis and Ancylostoma caninum detection in snails of São Paulo city (2016-2017), Brazil / Detecção de Angistrongylus cantonensis and Ancylostoma caninum em caramujos da cidade de São Paulo (2016-2017), Brasil

Achatina fulica snails cause environmental problems and represent a public health hazard since it is a host in the life cycles of various parasites, among them, Angiostrongylus cantonensis and, less frequently, Ancylostoma caninum. We report the occurrence of Angistrongylus cantonensis, as well as the unexpected finding of Ancylostoma caninum, in a total of 936 specimens of Achatina fulica snails from different regions of São Paulo city, Brazil. Samples were divided into 492 pools which were screened for nematodes. If present, larvae were submitted to DNA extraction and PCR protocol targeting, the ITS-2 gene junction. From the 183 positive pools for larvae presence, 97 showed specific 650 bp band at electrophoresis and 21 presented bands nearly 300 bp. Two amplicons from each size were and sequenced. A BLAST/n of 650 bp sequences presented identity with Angistrongylus cantonensis, while the two of 300 bp, showed identity with Ancylostoma caninum, also supported by phylogenetic analysis. This is the second report of Ancylostoma caninum found in these snails in the world, therefore, this study allows a better understanding about these diseases and highlights the need of continue systematically mapping sites that can be infested with the mollusc.

Os caramujos Achatina fulica causam problemas ambientais e representam um perigo em Saúde Pública uma vez que são hospedeiros de vários parasitas, entre eles o Angiostrongylus cantonensis e menos frequentemente o Ancylostoma caninum. Nós relatamos a ocorrência de Angistrongylus cantonensis, bem como o achado de Ancylostoma caninum, a partir de 936 espécimens de caramujos Achatina fulica de diferentes regiões da cidade de São Paulo, Brasil. Amostras foram divididas em 492 pools os quais foram triados para nematóides. Se presentes, larvas foram submetidas a extração de DNA e um protocolo de PCR tendo como alvo a junção do gene ITS-2. De 183 pools contendo larvas, 97 apresentaram bandas específicas de 650 pb e na eletroforese 21 apresentaram bandas próximas aos 300 pb. Dois amplicons de cada tamanho foram sequenciados. A submissão ao BLAST/n das sequências de 650 pb apresentaram identidade das sequências com Angistrongylus cantonensis, enquanto que as duas de 300 pb apresentaram identidade com Ancylostoma caninum, também corroboradas por análises filogenéticas. Este é o segundo relato do encontro de Ancylostoma caninum nestes caramujos no mundo, sendo assim, este estudo permite um melhor entendimento destas doenças e denota a necessidade de contínuo monitoramento de regiões que estejam infestadas pelo molusco.

Angistrongylus cantonensis and Ancylostoma caninum detection in snails of São Paulo city (2016-2017), Brazil / Detecção de Angistrongylus cantonensis and Ancylostoma caninum em caramujos da cidade de São Paulo (2016-2017), Brasil

Achatina fulica snails cause environmental problems and represent a public health hazard since it is a host in the life cycles of various parasites, among them, Angiostrongylus cantonensis and, less frequently, Ancylostoma caninum. We report the occurrence of Angistrongylus cantonensis, as well as the unexpected finding of Ancylostoma caninum, in a total of 936 specimens of Achatina fulica snails from different regions of São Paulo city, Brazil. Samples were divided into 492 pools which were screened for nematodes. If present, larvae were submitted to DNA extraction and PCR protocol targeting, the ITS-2 gene junction. From the 183 positive pools for larvae presence, 97 showed specific 650 bp band at electrophoresis and 21 presented bands nearly 300 bp. Two amplicons from each size were and sequenced. A BLAST/n of 650 bp sequences presented identity with Angistrongylus cantonensis, while the two of 300 bp, showed identity with Ancylostoma caninum, also supported by phylogenetic analysis. This is the second report of Ancylostoma caninum found in these snails in the world, therefore, this study allows a better understanding about these diseases and highlights the need of continue systematically mapping sites that can be infested with the mollusc.(AU)

Os caramujos Achatina fulica causam problemas ambientais e representam um perigo em Saúde Pública uma vez que são hospedeiros de vários parasitas, entre eles o Angiostrongylus cantonensis e menos frequentemente o Ancylostoma caninum. Nós relatamos a ocorrência de Angistrongylus cantonensis, bem como o achado de Ancylostoma caninum, a partir de 936 espécimens de caramujos Achatina fulica de diferentes regiões da cidade de São Paulo, Brasil. Amostras foram divididas em 492 pools os quais foram triados para nematóides. Se presentes, larvas foram submetidas a extração de DNA e um protocolo de PCR tendo como alvo a junção do gene ITS-2. De 183 pools contendo larvas, 97 apresentaram bandas específicas de 650 pb e na eletroforese 21 apresentaram bandas próximas aos 300 pb. Dois amplicons de cada tamanho foram sequenciados. A submissão ao BLAST/n das sequências de 650 pb apresentaram identidade das sequências com Angistrongylus cantonensis, enquanto que as duas de 300 pb apresentaram identidade com Ancylostoma caninum, também corroboradas por análises filogenéticas. Este é o segundo relato do encontro de Ancylostoma caninum nestes caramujos no mundo, sendo assim, este estudo permite um melhor entendimento destas doenças e denota a necessidade de contínuo monitoramento de regiões que estejam infestadas pelo molusco.(AU)

Occurrence of infectious and parasitic diseases in association with the outdoor habits of household dogs and cats a case-control study / Estudo caso-controle da ocorrência de doenças infecto-parasitárias associadas aos hábitos semi-domiciliados de cães e gatos domésticos

Many owners believe to act in their pets best interest by allowing them to go outside, with or without supervision. However, outdoor exposure greatly increases the risk of disease and accidents. In this study, we evaluated the association between infectious and parasitic diseases and the outdoor habits of pet dogs and cats. Epidemiological data were obtained from the records of dogs and cats treated at the Teaching Clinic and Hospital Unit of Veterinary Medicine in the city of Pirassununga, state of São Paulo, Brazil. Pets with any form of infection were included in the case study group, and pets with no infectious or parasitic diseases were used as controls. Animals were further divided according to their habits into indoor animals, indoor animals taken for walks, and outdoor animals. The odds ratio of having a disease was calculated from the comparisons among these groups using the MedCalc Statistical Software. We found an increased risk for the occurrence of infectious or parasitic diseases in outdoor dogs and cats when compared to indoor animals (OR of 4.735) and to those taken for walks (OR of 2.303). In light of our results, we suggest that awareness campaigns should also focus on the benefits of keeping pets indoors.

Muitos proprietários acreditam agir no melhor interesse de seus animais de estimação permitindo-os o acesso ao ambiente externo, com ou sem supervisão. Entretanto, isso aumenta consideravelmente o risco para a ocorrência de doenças e acidentes. Neste estudo, foi avaliada a associação entre doenças infecciosas e parasitárias com relação aos hábitos semi-domiciliados de cães e gatos. Dados epidemiológicos foram obtidos de arquivo de prontuários de cães e gatos atendidos na Unidade Didática Clínico Hospitalar (UDCH) do curso de Medicina Veterinária da FZEA/USP no município de Pirassununga, estado de São Paulo, Brasil. Animais de estimação que apresentaram doenças infecto-parasitárias foram incluídos no grupo de casos; animais sem tais doenças, controles. Os animais foram ainda divididos de acordo em domiciliados, domiciliados frequentemente levados a passeios e semi-domiciliados. A razão de chances para a ocorrência de doenças infecciosas foi calculada a partir da comparação dos grupos supracitados, fazendo uso do software estatístico MedCalc. Encontrou-se um risco aumentado para a ocorrência de doenças infecto-parasitárias em cães e gatos semi-domiciliados quando comparados aos animais domiciliados (OR de 4.735) e quanto aos domiciliados guiados em passeios (OR de 2.303). À luz dos resultados se sugere que campanhas de conscientização foquem também nos benefícios da criação domiciliada de animais de estimação.

Occurrence of infectious and parasitic diseases in association with the outdoor habits of household dogs and cats a case-control study / Estudo caso-controle da ocorrência de doenças infecto-parasitárias associadas aos hábitos semi-domiciliados de cães e gatos domésticos

Many owners believe to act in their pets best interest by allowing them to go outside, with or without supervision. However, outdoor exposure greatly increases the risk of disease and accidents. In this study, we evaluated the association between infectious and parasitic diseases and the outdoor habits of pet dogs and cats. Epidemiological data were obtained from the records of dogs and cats treated at the Teaching Clinic and Hospital Unit of Veterinary Medicine in the city of Pirassununga, state of São Paulo, Brazil. Pets with any form of infection were included in the case study group, and pets with no infectious or parasitic diseases were used as controls. Animals were further divided according to their habits into indoor animals, indoor animals taken for walks, and outdoor animals. The odds ratio of having a disease was calculated from the comparisons among these groups using the MedCalc Statistical Software. We found an increased risk for the occurrence of infectious or parasitic diseases in outdoor dogs and cats when compared to indoor animals (OR of 4.735) and to those taken for walks (OR of 2.303). In light of our results, we suggest that awareness campaigns should also focus on the benefits of keeping pets indoors.(AU)

Muitos proprietários acreditam agir no melhor interesse de seus animais de estimação permitindo-os o acesso ao ambiente externo, com ou sem supervisão. Entretanto, isso aumenta consideravelmente o risco para a ocorrência de doenças e acidentes. Neste estudo, foi avaliada a associação entre doenças infecciosas e parasitárias com relação aos hábitos semi-domiciliados de cães e gatos. Dados epidemiológicos foram obtidos de arquivo de prontuários de cães e gatos atendidos na Unidade Didática Clínico Hospitalar (UDCH) do curso de Medicina Veterinária da FZEA/USP no município de Pirassununga, estado de São Paulo, Brasil. Animais de estimação que apresentaram doenças infecto-parasitárias foram incluídos no grupo de casos; animais sem tais doenças, controles. Os animais foram ainda divididos de acordo em domiciliados, domiciliados frequentemente levados a passeios e semi-domiciliados. A razão de chances para a ocorrência de doenças infecciosas foi calculada a partir da comparação dos grupos supracitados, fazendo uso do software estatístico MedCalc. Encontrou-se um risco aumentado para a ocorrência de doenças infecto-parasitárias em cães e gatos semi-domiciliados quando comparados aos animais domiciliados (OR de 4.735) e quanto aos domiciliados guiados em passeios (OR de 2.303). À luz dos resultados se sugere que campanhas de conscientização foquem também nos benefícios da criação domiciliada de animais de estimação.(AU)

Identification of Porcine parvovirus from wild boars by partial sequencing of the VP-2 coding gene / Identificação de parvovírus suíno em javalis a partir do sequenciamento parcial do gene VP-2

Este estudo descreve a detecção e a identificação de DNA de parvovírus suíno (PVS) em amostras de órgãos de dois javalis, por PCR e sequenciamento direcionado ao gene VP-2. Pools de órgãos (baço, rins, fígado, linfonodos e tonsila) de três javalis adultos e assintomáticos de Paraguaçu Paulista, SP, criados com propósitos comerciais, foram submetidos à detecção de PVS, resultando em duas amostras positivas após reações de nested-PCR direcionadas aos genes NS-1 e VP-2. Os fragmentos parciais de VP-2 foram sequenciados e comparados a sequências homólogas de cepas NADL-2 e Kresse, demonstrando identidade nucleotídica de 100%. Com relação a 29 cepas de PVS previamente isoladas no Brasil, o grau de identidade nucleotídica variou de 99 a 100% (uma a três substituições de nucleotídeos). Estes resultados demonstram, pela primeira vez, a detecção direta por PCR de parvovírus suíno em javalis, confirmada por análise de sequenciamento genético.(AU)

Freqüência de parasitos gastrintestinais em cães e gatos atendidos em hospital-escola veterinário da cidade de São Paulo / Frequency of gastrointestinal parasites in dogs and cats referred to a veterinary school hospital in the city of São Paulo

Fecal samples from 1755 dogs and 327 cats were examined for the presence of helminths and protozoan forms. From the total samples, 486 (27.7 percent) dogs and 103 (31.5 percent) cats presented at least one parasite. The main genus of parasite in dogs were Ancylostoma (12.7 percent), Giardia (8.5 percent), Cystoisosopora (4.4 percent), Toxocara (2.6 percent), and Cryptosporidium (2.4 percent). The ocurrence of Ancylostoma was associated to male dogs, older than one year, while Giardia, Cryptosporidium, Cystoisospora and Toxocara were associated to dogs younger than one year (P<0.05). Among cats, the most frequent parasites were Cryptosporidium (11.3 percent), Giardia (8.3 percent), Cystoisosopora (8.3 percent), Toxocara (6.1 percent), and Ancylostoma (2.1 percent). Cryptosporidium and Cystoisosopora were more prevalent in cats younger than one year (P < 0.05)(AU)

Detecção de ácidos nucléicos de Brucella spp., Leptospira spp., herpesvirus bovino e vírus da diarréia viral bovina, em fetos bovinos abortados e em animais mortos no perinatal / Detection of Brucella spp., Leptospira spp., bovine herpesvirus and bovine viral diarrhea virus nucleic acids in aborted fetuses and bovines dead perinatal

Samples of 114 bovine fetuses and 10 calves, which dead in perinatal period, were examined for detection of DNA. The most common detected agent was Brucella spp. in 17 samples (13.7%) followed by Leptospira spp. in 4 cases (3.2%),bovine herpesvirus (BHV) and bovine viral diarrhea (BVDV) in 3 animals (2.4%) each, and 1 for the association of BVDV and BHV. In 77.4 % (96/124) of the samples it was not possible to detect any agent.(AU)

Rickettsia felis (Rickettsiales: Rickettsiaceae) in Ctenocephalides felis felis (Siphonaptera: Pulicidae) in the State of São Paulo, Brazil / Rickettsia felis (Rickettsiales: Rickettsiaceae) em Ctenocephalides felis felis (Siphonaptera: Pulicidae) no estado de São Paulo

Samples of 10 and 14 Ctenocephalides felis felis fleas were collected on dogs from Pedreira and Mogi das Cruzes municipalities, respectively, in the State of São Paulo, Brazil, for detection of Rickettsia spp. Individual fleas were submitted to Polymerase Chain Reaction targeting the 17-kDa and the 190-kDa (OmpA) genes of Rickettsiae. This later gene is specific for spotted fever group. Nine fleas from Pedreira (90%) and four fleas from Mogi das Cruzes (28%) were positive for the 17-kDa gene, and eight fleas from Pedreira (80%) and four from Mogi das Cruzes (28%) were positive for 190-kDa gene. The nucleotide sequence of the 190-kDa products of one flea from Pedreira and one flea from Mogi das Cruzes were 100% identical to each other, and when compared to the GenBank Data, they were 100% identical to the 190-kDa sequence of R. felis. This was the first report of its occurrence in the State of São Paulo.(AU)

Amostras de 10 e 14 pulgas Ctenocephalides felis felis foram coletadas de cães nos municípios de Pedreira e Mogi das Cruzes, respectivamente, no estado de São Paulo, para pesquisa de Rickettsia spp. As pulgas foram individualmente submetidas à reação em cadeia pela polimerase, tendo como alvo os genes 17-kDa e 190-kDa (OmpA) de Rickettsia, sendo esse último específico para o GFM. Nove pulgas de Pedreira (90%) e quatro pulgas de Mogi das Cruzes (28%) foram positivas para o gene 17-kDa, e oito pulgas de Pedreira (80%) e quatro de Mogi das Cruzes (28%) foram positivas para o gene 190-kDa. As seqüências de nucleotídeos do gene 190-kDa de uma pulga de Pedreira e de uma pulga de Mogi das Cruzes foram 100% idênticas; quando comparadas com dados existentes no GenBank, foram 100% idênticas com a seqüência parcial do gene 190-kDa de Rickettsia felis. Esse foi o primeiro relato de sua ocorrência no estado de São Paulo.(AU)

DETECTION OF SAPOVIRUS IN BRAZILIAN PIG FARMS / DETECTION OF SAPOVIRUS IN BRAZILIAN PIG FARMS

Sapoviruses (Caliciviridae) are considered important agents of gastroenteritis worldwide affecting animals and humans. In pig farming, the epidemiology is not completely understood because it can affect all stages of production, with symptomatic (diarrhea) or asymptomatic pigs. The aim of our study was to investigate Sapovirus occurrence in Brazilian pig farms. A total of 166 fecal samples of pigs, with different ages, from Minas Gerais, São Paulo, and Mato Grosso States were submitted to RT-PCR reactions and confirmed with nucleotide sequencing of Sapovirus RdRp gene. Six (3.61%) samples were positive and four had partial RdRp gene sequenced, putatively belonging to GVII.1 genogroup, also reported in swine herds in Brazil.

Sapoviruses (Caliciviridae) are considered important gastroenteritis worldwide affecting animals and humans. In pig farming, the epidemiology has not completely understood, because can affect all stages of production, with symptomatic (diarrhea) or asymptomatic pigs. The aim of our study was investigated Sapovirus occurrence in Brazilian pig farms. A total of 166 fecal samples of pigs, with different ages, from Minas Gerais, São Paulo and Mato Grosso States were submitted to RT-PCR reactions and confirmed with nucleotide sequencing of Sapovirus RdRp gene. In total, six (3.61%) samples were positive and four of them had partial RdRp gene sequenced, putatively belonging to GVII.1 genogroup, also previously reported in swine herds in Brazil.

ANGISTRONGYLUS CANTONENSIS AND ANCYLOSTOMA CANINUM DETECTION IN SNAILS OF SÃO PAULO CITY (2016-2017), BRAZIL / ANGISTRONGYLUS CANTONENSIS AND ANCYLOSTOMA CANINUM DETECTION IN SNAILS OF SÃO PAULO CITY (2016-2017), BRAZIL.

Achatina fulica snails cause environmental problems and represent a public health hazard since it is a host in the life cycles of various parasites, among them, Angiostrongylus cantonensis and, less frequently, Ancylostoma caninum. We report the occurrence of Angistrongylus cantonensis, as well as the unexpected finding of Ancylostoma caninum, in a total of 936 specimens of Achatina fulica snails from different regions of São Paulo city, Brazil. Samples were divided into 492 pools which were screened for nematodes. If present, larvae were submitted to DNA extraction and PCR protocol targeting, the ITS-2 gene junction. From the 183 positive pools for larvae presence, 97 showed specific 650 bp band at electrophoresis and 21 presented bands nearly 300 bp. Two amplicons from each size were and sequenced. A BLAST/n of 650 bp sequences presented identity with Angistrongylus cantonensis, while the two of 300 bp, showed identity with Ancylostoma caninum, also supported by phylogenetic analysis. This is the second report of Ancylostoma caninum found in these snails in the world, therefore, this study allows a better understanding about these diseases and highlights the need of continue systematically mapping sites that can be infested with the mollusc.

Achatina fulica snails cause environmental problems and represent a public health hazard since it is a host in the life cycles of various parasites, among them, Angiostrongylus cantonensis and, less frequently, Ancylostoma caninum. We report the occurrence of Angistrongylus cantonensis, as well as the unexpected finding of Ancylostoma caninum, in a total of 936 specimens of Achatina fulica snails from different regions of São Paulo city, Brazil. Samples were divided into 492 pools which were screened for nematodes. If present, larvae were submitted to DNA extraction and PCR protocol targeting, the ITS-2 gene junction. From the 183 positive pools for larvae presence, 97 showed specific 650 bp band at electrophoresis and 21 presented bands nearly 300 bp. Two amplicons from each size were and sequenced. A BLAST/n of 650 bp sequences presented identity with Angistrongylus cantonensis, while the two of 300 bp, showed identity with Ancylostoma caninum, also supported by phylogenetic analysis. This is the second report of Ancylostoma caninum found in these snails in the world, therefore, this study allows a better understanding about these diseases and highlights the need of continue systematically mapping sites that can be infested with the mollusc.

DETECTION OF FELINE INFECTIOUS PERITONITIS VIRUS (FIPV) USING PCR. / DETECÇÃO DO VÍRUS DA PERITONITE INFECCIOSA FELINA (FIPV) POR MEIO DA PCR.

A peritonite infecciosa dos felinos (PIF) é uma doença geralmente fatal de felinos selvagens e domésticos. O agente etiológico da PIF (Feline Infectious Peritonitis Virus, FIPV) é um coronavírus; um RNA vírus envelopado de fita simples da família Coronaviridae. O presente artigo relata a padronização e a aplicação de um método de diagnóstico de PIF baseado em PCR do gene codificador da proteína S do FIPV. Amostras de efusão pleural ou peritonial de 11 gatos e 1 leoa e amostras de soro sangüíneo de 10 gatos com efusão cavitária foram enviadas ao Laboratório de Virologia da FMVZ-USP. Das 22 amostras testadas, apenas uma, referente a uma efusão pleural, mostrou-se positiva pela PCR. Hipóteses ligadas ao diagnóstico clínico, à dinâmica da infecção viral e a características intrínsecas das amostras podem ser utilizadas para explicar o número de amostras negativas. A técnica de PCR aqui descrita apresenta-se como uma alternativa para o diagnóstico da peritonite infecciosa dos felinos. Aliada aos diagnósticos sorológico e histopatológico, é uma ferramenta que vem ajudar a esclarecer a etiologia e a epidemiologia da doença em diversas espécies, permitindo um entendimento da cadeia de transmissão e da dinâmica e patogenia virais e da necessidade de vacinas.PALAVRAS-CHAVE: Peritonite. Felina. Diagnóstico. PCR.