Incidence of hepatitis A and hepatitis E viruses and norovirus and rotavirus in fish and shrimp samples caught from the Persian Gulf / [Incidência de vírus da hepatite A e hepatite E e norovírus e rotavírus em amostras de peixes e camarões capturados no Golfo Pérsico]

Foodborne viruses including hepatitis A virus (HAV), norovirus (NoV), rotavirus (RoV) and hepatitis E virus (HEV) are easily transmitted through contaminated seafoods. The current research was done to assess the incidence of RoV, NoV GI and GII,hAV and hEV in fish and shrimp samples caught from the Persian Gulf, Iran. Three-hundred and twenty fish and shrimp samples were collected. The presence of foodborne viruses were assessed by the real-time PCR. Forty-nine out of 320 (15.31%) fish and shrimp samples were positive for foodborne viruses. Distribution of hAV, NoV GI and NoV GII amongst all studied samples were 0.93%, 5.93% and 8.43%, respectively. hEV and RoV viruses were not found in studied samples. Parastromateus niger and Scomberomorus commerson fish and Penaeus monodon shrimp were the most frequently contaminated samples. Simultaneous incidence of hAV and NoV GI and hAV and NoV GII were 0.31% and 0.93%, respectively. Distribution of foodborne viruses in samples collected through spring, summer, autumn and winter seasons were 14.28%, 9.33%, 11.76% and 24.44%, respectively. Findings revealed that the incidence of foodborne viruses was significantly associated with seafood species and also season of sampling.(AU)

Vírus transmitidos por alimentos, incluindo hepatite A (HAV), norovírus (NoV), rotavírus (RoV) e hepatite E (HEV) são facilmente transmitidos através de frutos do mar contaminados. Esta pesquisa foi realizada para avaliar a incidência de RoV, NoV GI e GII, hAV e hEV em amostras de peixes e camarões capturadas no Golfo Pérsico, Irã. Foram coletadas 300 amostras de peixes e camarões. A presença de vírus transmitidos por alimentos foi avaliada por PCR em tempo real. Quarenta e nove das 320 amostras de peixes e camarões (15,31%) foram positivas para vírus transmitidos por alimentos. A distribuição de hAV, NoV GI e NoV GII entre as amostras estudadas foi 0,93%, 5,93% e 8,43%, respectivamente. Os vírus hEV e RoV não foram encontrados nas amostras estudadas. Os peixes Parastromateus niger e Scomberomorus commerson e o camarão Penaeus monodon foram as amostras mais frequentemente contaminadas. A incidência simultânea de hAV e NoV GI, e hAV e NoV GII foi de 0,31% e 0,93%, respectivamente. A distribuição dos vírus transmitidos por alimentos nas amostras coletadas na primavera, verão, outono e inverno foi de 14,28%, 9,33%, 11,76% e 24,44%, respectivamente. Os resultados demonstram que a incidência de vírus transmitidos por alimentos foi significativamente associada às espécies de frutos do mar e também à época da amostragem.(AU)

Neonatal diarrhea and rotavirus A infection in beef and dairy calves, Brazil, 2006-2015 / Diarreia neonatal e infecção por rotavírus A em bezerros de corte e leite, Brasil, 2006-2015

Calf diarrhea causes substantial economic losses in the cattle industry worldwide. Bovine rotavirus A (RVA) is the main viral agent that leads to enteric infection and diarrhea outbreaks in calves throughout the world. The aim of this retrospective (2006-2015) study was to determine the frequency of RVA detection in diarrheic fecal samples from beef and dairy calves from the three main cattle-producing regions of Brazil. Diarrheic fecal samples (n=1,498) of 124 beef and 56 dairy cattle herds from the Midwest, South, and Southeast geographical regions of Brazil were evaluated using the silver-stained polyacrylamide gel electrophoresis (ss-PAGE) technique. RVA double stranded-RNA was identified by the ss-PAGE technique in 410 (27.4%) fecal samples. The frequency of positive samples found in beef calves (31.9%; 328/1,027) was higher than the frequency found in diarrheic fecal samples from dairy calves (17.4%; 82/471). RVA infection was identified in calves from the three Brazilian geographical regions analyzed. However, the frequency of positive diarrheic calves in the Midwest region (39.4%), predominantly beef calves, was higher than in the South (19.4%) and Southeast (17.6%) regions. The temporal distribution of RVA-infected calves evaluated by two five-year periods (2006-2010, 24.5%; 2011-2015, 28.8%) demonstrated a very similar frequency of RVA in both periods. Considering the wide regional and temporal scope of this study, it can be concluded that RVA remains an important etiology of neonatal diarrhea in calves of Brazilian cattle herds.(AU)

A diarreia neonatal ocasiona perdas econômicas importantes na pecuária bovina em todo o mundo. Rotavírus A (RVA) é o principal agente etiológico viral de infecções entéricas e surtos de diarreia em bezerros de rebanhos de corte e leite. O objetivo deste estudo retrospectivo (2006-2015) foi determinar a frequência de detecção de RVA em amostras de fezes diarreicas de bezerros de corte e leite das três principais regiões produtoras de bovinos do Brasil. Amostras de fezes diarreicas (n=1.498) de 124 rebanhos bovinos de corte e 56 rebanhos bovinos de leite das regiões Centro-Oeste, Sul e Sudeste do Brasil foram avaliadas utilizando a técnica de eletroforese em gel de poliacrilamida (EGPA). O genoma segmentado de RVA foi identificado pela técnica de EGPA em 410 (27,4%) amostras de fezes. A frequência de amostras positivas encontrada em bezerros de rebanhos de corte (31,9%; 328/1.027) foi maior que a frequência identificada em amostras de fezes diarreicas de bezerros de rebanhos leiteiros (17,4%; 82/471). A infecção por RVA foi identificada em bezerros das três regiões geográficas brasileiras analisadas. No entanto, a frequência de bezerros com diarreia positivos para RVA na região Centro-Oeste (39,4%), predominantemente de bezerros de rebanhos de corte, foi maior que nas regiões Sul (19,4%) e Sudeste (17,6%). A distribuição temporal dos bezerros infectados com RVA avaliados por dois períodos de cinco anos (2006-2010, 24,5%; 2011-2015, 28,8%) demonstrou uma frequência muito semelhante em ambos os períodos. Considerando a amplitude regional e temporal deste estudo, pode-se concluir que RVA continua sendo uma importante etiologia de diarreia neonatal em bezerros de rebanhos bovinos brasileiros.(AU)

Neonatal diarrhea and rotavirus A infection in beef and dairy calves, Brazil, 2006-2015 / Diarreia neonatal e infecção por rotavírus A em bezerros de corte e leite, Brasil, 2006-2015

Calf diarrhea causes substantial economic losses in the cattle industry worldwide. Bovine rotavirus A (RVA) is the main viral agent that leads to enteric infection and diarrhea outbreaks in calves throughout the world. The aim of this retrospective (2006-2015) study was to determine the frequency of RVA detection in diarrheic fecal samples from beef and dairy calves from the three main cattle-producing regions of Brazil. Diarrheic fecal samples (n=1,498) of 124 beef and 56 dairy cattle herds from the Midwest, South, and Southeast geographical regions of Brazil were evaluated using the silver-stained polyacrylamide gel electrophoresis (ss-PAGE) technique. RVA double stranded-RNA was identified by the ss-PAGE technique in 410 (27.4%) fecal samples. The frequency of positive samples found in beef calves (31.9%; 328/1,027) was higher than the frequency found in diarrheic fecal samples from dairy calves (17.4%; 82/471). RVA infection was identified in calves from the three Brazilian geographical regions analyzed. However, the frequency of positive diarrheic calves in the Midwest region (39.4%), predominantly beef calves, was higher than in the South (19.4%) and Southeast (17.6%) regions. The temporal distribution of RVA-infected calves evaluated by two five-year periods (2006-2010, 24.5%; 2011-2015, 28.8%) demonstrated a very similar frequency of RVA in both periods. Considering the wide regional and temporal scope of this study, it can be concluded that RVA remains an important etiology of neonatal diarrhea in calves of Brazilian cattle herds.(AU)

A diarreia neonatal ocasiona perdas econômicas importantes na pecuária bovina em todo o mundo. Rotavírus A (RVA) é o principal agente etiológico viral de infecções entéricas e surtos de diarreia em bezerros de rebanhos de corte e leite. O objetivo deste estudo retrospectivo (2006-2015) foi determinar a frequência de detecção de RVA em amostras de fezes diarreicas de bezerros de corte e leite das três principais regiões produtoras de bovinos do Brasil. Amostras de fezes diarreicas (n=1.498) de 124 rebanhos bovinos de corte e 56 rebanhos bovinos de leite das regiões Centro-Oeste, Sul e Sudeste do Brasil foram avaliadas utilizando a técnica de eletroforese em gel de poliacrilamida (EGPA). O genoma segmentado de RVA foi identificado pela técnica de EGPA em 410 (27,4%) amostras de fezes. A frequência de amostras positivas encontrada em bezerros de rebanhos de corte (31,9%; 328/1.027) foi maior que a frequência identificada em amostras de fezes diarreicas de bezerros de rebanhos leiteiros (17,4%; 82/471). A infecção por RVA foi identificada em bezerros das três regiões geográficas brasileiras analisadas. No entanto, a frequência de bezerros com diarreia positivos para RVA na região Centro-Oeste (39,4%), predominantemente de bezerros de rebanhos de corte, foi maior que nas regiões Sul (19,4%) e Sudeste (17,6%). A distribuição temporal dos bezerros infectados com RVA avaliados por dois períodos de cinco anos (2006-2010, 24,5%; 2011-2015, 28,8%) demonstrou uma frequência muito semelhante em ambos os períodos. Considerando a amplitude regional e temporal deste estudo, pode-se concluir que RVA continua sendo uma importante etiologia de diarreia neonatal em bezerros de rebanhos bovinos brasileiros.(AU)

Enteropatógenos de potencial zoonótico identificados em aves silvestres / Enteric pathogens with zoonotic potential identified in wild birds / Patógenos entéricos de potencial zoonótico identificados en aves silvestres

Os enteropatógenos podem ser considerados um dos principais grupos de micro-organismos patogênicos para humanos e animais. Podem estabelecer infecção nos suscetíveis devido a contaminação de água, alimentos ou pelo contato estreito com animais, incluindo as aves silvestres ou com o ambiente de criação. O acesso das aves da fauna silvestre ao ambiente próximo aos domicílios favorece a contaminação peridomiciliar pelas fezes dos passeriformes e psitaciformes. Locais como parques e praças podem se tornar propícios para veiculação destes patógenos devido a deficiente higienização e livre acesso destas aves silvestres. Neste artigo foram revisados alguns enteropatógenos de origem bacteriana e viral que podem ser considerados de alto risco para infecção humana levando-se em consideração a relevância das aves silvestres neste contexto.(AU)

Entheric pathogens can be considered one of the main pathogenic groups of microorganisms in humans and animals. It can stablish infection in susceptible due to contamination of water, food, or by close contact with animals, including wild birds or the breeding environment. The access of wild birds to the environment close to residences predispose peridomestic contamination by feces of passeriforms and psittaciformes. Places like parks and squares can become propitious for propagation of these pathogens due to poor hygiene and free access of wild birds. In this article some enteric pathogens of bacterial and viral origin was revised, which can be considered of high risk for human infection considering the relevance of wild birds in this context.(AU)

Los patógenos entéricos pueden ser considerados como uno de los grupos principales de microorganismos patogénicos para el ser humano y los animales. Pueden establecer la infección en susceptibles debido a la contaminación del agua, los alimentos o por el contacto cercano con los animales, incluyendo los pájaros salvajes o con el ambiente de la creación. El acceso a las aves de vida silvestre para el medio ambiente cerca de los hogares peridomésticos favorece la contaminación por heces de aves paseriformes y psitaciformes. Los lugares como parques y plazas pueden llegar a ser propicio para la propagación de estos patógenos debido a la falta de higiene y el libre acceso de las aves silvestres. En este artículo algunos patógenos entéricos del origen bacteriano y viral fueron revisados que pueden ser considerados de alto riesgo de contaminación humana, teniendo en cuenta la relevancia de las aves silvestres en este contexto.(AU)

Enteropatógenos de potencial zoonótico identificados em aves silvestres / Enteric pathogens with zoonotic potential identified in wild birds / Patógenos entéricos de potencial zoonótico identificados en aves silvestres

Os enteropatógenos podem ser considerados um dos principais grupos de micro-organismos patogênicos para humanos e animais. Podem estabelecer infecção nos suscetíveis devido a contaminação de água, alimentos ou pelo contato estreito com animais, incluindo as aves silvestres ou com o ambiente de criação. O acesso das aves da fauna silvestre ao ambiente próximo aos domicílios favorece a contaminação peridomiciliar pelas fezes dos passeriformes e psitaciformes. Locais como parques e praças podem se tornar propícios para veiculação destes patógenos devido a deficiente higienização e livre acesso destas aves silvestres. Neste artigo foram revisados alguns enteropatógenos de origem bacteriana e viral que podem ser considerados de alto risco para infecção humana levando-se em consideração a relevância das aves silvestres neste contexto.

Entheric pathogens can be considered one of the main pathogenic groups of microorganisms in humans and animals. It can stablish infection in susceptible due to contamination of water, food, or by close contact with animals, including wild birds or the breeding environment. The access of wild birds to the environment close to residences predispose peridomestic contamination by feces of passeriforms and psittaciformes. Places like parks and squares can become propitious for propagation of these pathogens due to poor hygiene and free access of wild birds. In this article some enteric pathogens of bacterial and viral origin was revised, which can be considered of high risk for human infection considering the relevance of wild birds in this context.

Los patógenos entéricos pueden ser considerados como uno de los grupos principales de microorganismos patogénicos para el ser humano y los animales. Pueden establecer la infección en susceptibles debido a la contaminación del agua, los alimentos o por el contacto cercano con los animales, incluyendo los pájaros salvajes o con el ambiente de la creación. El acceso a las aves de vida silvestre para el medio ambiente cerca de los hogares peridomésticos favorece la contaminación por heces de aves paseriformes y psitaciformes. Los lugares como parques y plazas pueden llegar a ser propicio para la propagación de estos patógenos debido a la falta de higiene y el libre acceso de las aves silvestres. En este artículo algunos patógenos entéricos del origen bacteriano y viral fueron revisados que pueden ser considerados de alto riesgo de contaminación humana, teniendo en cuenta la relevancia de las aves silvestres en este contexto.

Immunohistochemical detection of viral etiopathogenesis in lambs and goat kids with neonatal diarrhea

Background: Neonatal enteritis is an important disease that causes deaths of animals before 3 weeks of age, and results in significant economic losses. Viral agents can predispose the young animals to secondary infections in the gastrointestinal tract, especially in lambs and goat kids younger than 21 days. Although the neonatal diarrhea is common in calves, there is still little knowledge about pathology, pathogenesis and immunohistochemical localization of viral agents that cause neonatal enteritis in lambs and goat kids. In this study, we carried out investigations with the aim of detecting adenovirus, rotavirus, coronavirus and herpes virus in the guts of goat kids and lambs with viral enteritis.Materials, Methods & Results: Adenovirus, rotavirus, coronavirus and herpes virus antisera were applied to paraffinembedded intestinal tissue from neonatal lambs and kids that had died from enteritis. In addition, viral agents in the gut cells were detected and evaluated by electron microscopy. The study material consisted of 15 lambs and 15 goat kids that were presented for diagnosis. Viral agents were detected by immunohistochemically in 20 out of 30 animals. Rotavirus was diagnosed in 10 animals, adenovirus in five, herpes virus in three and coronavirus in two animals; and these results were supported by the electron microscopy. This study showed that viral agents play an important role in neonatal enteritis in lambs and kids.Discussion: Bacteria, viruses and protozoa may have a role in the etiology of neonatal enteritis and identifying the etiological agents is not always possible without laboratory studies. In addition, the immune system of the animal and environmental factors are important factors for to occurrence of the disease.[...]

Immunohistochemical detection of viral etiopathogenesis in lambs and goat kids with neonatal diarrhea

Background: Neonatal enteritis is an important disease that causes deaths of animals before 3 weeks of age, and results in significant economic losses. Viral agents can predispose the young animals to secondary infections in the gastrointestinal tract, especially in lambs and goat kids younger than 21 days. Although the neonatal diarrhea is common in calves, there is still little knowledge about pathology, pathogenesis and immunohistochemical localization of viral agents that cause neonatal enteritis in lambs and goat kids. In this study, we carried out investigations with the aim of detecting adenovirus, rotavirus, coronavirus and herpes virus in the guts of goat kids and lambs with viral enteritis.Materials, Methods & Results: Adenovirus, rotavirus, coronavirus and herpes virus antisera were applied to paraffinembedded intestinal tissue from neonatal lambs and kids that had died from enteritis. In addition, viral agents in the gut cells were detected and evaluated by electron microscopy. The study material consisted of 15 lambs and 15 goat kids that were presented for diagnosis. Viral agents were detected by immunohistochemically in 20 out of 30 animals. Rotavirus was diagnosed in 10 animals, adenovirus in five, herpes virus in three and coronavirus in two animals; and these results were supported by the electron microscopy. This study showed that viral agents play an important role in neonatal enteritis in lambs and kids.Discussion: Bacteria, viruses and protozoa may have a role in the etiology of neonatal enteritis and identifying the etiological agents is not always possible without laboratory studies. In addition, the immune system of the animal and environmental factors are important factors for to occurrence of the disease.[...](AU)

Outbreak of neonatal diarrhea caused by multiple genotypes of rotavirus A in a beef calves herd / Surto de diarreia neonatal por múltiplos genótipos de rotavírus A em um rebanho de bovinos de corte

Calf diarrhea causes substantial economic losses to beef cattle production worldwide. It is a complex multifactorial pathological condition influenced by infectious, nutritional and environmental factors. The present study focused on analyzing the pathological and molecular characterization of bovine rotavirus A (BoRVA) during a diarrhea outbreak in a beef cattle herd located in the state of Mato Grosso, central-western region, Brazil. The outbreak caused high morbidity (80%) and mortality (12%) among 1,100 calves up to 30 days of age. The BoRVA was identified in 53.3% (16/30) of the diarrheic fecal samples analyzed using the silver-stained polyacrylamide gel electrophoresis (ss-PAGE) technique. The nucleotide sequence analysis of VP7 (G genotype) and VP4 (P genotype) via RT-PCR from eight BoRVA-positive fecal samples showed the genotypes G6P[5] (n = 6), G6P[11] (n = 1) and G6P[X] (n = 1). Three calves were necropsied and the gross findings included edema and thickened, wrinkled bowel mucosa in the small intestine. Microscopic lesions were confined to the villi of the small intestine, characterized mainly by villus fusion and moderate multifocal lymphoplasmacytic enteritis. Immunohistochemical examination of three cases was positive for BoRVA. The 53.3% of the diarrheic fecal samples that were positive for BoRVA in this study suggested that RV was the etiological agent involved in this neonatal calf diarrhea outbreak.(AU)

A diarreia neonatal provoca perdas econômicas substanciais na produção de bovinos em todo o mundo. É uma condição patológica multifatorial complexa influenciada por fatores infecciosos, nutricionais e ambientais. O presente estudo teve por objetivo caracterizar o rotavírus tipo A (BoRVA) através da análise patológica e molecular durante um surto de diarreia em um rebanho bovino localizado no estado de Mato Grosso, região centro-oeste, no Brasil. O surto causou alta morbidade (80%) e letalidade (12%) em um rebanho composto 1.100 bezerros até 30 dias de idade. O BoRVA foi identificado em 53,3% (16/30) das amostras fecais diarreicas analisadas usando a técnica de eletroforese em gel de poliacrilamida corada com prata (ss-PAGE). A análise da sequência nucleotídica de VP7 (genótipo G) e VP4 (genótipo P) via RT-PCR a partir de oito amostras fecais BoRVA-positivas mostrou os genótipos G6P [5] (n = 6), G6P [11] (n = 1) e G6P [X] (n = 1). Três bezerros foram submetidos à necropsia e os achados macroscópicos incluíram edema e espessamento da mucosa do intestino delgado. As lesões microscópicas foram observadas nas vilosidades do intestino delgado, sendo caracterizadas principalmente por fusiosamento de vilosidades e enterite linfoplasmocitária multifocal moderada. O exame imunohistoquímico dos três casos foram positivos para o BoRVA. As 53,3% das amostras fecais diarreicas positivas para o BoRVA sugeriram que o rotavírus é o agente etiológico envolvido neste surto de diarreia neonatal em bezerros.(AU)

Outbreak of neonatal diarrhea caused by multiple genotypes of rotavirus A in a beef calves herd / Surto de diarreia neonatal por múltiplos genótipos de rotavírus A em um rebanho de bovinos de corte

Calf diarrhea causes substantial economic losses to beef cattle production worldwide. It is a complex multifactorial pathological condition influenced by infectious, nutritional and environmental factors. The present study focused on analyzing the pathological and molecular characterization of bovine rotavirus A (BoRVA) during a diarrhea outbreak in a beef cattle herd located in the state of Mato Grosso, central-western region, Brazil. The outbreak caused high morbidity (80%) and mortality (12%) among 1,100 calves up to 30 days of age. The BoRVA was identified in 53.3% (16/30) of the diarrheic fecal samples analyzed using the silver-stained polyacrylamide gel electrophoresis (ss-PAGE) technique. The nucleotide sequence analysis of VP7 (G genotype) and VP4 (P genotype) via RT-PCR from eight BoRVA-positive fecal samples showed the genotypes G6P[5] (n = 6), G6P[11] (n = 1) and G6P[X] (n = 1). Three calves were necropsied and the gross findings included edema and thickened, wrinkled bowel mucosa in the small intestine. Microscopic lesions were confined to the villi of the small intestine, characterized mainly by villus fusion and moderate multifocal lymphoplasmacytic enteritis. Immunohistochemical examination of three cases was positive for BoRVA. The 53.3% of the diarrheic fecal samples that were positive for BoRVA in this study suggested that RV was the etiological agent involved in this neonatal calf diarrhea outbreak.(AU)

A diarreia neonatal provoca perdas econômicas substanciais na produção de bovinos em todo o mundo. É uma condição patológica multifatorial complexa influenciada por fatores infecciosos, nutricionais e ambientais. O presente estudo teve por objetivo caracterizar o rotavírus tipo A (BoRVA) através da análise patológica e molecular durante um surto de diarreia em um rebanho bovino localizado no estado de Mato Grosso, região centro-oeste, no Brasil. O surto causou alta morbidade (80%) e letalidade (12%) em um rebanho composto 1.100 bezerros até 30 dias de idade. O BoRVA foi identificado em 53,3% (16/30) das amostras fecais diarreicas analisadas usando a técnica de eletroforese em gel de poliacrilamida corada com prata (ss-PAGE). A análise da sequência nucleotídica de VP7 (genótipo G) e VP4 (genótipo P) via RT-PCR a partir de oito amostras fecais BoRVA-positivas mostrou os genótipos G6P [5] (n = 6), G6P [11] (n = 1) e G6P [X] (n = 1). Três bezerros foram submetidos à necropsia e os achados macroscópicos incluíram edema e espessamento da mucosa do intestino delgado. As lesões microscópicas foram observadas nas vilosidades do intestino delgado, sendo caracterizadas principalmente por fusiosamento de vilosidades e enterite linfoplasmocitária multifocal moderada. O exame imunohistoquímico dos três casos foram positivos para o BoRVA. As 53,3% das amostras fecais diarreicas positivas para o BoRVA sugeriram que o rotavírus é o agente etiológico envolvido neste surto de diarreia neonatal em bezerros.(AU)

Analysis of bovine rotavirus strains circulating in diarrheic dairy calves in Uberaba, Minas Gerais, Brazil, during 2008-2009 / Análise de cepas de rotavírus bovino circulantes em bezerros leiteiros com diarreia em Uberaba, Minas Gerais, Brasil, durante 2008-2009

O objetivo deste estudo foi detectar rotavírus em fezes de bezerros com diarreia em Uberaba, MG, e caracterizar os genes VP7 e VP4 por meio da genotipagem e da análise filogenética. Setenta e quatro amostras foram coletadas entre novembro de 2008 e setembro de 2009. A detecção do vírus foi feita por teste de aglutinação e as amostras positivas foram submetidas à transcrição reversa, seguida de reação em cadeia da polimerase (RT-PCR), tipagem por PCR e sequenciamento. A taxa de detecção de rotavírus foi de 6,8% e todas as amostras apresentaram o genótipo G6P[5]. A análise filogenética mostrou que as amostras do genótipo G6 pertencem à linhagem IV e que, para ambos os genes (VP7 e VP4), as amostras deste estudo compõem um sub-cluster à parte daquele das cepas referências e das amostras campo mais similares. O alinhamento das sequências de aminoácidos deduzidas mostrou substituições em regiões antigênicas quando comparadas com as sequências das cepas bovinas UK e NCDV, presentes nas vacinas disponíveis no Brasil. Uma nova sublinhagem genética de G6P[5] foi evidenciada neste estudo. Substituições de aminoácidos nas regiões antigênicas dos rotavírus e a circulação de novas variantes podem representar desafios para as vacinas utilizadas atualmente. O presente estudo contribui para a compreensão da epidemiologia dos rotavírus bovinos no Brasil.(AU)

Analysis of bovine rotavirus strains circulating in diarrheic dairy calves in Uberaba, Minas Gerais, Brazil, during 2008-2009 / Análise de cepas de rotavírus bovino circulantes em bezerros leiteiros com diarreia em Uberaba, Minas Gerais, Brasil, durante 2008-2009

O objetivo deste estudo foi detectar rotavírus em fezes de bezerros com diarreia em Uberaba, MG, e caracterizar os genes VP7 e VP4 por meio da genotipagem e da análise filogenética. Setenta e quatro amostras foram coletadas entre novembro de 2008 e setembro de 2009. A detecção do vírus foi feita por teste de aglutinação e as amostras positivas foram submetidas à transcrição reversa, seguida de reação em cadeia da polimerase (RT-PCR), tipagem por PCR e sequenciamento. A taxa de detecção de rotavírus foi de 6,8% e todas as amostras apresentaram o genótipo G6P[5]. A análise filogenética mostrou que as amostras do genótipo G6 pertencem à linhagem IV e que, para ambos os genes (VP7 e VP4), as amostras deste estudo compõem um sub-cluster à parte daquele das cepas referências e das amostras campo mais similares. O alinhamento das sequências de aminoácidos deduzidas mostrou substituições em regiões antigênicas quando comparadas com as sequências das cepas bovinas UK e NCDV, presentes nas vacinas disponíveis no Brasil. Uma nova sublinhagem genética de G6P[5] foi evidenciada neste estudo. Substituições de aminoácidos nas regiões antigênicas dos rotavírus e a circulação de novas variantes podem representar desafios para as vacinas utilizadas atualmente. O presente estudo contribui para a compreensão da epidemiologia dos rotavírus bovinos no Brasil.(AU)

Serum concentrations of acute phase proteins and immunoglobulins of calves with rotavirus diarrhea / Concentração sérica de proteínas de fase aguda e imunoglobulinas em bezerros acometidos por diarreia por rotavírus

The aim of the present study was to characterize changes in acute phase protein levels according to the occurrence of rotavirus diarrhea in calves in the first month of life. Blood and fecal samples were taken before colostrum intake and at 1, 2, 7, 15, 21 and 30 days of age from 24 Holstein calves allotted in three experimental groups: calves that did not present diarrhea (group A), calves that presented diarrhea, but tested negative for rotavirus in feces (group B), and calves that presented diarrhea and tested positive for rotavirus in feces (group C) (experiment 1). When the animals presented episodes of diarrhea, blood and fecal samples were taken at 24-hour intervals until the end of clinical signs (experiment 2). Serum proteins were separated by SDS-PAGE technique and rotavirus in feces was detected by PAGE. Data of experiment 1 were analyzed by ANOVA and Tukey's test, considered significant at P<0.05. Data of experiment 2 were subjected to the HSD test. Total protein, globulins, and IgG concentrations were lower in group C than in groups A and B. Ceruloplasmin and transferrin levels were higher in group C than in groups A and B. Serum concentrations of haptoglobin and α1-acid glycoprotein did not differ significantly between groups throughout the experimental period. Calves presented diarrhea between 10.4 and 14.6 days of age in group B, and between 10.3 and 14.6 days of age in group C. In the moments of diarrhea manifestation, least square means of IgA, haptoglobin and α1-acid glycoprotein concentrations did not differ significantly between groups B and C, but ceruloplasmin and transferrin concentrations were higher in group C than in group B, as opposed to what occurred with IgG levels. These findings show that optimizing passive immunity transfer of immunoglobulins decrease the likelihood of calves developing diarrhea caused by rotavirus. In addition, ceruloplasmin presents characteristics of a biomarker of rotavirus infection in calves.(AU)

O objetivo do presente estudo foi avaliar alterações nos teores de proteínas de fase aguda de acordo com a ocorrência de diarreia por rotavírus em bezerros no decorrer do primeiro mês de vida. Amostras de sangue e fezes de 24 bezerros da raça Holandesa foram coletadas antes da ingestão de colostro e com um, dois, sete, quinze, vinte um e trinta dias de idade, sendo os bezerros alocados em três grupos: bezerros que não apresentaram diarreia (grupo A), bezerros que apresentaram diarreia, mas foram negativos para a detecção de rotavírus nas fezes (grupo B) e bezerros que apresentaram diarreia e foram positivos para detecção de rotavírus nas fezes (grupo C) (experimento 1). Sempre que os animais apresentavam episódio de diarreia, amostras de sangue e fezes eram coletadas em intervalos de 24 horas até o término dos sinais clínicos (experimento 2). As proteínas séricas foram separadas por meio da técnica de SDS-PAGE e a pesquisa de rotavírus nas fezes foi realizada por meio da técnica de PAGE. Os resultados do experimento 1 foram analisados por meio de ANOVA e do teste de Tukey, considerado significativo quando P<0,05. Os dados do experimento 2 foram submetidos ao teste HSD. Os teores de proteína total, globulinas e IgG foram menores no grupo C que nos grupos A e B, os teores de ceruloplasmina e transferrina foram maiores no grupo C que nos grupos A e B e as concentrações séricas de haptoglobina e α1-glicoproteína ácida não diferiram significativamente entre grupos. Os bezerros manifestaram diarreia, em média, com 10,4 a 14,6 dias de idade no grupo B e com 10,3 a 14,6 dias de idade no grupo C. Nos momentos de manifestação de diarreia, os teores de IgA, haptoglobina e α1-glicoproteína ácida não diferiram significativamente entre os grupos B e C, mas os teores de ceruloplasmina e transferrina foram maiores no grupo C que no grupo B, oposto ao verificado para o teor de IgG. Esses achados mostram que a otimização da transferência de imunidade passiva de imunoglobulinas reduz a probabilidade de os animais apresentarem diarreia por rotavírus. Adicionalmente, a ceruloplasmina apresenta características de um biomarcador da infecção por rotavírus em bezerros.(AU)

Serum concentrations of acute phase proteins and immunoglobulins of calves with rotavirus diarrhea / Concentração sérica de proteínas de fase aguda e imunoglobulinas em bezerros acometidos por diarreia por rotavírus

The aim of the present study was to characterize changes in acute phase protein levels according to the occurrence of rotavirus diarrhea in calves in the first month of life. Blood and fecal samples were taken before colostrum intake and at 1, 2, 7, 15, 21 and 30 days of age from 24 Holstein calves allotted in three experimental groups: calves that did not present diarrhea (group A), calves that presented diarrhea, but tested negative for rotavirus in feces (group B), and calves that presented diarrhea and tested positive for rotavirus in feces (group C) (experiment 1). When the animals presented episodes of diarrhea, blood and fecal samples were taken at 24-hour intervals until the end of clinical signs (experiment 2). Serum proteins were separated by SDS-PAGE technique and rotavirus in feces was detected by PAGE. Data of experiment 1 were analyzed by ANOVA and Tukey's test, considered significant at P 0.05. Data of experiment 2 were subjected to the HSD test. Total protein, globulins, and IgG concentrations were lower in group C than in groups A and B. Ceruloplasmin and transferrin levels were higher in group C than in groups A and B. Serum concentrations of haptoglobin and 1-acid glycoprotein did not differ significantly between groups throughout the experimental period. Calves presented diarrhea between 10.4 and 14.6 days of age in group B, and between 10.3 and 14.6 days of age in group C. In the moments of diarrhea manifestation, least square means of IgA, haptoglobin and 1-acid glycoprotein concentrations did not differ significantly between groups B and C, but ceruloplasmin and transferrin concentrations were higher in group C than in group B, as opposed to what occurred with IgG levels. These findings show that optimizing passive immunity transfer of immunoglobulins decrease the likelihood of calves developing diarrhea caused by rotavirus. In addition, ceruloplasmin presents characteristics of a biomarker of rotavirus infection in calves.(AU)

O objetivo do presente estudo foi avaliar alterações nos teores de proteínas de fase aguda de acordo com a ocorrência de diarreia por rotavírus em bezerros no decorrer do primeiro mês de vida. Amostras de sangue e fezes de 24 bezerros da raça Holandesa foram coletadas antes da ingestão de colostro e com um, dois, sete, quinze, vinte um e trinta dias de idade, sendo os bezerros alocados em três grupos: bezerros que não apresentaram diarreia (grupo A), bezerros que apresentaram diarreia, mas foram negativos para a detecção de rotavírus nas fezes (grupo B) e bezerros que apresentaram diarreia e foram positivos para detecção de rotavírus nas fezes (grupo C) (experimento 1). Sempre que os animais apresentavam episódio de diarreia, amostras de sangue e fezes eram coletadas em intervalos de 24 horas até o término dos sinais clínicos (experimento 2). As proteínas séricas foram separadas por meio da técnica de SDS-PAGE e a pesquisa de rotavírus nas fezes foi realizada por meio da técnica de PAGE. Os resultados do experimento 1 foram analisados por meio de ANOVA e do teste de Tukey, considerado significativo quando P 0,05. Os dados do experimento 2 foram submetidos ao teste HSD. Os teores de proteína total, globulinas e IgG foram menores no grupo C que nos grupos A e B, os teores de ceruloplasmina e transferrina foram maiores no grupo C que nos grupos A e B e as concentrações séricas de haptoglobina e 1-glicoproteína ácida não diferiram significativamente entre grupos. Os bezerros manifestaram diarreia, em média, com 10,4 a 14,6 dias de idade no grupo B e com 10,3 a 14,6 dias de idade no grupo C. Nos momentos de manifestação de diarreia, os teores de IgA, haptoglobina e 1-glicoproteína ácida não diferiram significativamente entre os grupos B e C, mas os teores de ceruloplasmina e transferrina foram maiores no grupo C que no grupo B, oposto ao verificado para o teor de IgG. Esses achados mostram que a otimização da transferência de imunidade passiva de imunoglobulinas reduz a probabilidade de os animais apresentarem diarreia por rotavírus. Adicionalmente, a ceruloplasmina apresenta características de um biomarcador da infecção por rotavírus em bezerros.(AU)

Diversity of group A rotavirus genes detected in the Triângulo Mineiro region, Minas Gerais, Brazil

Group A rotaviruses are the main causative agent of infantile gastroenteritis. The segmented nature of the viral genome allows reassortment of genome segments, which can generate genetic variants. In this study, we characterized the diversity of the VP7, VP4 (VP8*), VP6, NSP4, and NSP5 genes of the rotaviruses that circulated from 2005 to 2011 in the Triângulo Mineiro (TM) region of Brazil. Samples with genotypes G2 (sublineages IVa-1 and IVa-3), G1 (sublineage I-A), G9 (lineage III), G12 (lineages II and III), G8 (lineage II), G3 (lineage III), P[4] (sublineages IVa and IVb), P[8] (sublineages P[8]-3.6, P[8]-3.3, and P[8]-3.1), I2 (lineage VII), E2 (lineages VI, XII, and X), and H2 (lineage III) were identified. The associations found in the samples were G1, G9, or G12 with P[8]-I1-E1-H1; G2 or G8 with P[4]-I2-E2-H2; G12 with I3-E3-H6; and G3 with P[4]-I2-E3-H3 (previously unreported combination). Reassortment events in G2P[4] strains and an apparent pattern of temporal segregation within the lineages were observed. Five TM samples contained genes that exhibited high nucleotide and amino acid identities with strains of animal origin. The present study includes a period of pre- and post-introduction of rotavirus vaccination in all Brazilian territories, thereby serving as a basis for monitoring changes in the genetic constitution of rotaviruses. The results also contribute to the understanding of the diversity and evolution of rotaviruses in a global context.(AU)

Seasonal variation on the presence of adenoviruses in stools from non-diarrheic patients

Human adenoviruses (HAdV), members of the Adenoviridae family, are excreted through the fecal route and may be present in the feces of humans consuming contaminated food or water. The presence of HAdV from different serotypes in the feces of healthy individuals was already reported using conventional polymerase chain reaction; however, real-time PCR (qPCR) may reveal not only the rates of detection as well as demonstrate the viral loads excreted by healthy persons. Aiming to identify and characterize the presence of adenoviruses in stool samples, 147 fecal samples from patients with no records of diarrhea were analyzed (74 from winter season and 73 from summer) by Real-Time PCR (qPCR) assay and conventional PCR. HAdV genome was present in 43.8% (32/73) of stools samples collected during summer season and 21.6% (16/74) during winter. The rate of detection of genomic copies (gc) ranged from 4.04×10² to 6.72×10⁵gc/g of feces among the 147 samples analyzed, of which the ranged of genomic copies of DNA HAdV was major in summer. All samples were negative when tested for rotaviruses (RV) and noroviruses (NoV) by PCR conventional and qPCR respectively. HAdV is excreted constantly by infected individuals in the absence of clinical signs and the occurrence may vary seasonally..(AU)

Moving beyond classical markers of water quality: detection of enteric viruses and genotoxicity in water of the Sinos River / Indo além dos marcadores clássicos de qualidade da água: detecção de vírus entéricos e genotoxicidade na água do Rio dos Sinos

It is well recognized that the classical biological and chemical markers of environmental pollution do not necessarily indicate the presence or absence of emerging threats to public health, such as waterborne viruses and genotoxicants. The purpose of this preliminary study was to evaluate the presence of material of enteroviruses (EV), rotavirus (RV) and adenovirus (AdV) and genotoxicity in water samples from points of routine monitoring of water quality in the main course of the Sinos River. The points are classified into different levels of pollution in accordance to the Brazilian federal regulations. Viral genomes from EV, AdV were detected in two of the 4 collection points regardless of the level of urbanisation of the surrounding areas. In contrast, genotoxicity was not observed in piava (Leporinus obtusidens) fingerlings cultivated on these same water samples. Results were compared with classical physical, chemical and microbiological parameters. There was no clear evidence of association between any of the classical markers and the presence of viral genomes in the water samples tested.(AU)

É amplamente reconhecido que os marcadores biológicos e químicos clássicos para a poluição ambiental não necessariamente indicam a presença ou ausência de ameaças emergentes à saúde pública, tais como vírus transmitidos pela água e genotoxicantes. Este estudo preliminar teve por objetivo detectar material genético de enterovírus (EV), rotavírus (RV) e adenovírus (AdV) e genotoxicidade em amostras de água de pontos de monitoramento de rotina da qualidade da água no curso principal do rio dos Sinos. Os pontos são classificados em níveis diferentes de poluição, de acordo com as normativas federais brasileiras. Genomas virais de EV, RV e RV foram detectados em dois dos quatro pontos de coleta, independente do nível de urbanização das áreas adjacentes. Por outro lado, não foi observada genotoxicidade em alevinos de piava (Leporinus obtusidens) cultivados nestas mesmas amostras de água. Os resultados são comparados com marcadores físicos, químicos e microbiológicos clássicos, não há nenhuma evidência clara da associação entre qualquer um dos marcadores clássicos e da presença de genomas virais nas amostras de água testadas.(AU)

Molecular analysis of NSP4 coding gene of porcine rotavirus in Brazil / Análise molecular do gene codificador da NSP4 de rotavírus suínos no Brasil

The non-structural protein 4 (NSP4) has different roles in rotaviral replication, morphogenesis, and enterotoxin-like activity causing secretory diarrhea. A total of 11 partial nucleotide sequences of NSP4 coding gene were defined from group A rotavirus circulating in Brazilian swine herds. On comparing the viral sequences of diarrheagenic peptide area (amino acid 114-135), there was a single point mutation at amino acid 135 presented by two strains with amino acid alanine, and valine in the others. The NSP4 gene phylogeny showed that all strains clustered into E1 genotype, and the nucleotide identity between Brazilian strains ranged from 92.4% and 100%, while the putative amino acid identity, between 95.8% and 100%. Only one site (138aa) was positively selected and at least 119 were negatively selected. As a conclusion, these data demonstrate the occurrence of a common NSP4 genotype described elsewhere in pigs and low diversity between the samples from the surveyed areas

A proteína não estrutural 4 (NSP4) desempenha diferentes funções na replicação e na morfogênese dos rotavírus, apresentando, ainda, uma atividade de enterotoxina, causando diarreia do tipo secretória. Um total de 11 sequências parciais de nucleotídeos do gene codificador da NSP4 de rotavírus suínos de criações brasileiras foram definidas como pertencentes ao grupo A. Comparando-se as sequências virais da área do peptídeo toxigênico, que compreende a porção entre os aminoácidos de 114 a 135, constatou-se uma única mutação pontual no aminoácido 135, sendo que duas amostras apresentaram alanina, e as demais, valina. A análise filogenética do gene demonstrou que todas as amostras pertencem ao genotipo E1, e que a identidade nucleotídica das amostras brasileiras variou de 92,4% a 100%, enquanto que a identidade de aminoácidos, de 95,8% a 100%. Apenas um resíduo (aa 138) sofreu seleção positiva enquanto que pelo menos outros 119 apresentam seleção negativa. Assim, esses dados mostram a ocorrência de um genotipo comum da NSP4 já descrito anteriormente em suínos, com uma baixa diversidade entre as amostras encontradas

Monitoring and molecular characterization of group Drotavirus in Brazilian poultry farms / Monitoramento e caracterização molecular de rotavírus do grupo D em criações comerciais brasileiras

Rotaviruses are etiological agents of diarrhea both in humans and in several animal species. Data on avian Group D rotaviruses (RVD) are scarce, especially in Brazil. We detected RVD in 4 pools of intestinal contents of broilers, layer and broiler breeders out of a total of 111 pools from 8 Brazilian states, representing an occurrence of 3.6%, by a specific RVD RT-PCR targeting the VP6 gene. Phylogenetic tree confirmed that the Brazilian strains belong to group D and 3 of the sequences were identical in terms of amino acid whereas one showed 99.5% identity with the others. The sequences described in this study are similar to other sequences previously detected in Brazil, confirming the conserved nature of the VP6 protein.(AU)

Rotavírus são agentes etiológicos de diarreia tanto em humanos como em várias espécies animais. Dados sobre rotavírus do grupo D (RVD) em aves são escassos, especialmente no Brasil. Nós detectamos RVD em 4 pools de conteúdo intestinal de frango de corte, poedeiras e matrizes de um total de 111 pools originários de 8 estados brasileiros, representando uma ocorrência de 3,6% a partir de uma RT-PCR específica para RVD, tendo como alvo o gene VP6. A árvore filogenética confirmou que as amostras brasileiras pertencem ao grupo D e três das sequências obtidas foram idênticas em termos de aminoácidos enquanto uma apresentou 99,5% de identidade com as demais. As sequências aqui definidas são semelhantes a outras sequências previamente definidas no Brasil, confirmando a natureza conservada da proteína VP6.(AU)

Development of a Real-time PCR test for porcine group A rotavirus diagnosis / Desenvolvimento de um teste de PCR em Tempo Real para o diagnóstico de rotavírus suínos do Grupo A

Group A Rotavirus (RVA) is one of the most common causes of diarrhea in humans and several animal species. A SYBR-Green Real-Time polymerase chain reaction (PCR) was developed to diagnose RVA from porcine fecal samples, targeting amplification of a 137-bp fragment of nonstructural protein 5 (NSP5) gene using mRNA of bovine NADH-desidrogenase-5 as exogenous internal control. Sixty-five samples were tested (25 tested positive for conventional PCR and genetic sequencing). The overall agreement (kappa) was 0.843, indicating 'very good' concordance between tests, presenting 100% of relative sensitivity (25+ Real Time PCR/25+ Conventional PCR) and 87.5% of relative sensitivity (35- Real Time PCR/40- Conventional PCR). The results also demonstrated high intra- and inter-assay reproducibility (coefficient of variation ≤1.42%); thus, this method proved to be a fast and sensitive approach for the diagnosis of RVA in pigs.(AU)

Rotavírus do grupo A (RVA) é uma das causas mais frequentes de diarreias em humanos e várias espécies animais. Um teste de PCR em Tempo Real com SYBR-Green foi desenvolvido visando o diagnóstico de RVA a partir de fezes suínas, através da amplificação de um fragmento de 137 pares de bases do gene da proteína não estrutural 5 (NSP5) viral e de mRNA de NADH-desidrogenase-5 bovina como controle interno exógeno. Foram testadas 65 amostras (25 delas positivas por PCR convencional e sequenciamento nucleotídico). A concordância entre os testes foi de 0,843, considerada "muito boa", apresentando 100% de sensibilidade relativa (25+ PCR Tempo Real/25+ PCR convencional) e 87,5% de sensibilidade relativa (35- PCR Tempo Real/40- PCR convencional). Os resultados também demonstraram elevada reprodutibilidade inter e intra-ensaio (coeficiente de variação ≤ 1,42%); portanto, este método demonstrou ser uma rápida e sensível alternativa para o diagnóstico de RVA em suínos.(AU)

Molecular analysis of NSP4 coding gene of porcine rotavirus in Brazil / Análise molecular do gene codificador da NSP4 de rotavírus suínos no Brasil

The non-structural protein 4 (NSP4) has different roles in rotaviral replication, morphogenesis, and enterotoxin-like activity causing secretory diarrhea. A total of 11 partial nucleotide sequences of NSP4 coding gene were defined from group A rotavirus circulating in Brazilian swine herds. On comparing the viral sequences of diarrheagenic peptide area (amino acid 114-135), there was a single point mutation at amino acid 135 presented by two strains with amino acid alanine, and valine in the others. The NSP4 gene phylogeny showed that all strains clustered into E1 genotype, and the nucleotide identity between Brazilian strains ranged from 92.4% and 100%, while the putative amino acid identity, between 95.8% and 100%. Only one site (138aa) was positively selected and at least 119 were negatively selected. As a conclusion, these data demonstrate the occurrence of a common NSP4 genotype described elsewhere in pigs and low diversity between the samples from the surveyed areas(AU)

A proteína não estrutural 4 (NSP4) desempenha diferentes funções na replicação e na morfogênese dos rotavírus, apresentando, ainda, uma atividade de enterotoxina, causando diarreia do tipo secretória. Um total de 11 sequências parciais de nucleotídeos do gene codificador da NSP4 de rotavírus suínos de criações brasileiras foram definidas como pertencentes ao grupo A. Comparando-se as sequências virais da área do peptídeo toxigênico, que compreende a porção entre os aminoácidos de 114 a 135, constatou-se uma única mutação pontual no aminoácido 135, sendo que duas amostras apresentaram alanina, e as demais, valina. A análise filogenética do gene demonstrou que todas as amostras pertencem ao genotipo E1, e que a identidade nucleotídica das amostras brasileiras variou de 92,4% a 100%, enquanto que a identidade de aminoácidos, de 95,8% a 100%. Apenas um resíduo (aa 138) sofreu seleção positiva enquanto que pelo menos outros 119 apresentam seleção negativa. Assim, esses dados mostram a ocorrência de um genotipo comum da NSP4 já descrito anteriormente em suínos, com uma baixa diversidade entre as amostras encontradas(AU)