Management of malaria in children with fever in rural Sierra Leone in relation to the 2014-2015 Ebola outbreak.

Setting: Sixty-eight primary health facilities, Koinadugu District, rural Sierra Leone. Objectives: Sierra Leone, a country with one of the highest burdens of malaria, was severely affected by the 2014-2015 Ebola virus disease outbreak. In under-five children, we compared trends in the completeness of malaria reports sent to the district office during the pre-Ebola, Ebola and post-Ebola periods, including the number of children with reported fever, malaria diagnostic testing performed and treatment for malaria initiated with artemisinin-based combination therapy (ACT). Design: A cross-sectional study. Results: Of 1904 expected malaria reports, 1289 (68%) were received. Completeness of reporting was 61% pre-Ebola, increased to 88% during the outbreak and dropped to 44% post-Ebola (P = 0.003). Total malaria testing (n = 105 558) exceeded the number of fever cases (n = 105 320). Pre-Ebola, 75% (n = 43 245) of all reported fever cases received malaria treatment, dropping to 34% (n = 50 453) during the Ebola outbreak. Of 36 804 confirmed malaria cases during Ebola, 17 438 (47%) were treated, significantly fewer than in the pre-Ebola period (96%, P < 0.001). Of the fever cases, 95% in both the pre- and post-Ebola periods received ACT, a rate that increased to 99% during the Ebola outbreak. Conclusion: Pre-existing gaps in malaria reporting worsened after the Ebola outbreak. Reassuringly, malaria testing matched fever cases, although only half of all confirmed cases received treatment during the outbreak, possibly explained by outbreak-related operational difficulties. These findings could be useful to guide health systems strengthening and recovery.

Contexte : Soixante-huit structures de soins de santé primaires, dans le district de Koinadugu, dans la Sierra Leone rurale.Objectifs : La Sierra Leone, un des pays les plus frappés par le paludisme, a été gravement affecté par la flambée épidémique d'Ebola en 2014­2015. Parmi les enfants âgés de <5 ans, nous avons comparé, dans les périodes avant, pendant et après Ebola, les tendances de l'exhaustivité des rapports relatifs au paludisme envoyés au bureau du district, le nombre d'enfants fébriles chez qui le test de diagnostic du paludisme a été réalisé et la prise en charge du paludisme par un traitement combiné à base d'artémisinine (TCA).Schéma : Etude transversale.Résultats : Sur 1904 rapports de paludisme attendus, 1289 (68%) ont été reçus. La complétude des rapports a été de 61% avant Ebola, a augmenté à 88% pendant Ebola et est tombée à 44% après Ebola (P = 0,003). Le nombre total de tests de paludisme (n = 105 558) a dépassé le nombre de cas de fièvre (n = 105 320). Avant Ebola, 75% de tous les cas de fièvre rapportés (n = 43 245) ont reçu un traitement du paludisme, nombre qui est tombé à 34% pendant Ebola (n = 50 453). Sur 36 804 cas de paludisme confirmés pendant Ebola, 17 438 (47%) ont été traités, significativement moins qu'avant Ebola (96% ; P < 0,001). Parmi les cas de fièvre, 95% ont reçu du TCA avant et après Ebola et jusqu'à 99% pendant Ebola.Conclusion : Les lacunes préexistantes en matière de rapports relatifs au paludisme se sont aggravées après Ebola. Il est rassurant de voir que les tests du paludisme sont restés parallèles aux cas de fièvre mais seulement la moitié de tous les cas confirmés a reçu un traitement pendant Ebola, ce qui peut être expliqué par des problèmes opérationnels liés à la flambée épidémique. Ces résultats pourraient être utiles pour guider le renforcement et la récupération des systèmes de santé.

Marco de referencia: Sesenta y ocho establecimientos de salud del distrito rural de Koinadugu en Sierra Leona.Objetivos: Sierra Leona es uno de los países con más alta carga de morbilidad por paludismo y sufrió una grave epidemia de enfermedad por el virus del Ébola en el 2014 y el 2015. Se compararon las tendencias en el carácter integral de los informes sobre el paludismo de los niños <5 años de edad enviados a la oficina distrital, antes, durante y después del brote; se analizaron las cifras de los informes con el número de casos de fiebre en los cuales se practicaron las pruebas diagnósticas de paludismo y de tratamientos combinados a base de artemisinina (TCA).Método: Une estudio transversal.Resultados: De las 1904 notificaciones de paludismo previstas, se recibieron 1289 (68%). La exhaustividad de los informes durante el período antes del brote del Ébola fue de 61%, aumentó a 88% durante el brote y disminuyó a 44% después del mismo (P = 0,003). El total de las pruebas diagnósticas de paludismo practicadas (n = 105 558) excedió el número disminuido de casos (n = 105 320). Durante el período anterior al brote, el 75% de todos los casos notificados de fiebre (n = 43 245) recibió tratamiento antipalúdico y esta cifra disminuyó al 34% durante el brote (n = 50 453). De los 36 804 casos confirmados de paludismo durante el brote, 17 438 (47%) recibieron tratamiento, lo cual representa una proporción significativamente inferior a la del período antes del brote (96%; P < 0,001). Del reducido número de casos, el 95% recibió TCA antes y después del brote y esta proporción alcanzó el 99% durante el brote epidémico.Conclusión: Las deficiencias prexistentes en la notificación del paludismo se agravaron después del brote epidémico del Ébola. Un dato alentador es que el número de pruebas diagnósticas realizadas fue equiparable al número reducido de casos notificados de paludismo, pero solo la mitad de todos los casos confirmados recibieron tratamiento durante el brote del Ébola, probablemente por causa de dificultades operativas relacionadas la epidemia. Estos resultados pueden ser útiles a fin de orientar el fortalecimiento y la reactivación de los sistemas de salud.

The Ebola outbreak and staffing in public health facilities in rural Sierra Leone: who is left to do the job?

Setting: The 82 public health facilities of rural Kailahun District, Sierra Leone. Objective: The 2014-2015 Ebola virus disease outbreak in Sierra Leone led the Ministry of Health and Sanitation and stakeholders to set minimum standards of staffing (medical/non-medical) for a basic package of essential health services (BPEHS). No district-level information exists on staffing levels in relation to the Ebola outbreak. We examined the staffing levels before the Ebola outbreak, during the last month of the outbreak and 4 months after the outbreak, as well as Ebola-related deaths among health care workers (HCWs). Design: This was a retrospective cross-sectional study. Results: Of 805 recommended medical staff (the minimum requirement for 82 health facilities), there were deficits of 539 (67%) pre-Ebola, 528 (65%) during the Ebola outbreak and 501 (62%) post-Ebola, hovering at staff shortages of >50% at all levels of health facilities. Of the 569 requisite non-medical staff, the gap remained consistent, at 92%, in the three time periods. Of the 1374 overall HCWs recommended by the BPEHS, the current staff shortage is 1026 (75%). Of 321 facility-based HCWs present during Ebola, there were 15 (14 medical and one non-medical staff) Ebola-related and three non-Ebola related deaths among HCWs. Conclusion: The post-Ebola health-related human resource deficit is alarmingly high, with very few staff available to work. We call for urgent political will, resources and international collaboration to address this situation.

Contexte : Les 82 structures de santé publiques dans le district rural de Kailahun, Sierra Leone.Objectif : La flambée d'Ebola en 2014­2015 en Sierra Leone a amené le Ministère de la santé avec ses partenaires à établir des normes minimales de personnel (médical/non médical) pour les services de santé de base essentiels (BPEHS). Il n'existe pas d'informations relatives aux taux de personnel dans les districts par rapport la flambée d'Ebola. Nous avons examiné les taux de personnel avant la flambée, pendant le dernier mois de la flambée et 4 mois après Ebola, ainsi que les décès des travailleurs de santé liés à Ebola.Schéma : Une étude rétrospective transversale.Résultats : Sur 805 travailleurs de santé recommandés (le nombre minimum requis pour 82 structures de santé), les déficits ont été de 539 (67%) pré Ebola, de 528 (65%) pendant Ebola et de 501 (62%) post Ebola et sont restés au-dessus de 50% à tous les niveaux des structures de santé. Sur 569 membres du personnel non médical requis, le déficit est resté régulièrement à 92% aux trois moments mesurés. Sur 1374 travailleurs de santé recommandés au total par BPEHS, le déficit de personnel actuel est de 1026 (75%). Sur 321 travailleurs de santé basés dans des structures de santé et présents pendant Ebola, il y a eu 15 décès liés à Ebola (14 travailleurs médicaux et un travailleur non-médical) et trois décès sans relation avec Ebola parmi le personnel de santé.Conclusion : Les déficits en ressources humaines liées à la santé après Ebola sont alarmants, avec très peu de personnel restant. Nous appelons en urgence une volonté politique, la mobilisation de ressources et une aide internationale pour faire face à cette situation.

Marco de referencia: Ochenta y dos establecimientos de atención de salud en el distrito rural de Kailahun en Sierra Leona.Objetivo: Como respuesta a la epidemia de fiebre hemorrágica del Ébola en Sierra Leona en el 2014 y el 2015, el Ministerio de Salud y Saneamiento en asociación con las partes interesadas elaboraron un conjunto de normas mínimas sobre la dotación de personal (médico y paramédico), destinado a la prestación de servicios básicos de salud. No existe información a escala distrital sobre el nivel de dotación de personal relacionado con la epidemia del Ébola. En el presente estudio, se examinaron los recursos de personal existentes antes de la epidemia, durante el último mes del brote y 4 meses después; se analizaron además las defunciones de profesionales de salud causadas por esta epidemia.Método: Un estudio transversal retrospectivo.Resultados: De los 805 miembros recomendados en la plantilla de personal médico (requisito mínimo para 82 establecimientos), se observó un déficit de 539 personas antes de la epidemia (67%), 528 durante la misma (65%) y 501 después del fin del brote epidémico (62%); la deficiencia fue superior al 50% en todos los niveles de los establecimientos sanitarios. Con relación a los 569 profesionales necesarios, diferentes del personal médico, se observó una deficiencia constante de 92% en los tres momentos del análisis. En general, de los 1374 profesionales de salud recomendados para prestar los servicios básicos de salud, la carencia actual es de 1026 personas (75%). En los 321 profesionales que trabajaban en los establecimientos de salud durante el brote, ocurrieron 15 defunciones causadas por la epidemia (14 miembros del personal médico y un miembro de otra categoría) y tres defunciones independientes de la misma.Conclusión: La deficiencia en la dotación de recursos humanos para la atención de salud después de la epidemia del Ébola es alarmante, pues son muy escasas las personas que cumplen hoy esta función. Se hace un llamado urgente a la voluntad política, la movilización de recursos y la ayuda internacional a fin de corregir la situación actual.

Knockdown and recovery of malaria diagnosis and treatment in Liberia during and after the 2014 Ebola outbreak.

Setting: The malaria-endemic country of Liberia, before, during and after the 2014 Ebola outbreak. Objective: To describe the consequences of the Ebola outbreak on Liberia's National Malaria Programme and its post-Ebola recovery. Design: A retrospective cross-sectional study using routine countrywide programme data. Results: Malaria caseloads decreased by 47% during the Ebola outbreak and by 11% after, compared to the pre-Ebola period. In those counties most affected by Ebola, a caseload reduction of >20% was sustained for 12 consecutive months, while this lasted for only 4 consecutive months in the counties least affected by Ebola. Linear regression of monthly proportions of confirmed malaria cases-as a proxy indicator of programme performance-over the pre- and post-Ebola periods indicated that the malaria programme could require 26 months after the end of the acute phase of the Ebola outbreak to recover to pre-Ebola levels. Conclusions: The differential persistence of reduced caseloads in the least- and most-affected counties, all of which experienced similar emergency measures, suggest that factors other than Ebola-related security measures played a key role in the programme's reduced performance. Clear guidance on when to abandon the emergency measures after an outbreak may be needed to ensure faster recovery of malaria programme performance.

Contexte : Le Liberia, pays d'endémie palustre, avant, pendant et après l'épidémie d'Ebola de 2014.Objectif : Décrire les conséquences de l'épidémie d'Ebola sur le programme national de lutte contre le paludisme et sa récupération après Ebola.Schéma : Étude rétrospective transversale utilisant des données de routine du programme dans tout le pays.Résultats : Le nombre de cas de paludisme déclarés a baissé de 47% pendant et de 11% après l'épidémie d'Ebola, comparé à la période pré-Ebola. Dans les comtés les plus affectés par Ebola, une réduction de plus de 20% a été maintenue pendant plus de 12 mois consécutifs, tandis que celle-ci n'a duré que pendant 4 mois consécutifs dans les comtés les moins affectés par Ebola. Une régression linéaire des proportions mensuelles de cas de paludisme confirmés­comme indicateur indirect de la performance du programme­sur les périodes pré- et post-Ebola a montré que le programme paludisme pourrait avoir besoin de 26 mois après la fin de la phase aiguë de l'épidémie d'Ebola pour revenir aux niveaux d'avant Ebola.Conclusion: La persistance différentielle de réduction des cas déclarés dans les comtés les moins et les plus affectés, qui ont tous expérimenté des mesures d'urgence similaires, suggère que des facteurs autres que les mesures de sécurité liées à Ebola ont joué des rôles clés dans la réduction de la performance du programme. Des recommandations claires sur le moment auquel il faut abandonner les mesures d'urgence après une flambée pourraient être nécessaires pour assurer une récupération plus rapide de la performance du programme.

Marco de referencia: El país de Liberia, con una situación endémica de paludismo, antes de la epidemia de fiebre hemorrágica del Ébola, durante el brote y después del mismo en el 2014.Objetivos: Describir las consecuencias del brote epidémico del Ébola sobre el programa nacional contra el paludismo y su recuperación después de la epidemia.Método: Fue este un estudio transversal retrospectivo a partir de los datos corrientes del programa en todo el país.Resultados: La carga de morbilidad por paludismo disminuyó un 47% durante la epidemia y un 11% después de la misma, en comparación con el período anterior. En las provincias más afectadas por el brote se observó una disminución constante de más del 20% durante 12 meses consecutivos, comparada con 4 meses en las provincias menos afectadas. La regresión lineal de la proporción mensual de casos confirmados de paludismo, utilizada como indicador indirecto del desempeño del programa durante los períodos anterior y posterior a la epidemia del Ébola, puso de manifiesto que el programa precisó 26 meses después del final de la fase aguda de la epidemia hasta recuperar su nivel de desempeño anterior al brote.Conclusiones: La recuperación diferencial de la notificación en las provincias menos afectadas y las más afectadas por la epidemia, pese a que en todas las regiones se ejecutaron intervenciones de emergencia equivalentes, indica que factores diferentes a las medidas de seguridad desencadenadas por la epidemia influyeron de manera importante en la disminución del desempeño del programa. Se precisan orientaciones claras con respecto al momento más oportuno para interrumpir las intervenciones de emergencia después de los brotes epidémicos, con el propósito de facilitar una recuperación más rápida del funcionamiento del programa contra el paludismo.

The use of a double subgenomic Sindbis virus expression system to study mosquito gene function: effects of antisense nucleotide number and duration of viral infection on gene silencing efficiency.

Recently we established a simple, effective antisense strategy using a double subgenomic Sindbis (dsSIN) virus expression system to study gene function in mosquitoes. In this study, we further elucidate the effects of antisense nucleotide number and duration of viral infection on mosquito gene silencing efficiency by the dsSIN virus expression system. Over 15 days post virus infection, the degree of parasite melanization was progressively reduced by more than 95%, 75% and 55% in the mosquito Armigeres subalbatus transduced with 600, 147 or 36 bases antisense RNA, targeted to the highly conserved copper binding region of the Ar. subalbatus prophenoloxidase I gene (As-pro-POI), respectively. As the duration of viral infection increased from day 3-15, the degree of parasite melanization progressively decreased in all mosquitoes transduced with antisense RNA, irrespective of the lengths of antisense RNA. Progressive loss of parasite melanization function was found to correlate with down regulation of As-pro-PO expression at both the mRNA and protein activity levels, and reductions in virus titres in mosquitoes transduced with antisense RNA. A small pro-PO RNA (c. twenty-five nucleotides) was identified in mosquitoes transduced with antisense RNA. These data suggest that As-pro-POI gene expression is knocked down by degrading the As-pro-POI mRNA through the RNAi pathway. In conclusion, our study demonstrates that even a short antisense RNA (thirty-six bases) can cause silencing of the As-pro-POI gene, and the effects of endogenous gene silencing by dsSIN expression system on mosquito gene functions can be accumulative.