Gut virome-wide association analysis identifies cross-population viral signatures for inflammatory bowel disease.

BACKGROUND: The gut virome has been implicated in inflammatory bowel disease (IBD), yet a full understanding of the gut virome in IBD patients, especially across diverse geographic populations, is lacking. RESULTS: In this study, we conducted a comprehensive gut virome-wide association study in a Chinese cohort of 71 IBD patients (15 with Crohn's disease and 56 with ulcerative colitis) and 77 healthy controls via viral-like particle (VLP) and bulk virome sequencing of their feces. By utilizing an integrated gut virus catalog tailored to the IBD virome, we revealed fundamental alterations in the gut virome in IBD patients. These characterized 139 differentially abundant viral signatures, including elevated phages predicted to infect Escherichia, Klebsiella, Enterococcus_B, Streptococcus, and Veillonella species, as well as IBD-depleted phages targeting Prevotella, Ruminococcus_E, Bifidobacterium, and Blautia species. Remarkably, these viral signatures demonstrated high consistency across diverse populations such as those in Europe and the USA, emphasizing their significance and broad relevance in the disease context. Furthermore, fecal virome transplantation experiments verified that the colonization of these IBD-characterized viruses can modulate experimental colitis in mouse models. CONCLUSIONS: Building upon these insights into the IBD gut virome, we identified potential biomarkers for prognosis and therapy in IBD patients, laying the foundation for further exploration of viromes in related conditions. Video Abstract.

Immunosuppression for inflammatory bowel disease does not influence Epstein-Barr viral load in the short-term / La inmunosupresión no modifica la carga viral del virus de Epstein-Barr a corto plazo en los pacientes con enfermedad inflamatoria intestinal

Introduction: Immunomodulators and biologics are two of the main drugs used for the treatment of inflammatory bowel disease (IBD). Some of these agents have been associated with certain infections and lymphoproliferative disorders, including Epstein-Barr virus (EBV) infection. Our aim was to determine the influence of immunosuppression in the EBV viral load in patients with IBD. Materials and methods: We prospectively included naïve patients with IBD who were starting immunosuppressive therapy in four IBD Units. All patients were assessed at baseline and four months after starting immunosuppression for clinical disease activity, biomarkers, EBV serology (IgM VCA, IgG VCA and IgG EBNA) and viral load. Results: Thirty-two patients were included. At baseline, all patients showed positive results for IgG VCA or IgG EBNA with undetectable EBV viral load. No patient showed detectable EBV viral load after starting the immunosuppressive therapy. Conclusion: Immunosuppression did not influence on EBV viral load in the short-term in naïve IBD patients

Introducción: Los fármacos inmunomoduladores y biológicos son algunos de los tratamientos usados con más frecuencia en la enfermedad inflamatoria intestinal (EII). Algunos de ellos se han relacionado con un mayor riesgo de infecciones o síndromes linfoproliferativos, entre los que se encuentra el virus de Epstein-Barr (VEB). Nuestro objetivo era determinar la influencia a corto plazo de la inmunosupresión sobre la carga viral en pacientes con EII. Material y métodos: Incluimos de forma prospectiva pacientes con EII en los que se iniciaba algún tratamiento inmunosupresor en 4 hospitales. Todos los pacientes fueron evaluados en el momento de iniciar el tratamiento y 4 meses después de iniciarlo, mediante la actividad clínica, los biomarcadores, la serología del VEB (IgM VCA, IgG VCA e IgG EBNA) y su carga viral. Resultados: Se incluyeron 32 pacientes, observando en todos ellos una serología positiva para IgG VCA o IgG EBNA, con una carga viral indetectable. No se observó ninguna muestra con carga viral detectable durante el seguimiento. Conclusión: La inmunosupresión no influye sobre la carga viral del VEB a corto plazo en pacientes con EII

Citomegalovirus en enfermedad inflamatoria intestinal / Cytomegolavirus in inflammatory bowel disease

Cytomegalovirus (CMV) gastrointestinal infection in inflammatory bowel disease (IBD) is a diagnostic challenge with close relationship with clinical course and treatment response. This article summarizes biology, pathology, clinical manifestation and diagnosis of CMV disease and especially in IBD.

La infección gastrointestinal por citomegalovirus (CMV) en paciente con enfermedad inflamatoria intestinal (EII) constituye un desafío diagnóstico importante y se encuentra íntimamente relacionada con la evolución y respuesta a tratamiento de la EII. El presente artículo resume las características biológicas del CMV, sus características patogénicas, sus manifestaciones clínicas y sus métodos diagnósticos. Se expone con mayor detalle la implicancia de esta infección en pacientes portadores con EII y su enfrentamiento clínico.

Similaridades clinicopatológicas entre paratuberculosis y enfermedad de crohn: ¿posible vínculo zoonótico? / Clinical and pathological similarities between paratuberculosis and crohn’s disease: ¿a possible zoonotic link?

EL artículo presenta a la luz de la literatura científica actual la asociación del Mycobacterium avium subespecie paratuberculosis con la enfermedad de Crohn, las principales similaridades clinicopatológicas. La revisión se limitó a las publicaciones contenidas en el programa HINARI de la WHO, en especial de Elservier Science, Bioline Internacional, Blackwell Publishing, BMJ Publishing, Lippincott Williams & Wilkins, Nature Publishing, PubMed, Springer Science y publicaciones de la Asociación Internacional para estudio de Paratuberculosis. Evidencias significativas apoyan un posible vinculo zoonótico entre las enfermedades. El aislamiento del Mycobacterium avium subespecie paratuberculosis en pacientes con enfermedad de Crohn desde muestras de intestino, leche, sangre periférica y nódulos linfáticos; de igual manera la respuesta inmune especifica a algunos antígenos de Mycobacterium en pacientes con la enfermedad; aunque estos hallazgos tienen cada uno sus propias controversias. La evidencia actualmente disponible no es suficiente para validar o negar al Mycobacterium avium subespecie paratuberculosis como agente causal de por lo menos algunos casos de enfermedad de Crohn. Los estudios son inconclusos en aceptar un vinculo zoonótico dada la naturaleza multifactorial de esta enfermedad. Se requieren estudios para determinar sí Mycobacterium es un agente espectador ó patogénico; paralelamente realizar estudios epidemiológicos a gran escala que permitan analizar la distribución geográfica y temporal de ambas enfermedades.

Pesquisaje de AGSHB y de anti-HVC en pacientes con enfermedad inflamatoria intestinal crónica / AgsHB and anti-HCV screening in patients with chronic inflammatory bowel disease

Se decide realizar un pesquisaje de AgsHB y anti-HVC en pacientes que padecen enfermedad inflamatoria intestinal crónica (EIIC) debido a que se ha producido un aumento en la frecuencia de presentación de esta afección. Se les realizó estos marcadores virales a 50 pacientes adultos de ambos sexos que sufren de EIIC, que acudieron a consulta externa en nuestro centro durante el año 1995, los datos se recogen mediante un modelo de encuesta. Se observó que el 10 por ciento del grupo estudiado presentó marcadores virales positivos; todos los pacientes tenían más de 5 años de evolución, habían recibido más de 2 transfusiones y sufrido varias intervenciones, 2 pacientes fallecieron, uno por cirrosis hepática y el otro por hepatonecrosis, creemos que debe establecerse un pesquisaje sistemático en estos pacientes

Pesquisaje de AGSHB y de anti-HVC en pacientes con enfermedad inflamatoria intestinal crónica / AgsHB and anti-HCV screening in patients with chronic inflammatory bowel disease

Se decide realizar un pesquisaje de AgsHB y anti-HVC en pacientes que padecen enfermedad inflamatoria intestinal crónica (EIIC) debido a que se ha producido un aumento en la frecuencia de presentación de esta afección. Se les realizó estos marcadores virales a 50 pacientes adultos de ambos sexos que sufren de EIIC, que acudieron a consulta externa en nuestro centro durante el año 1995, los datos se recogen mediante un modelo de encuesta. Se observó que el 10 por ciento del grupo estudiado presentó marcadores virales positivos; todos los pacientes tenían más de 5 años de evolución, habían recibido más de 2 transfusiones y sufrido varias intervenciones, 2 pacientes fallecieron, uno por cirrosis hepática y el otro por hepatonecrosis, creemos que debe establecerse un pesquisaje sistemático en estos pacientes(AU)