Detalhe da pesquisa
1.
BioModels-15 years of sharing computational models in life science.
Nucleic Acids Res
; 48(D1): D407-D415, 2020 01 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31701150
2.
Harmonizing semantic annotations for computational models in biology.
Brief Bioinform
; 20(2): 540-550, 2019 03 22.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30462164
3.
MOCCASIN: converting MATLAB ODE models to SBML.
Bioinformatics
; 32(12): 1905-6, 2016 06 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26861819
4.
BioModels: ten-year anniversary.
Nucleic Acids Res
; 43(Database issue): D542-8, 2015 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25414348
5.
JSBML 1.0: providing a smorgasbord of options to encode systems biology models.
Bioinformatics
; 31(20): 3383-6, 2015 Oct 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26079347
6.
COMBINE archive and OMEX format: one file to share all information to reproduce a modeling project.
BMC Bioinformatics
; 15: 369, 2014 Dec 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25494900
7.
Specifications of standards in systems and synthetic biology: status and developments in 2022 and the COMBINE meeting 2022.
J Integr Bioinform
; 20(1)2023 Mar 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36989443
8.
JSBML: a flexible Java library for working with SBML.
Bioinformatics
; 27(15): 2167-8, 2011 Aug 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21697129
9.
Controlled vocabularies and semantics in systems biology.
Mol Syst Biol
; 7: 543, 2011 Oct 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22027554
10.
Nine best practices for research software registries and repositories.
PeerJ Comput Sci
; 8: e1023, 2022.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36092012
11.
Do genome-scale models need exact solvers or clearer standards?
Mol Syst Biol
; 11(10): 831, 2015 Oct 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26467284
12.
Software that goes with the flow in systems biology.
BMC Biol
; 8: 140, 2010 Nov 29.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21114874
13.
Specifications of standards in systems and synthetic biology: status and developments in 2021.
J Integr Bioinform
; 18(3)2021 Oct 22.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34674411
14.
SBML2L(A)T(E)X: conversion of SBML files into human-readable reports.
Bioinformatics
; 25(11): 1455-6, 2009 Jun 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-19307240
15.
Specifications of standards in systems and synthetic biology: status and developments in 2020.
J Integr Bioinform
; 17(2-3)2020 Jun 29.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32598316
16.
Systems Biology Markup Language (SBML) Level 3 Package: Distributions, Version 1, Release 1.
J Integr Bioinform
; 17(2-3)2020 Jul 20.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32750035
17.
Systems biology markup language (SBML) level 3 package: multistate, multicomponent and multicompartment species, version 1, release 2.
J Integr Bioinform
; 17(2-3)2020 Jul 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32628633
18.
The first 10 years of the international coordination network for standards in systems and synthetic biology (COMBINE).
J Integr Bioinform
; 17(2-3)2020 Jun 29.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32598315
19.
LibSBML: an API library for SBML.
Bioinformatics
; 24(6): 880-1, 2008 Mar 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-18252737
20.
Data Management in Computational Systems Biology: Exploring Standards, Tools, Databases, and Packaging Best Practices.
Methods Mol Biol
; 2049: 285-314, 2019.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31602618